EBV感染が誘導するエピゲノム改変・維持に関わる因子の同定とその機能解析
| Project/Area Number |
16K08729
|
|---|
| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
|
| Allocation Type | Multi-year Fund |
|---|
| Section | 一般 |
|---|
| Research Field |
Experimental pathology
|
|---|
| Research Institution | Chiba University |
|---|
Principal Investigator |
松坂 恵介 千葉大学, 大学院医学研究院, 講師 (40610150)
|
|---|
| Project Period (FY) |
2016-04-01 – 2019-03-31
|
| Project Status |
Granted (Fiscal Year 2017)
|
| Budget Amount *help |
¥4,810,000 (Direct Cost: ¥3,700,000、Indirect Cost: ¥1,110,000)
Fiscal Year 2018: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000)
Fiscal Year 2017: ¥1,820,000 (Direct Cost: ¥1,400,000、Indirect Cost: ¥420,000)
Fiscal Year 2016: ¥1,820,000 (Direct Cost: ¥1,400,000、Indirect Cost: ¥420,000)
|
|---|
| Keywords | エピジェネティクス / DNAメチル化 / ウイルス / 胃癌 / EBV |
|---|
| Outline of Annual Research Achievements |
本研究は胃癌を対象にEpstein-Barrウイルス(EBV)感染が誘導するゲノムワイドなエピゲノム改変に関わる因子の同定と、EBV感染脱落系を用いたエピゲノム維持機構の解明を目的としている。先行研究により、EBVの潜伏感染を伴う胃癌(EBV陽性胃癌)がゲノムワイドにDNAメチル化の亢進した超高DNAメチル化形質を示し、さらにEBV感染により宿主細胞に新規DNAメチル化が誘導されEBV感染そのものが超高DNAメチル化形質の原因であること証明してきた。胃癌細胞株MKN7と正常胃粘膜上皮由来細胞株GES1において感染早期における新規DNAメチル化形質誘導パターンを経時的に解析した結果、宿主細胞のDNAメチル化誘導に先駆けてウイルスゲノムDNAにメチル化が誘導されることを見いだし、その成果を報告した(申請者ら、J Pathol. 2017)。さらに新規にDNAメチル化が誘導される時相におけるウイルスと宿主細胞両者の遺伝子発現を包括的に解析中であり、DNAメチル化誘導候補因子に対するshRNAの構築を計画中である。また、変異型EBNA1を用いた実験系によりEBV脱落細胞の作製を遂行中であり、脱落後の細胞に脱メチル化剤やDNMTのknockdown、TETの強制発現系などを作用させることで、EBV感染がDNAメチル化の維持に果たす役割を解析する予定である。このようにウイルスと宿主との間の秩序だった相互作用をより詳細に解析することで、新規DNAメチル化のメカニズムの解明が期待される。
|
| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
EBV感染脱落効率化の検討でやや時間がかかっているが、効率的な脱落系の目処が立ったところで、これから実践に移行する予定である。
|
| Strategy for Future Research Activity |
単純な変異型EBNA1による系では十分な脱落効率が得られない可能性が高く、より高い効率で脱落が得られる系の検討が必要である。また、preliminaryなデータから、EBV感染初期におけるウイルス遺伝子発現は予想よりも多数に及んでいることが予想され、ウイルス遺伝子に対するshRNAによるknockdownの標的はより包括的に展開する必要がある。
|
Report
(2 results)
Research Products
(16 results)
-
-
-
[Journal Article] Frequent promoter hypermethylation associated with human papillomavirus infection in pharyngeal cancer2017
Author(s)
Nakagawa T, Matsusaka K, Misawa K, Ota S, Takane K, Fukuyo M, Rahmutulla B, Shinohara K, Kunii N, Sakurai D, Hanazawa T, Matsubara H, Nakatani Y, Okamoto Y, Kaneda A.
-
Journal Title
Cancer Letter
Volume: 407
Pages: 21-31
DOI
Related Report
Peer Reviewed / Open Access
-
-
-
[Journal Article] Tumor Content Chart-Assisted HER2/CEP17 Digital PCR Analysis of Gastric Cancer Biopsy Specimens2016
Author(s)
Matsusaka K, Ishikawa S, Nakayama A, Ushiku T, Nishimoto A, Urabe M, Kaneko N, Kunita A, Kaneda A, Aburatani H, Fujishiro M, Seto Y, Fukayama M.
-
Journal Title
DOI
Related Report
Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
-
[Journal Article] Two subtypes of colorectal tumor with distinct molecular features in familial adenomatous polyposis2016
Author(s)
Matsusaka K, Ushiku T, Urabe M, Fukuyo M, Abe H, Ishikawa S, Seto Y, Aburatani H, Hamakubo T, Kaneda A, Fukayama M.
-
Journal Title
Oncotarget.
Volume: 7
Pages: 64168-64181
DOI
Related Report
Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
-
[Journal Article] Coupling CDH17 and CLDN18 Markers for Comprehensive Membrane-targeted Detection of Human Gastric Cancer.2016
Author(s)
K. Matsusaka, T. Ushiku, M. Urabe, M. Fukuyo, H. Abe, S. Ishikawa, Y. Seto, H. Aburatani, T. Hamakubo, A. Kaneda, M. Fukayama
-
Journal Title
Oncotarget,
Volume: 7
Pages: 64168-64181
DOI
Related Report
Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
-
-
-
-
-
-
-
-
