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Development of recurrence risk prediction model 95-gene classifier and its application to formalin-fixed paraffin-embedded tissues.

Research Project

Project/Area Number 16K10456
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Research Field General surgery
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

Naoi Yasuto  大阪大学, 医学系研究科, 助教 (30646211)

Project Period (FY) 2016-04-01 – 2019-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2018)
Budget Amount *help
¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000)
Fiscal Year 2018: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Fiscal Year 2017: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Fiscal Year 2016: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Keywords乳癌 / マイクロアレイ / 再発予測 / 多遺伝子アッセイ / FFPE / 網羅的遺伝子発現解析 / RNA
Outline of Final Research Achievements

We previously developed a 95-gene classifier (95GC) to classify ER-positive, HER2-negative, and node-negative breast cancers as high and low-risk groups. Although the 95GC was originally developed using fresh-frozen (FF) tissues, we aimed to apply this to formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) tissues.
As the result, 95GC Recurrence Score was well correlated (R = 0.92) with FF and FFPE tissues, and the concordance rate (94.6%) of high- and low-risk groups was also considerably high. Our 95GC was applicable to FFPE tissues with a high concordance rate with FF tissues.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

本研究では、Curebest 95GCをホルマリン固定パラフィン包埋組織検体(以下、FFPE検体)にも応用可能なように改良した。本研究により95GCはFFPEに適応拡大することに成功し、2019年現在多数の病院施設からのFFPE検体を受け付けている。この事で、より多数の乳癌患者を対象に再発予後予測を施行し、癌個別化医療を実現する事ができた。またFFPE検体を多く有する米国4施設において、95GC性能検証研究を進め、良好な成績を得る事ができた。

Report

(4 results)
  • 2018 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2017 Research-status Report
  • 2016 Research-status Report
  • Research Products

    (15 results)

All 2018 2017 2016

All Journal Article (2 results) Presentation (13 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 5 results)

  • [Journal Article] Curebest 95GC -日本で開発された多遺伝子発現解析-2017

    • Author(s)
      直居 靖人
    • Journal Title

      Current Therapy

      Volume: Vol.35, No.9

    • Related Report
      2017 Research-status Report
  • [Journal Article] 多重遺伝子診断法の開発と臨床応用2017

    • Author(s)
      直居 靖人
    • Journal Title

      日本臨床

      Volume: 75巻 増刊号3

    • Related Report
      2017 Research-status Report
  • [Presentation] Curebest 95GCを用いた乳癌再発予後予測2018

    • Author(s)
      直居靖人
    • Organizer
      日本乳癌学会シンポジウム
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
  • [Presentation] 多重遺伝子診断法の開発と臨床応用2017

    • Author(s)
      直居 靖人
    • Organizer
      第64回 日本臨床検査医学会学術集会 ランチョンセミナー
    • Related Report
      2017 Research-status Report
  • [Presentation] 多重遺伝子診断法の開発と臨床応用2017

    • Author(s)
      直居 靖人
    • Organizer
      日本癌治療学会2017 学術セミナー
    • Related Report
      2017 Research-status Report
  • [Presentation] 多重遺伝子診断法の開発と臨床応用2017

    • Author(s)
      直居 靖人
    • Organizer
      乳癌学会中部地方会2017 ランチョンセミナー
    • Related Report
      2017 Research-status Report
  • [Presentation] 多重遺伝子診断法の開発と臨床応用2017

    • Author(s)
      直居 靖人
    • Organizer
      第73回 京滋乳癌研究会 特別講演
    • Related Report
      2017 Research-status Report
  • [Presentation] 多重遺伝子診断法の開発と臨床応用2017

    • Author(s)
      直居 靖人
    • Organizer
      乳癌最新情報カンファレンス2017 特別講演
    • Related Report
      2017 Research-status Report
  • [Presentation] 多重遺伝子診断法の開発と臨床応用2017

    • Author(s)
      直居 靖人
    • Organizer
      日本乳癌学会学術総会2017 プレジデンシャルシンポジウム
    • Related Report
      2017 Research-status Report
  • [Presentation] 多重遺伝子診断法の開発と臨床応用2017

    • Author(s)
      直居 靖人
    • Organizer
      第15回 日本臨床腫瘍学会学術集会 WS
    • Related Report
      2017 Research-status Report
    • Invited
  • [Presentation] 多重遺伝子診断法の開発と臨床応用2017

    • Author(s)
      直居 靖人
    • Organizer
      23th. Asia pacific cancer conference (APCC), symposium in Seoul
    • Related Report
      2017 Research-status Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 多重遺伝子診断法の開発と臨床応用2017

    • Author(s)
      直居 靖人
    • Organizer
      日本乳癌学会九州地方会2017 ランチョンセミナー
    • Related Report
      2017 Research-status Report
    • Invited
  • [Presentation] 多重遺伝子診断法の開発と臨床応用2017

    • Author(s)
      直居 靖人
    • Organizer
      がんと生殖に関するシンポジウム2017 ランチョンセミナー
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      2017 Research-status Report
    • Invited
  • [Presentation] 多遺伝子アッセイの開発と乳癌臨床応用2016

    • Author(s)
      直居靖人
    • Organizer
      日本乳癌学会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2016-06-22
    • Related Report
      2016 Research-status Report
  • [Presentation] Curebest 95GCによる乳癌再発予後予測2016

    • Author(s)
      直居靖人
    • Organizer
      日本臨床腫瘍学会
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      2016-06-14
    • Related Report
      2016 Research-status Report
    • Invited

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Published: 2016-04-21   Modified: 2020-03-30  

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