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Fluctuation-induced robust information coding, learned from neuron

Research Project

Project/Area Number 16K12508
Research Category

Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research

Allocation TypeMulti-year Fund
Research Field Kansei informatics
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

Masashi Fujii  東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 助教 (30725750)

Research Collaborator Tottori Takehiro  
Fujita Suguru  
Kuroda Shinya  
Project Period (FY) 2016-04-01 – 2019-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2018)
Budget Amount *help
¥3,380,000 (Direct Cost: ¥2,600,000、Indirect Cost: ¥780,000)
Fiscal Year 2018: ¥650,000 (Direct Cost: ¥500,000、Indirect Cost: ¥150,000)
Fiscal Year 2017: ¥650,000 (Direct Cost: ¥500,000、Indirect Cost: ¥150,000)
Fiscal Year 2016: ¥2,080,000 (Direct Cost: ¥1,600,000、Indirect Cost: ¥480,000)
Keywords情報伝達 / small-volume effect / robustness / sensitivity / efficiency / 分子数少数性 / 神経科学 / 情報システム / シミュレーション
Outline of Final Research Achievements

Spine, which is a place to exchange information of nerve cells, is very small (1 fL). Therefore, the chemical reaction becomes stochastic and the response to the input varies. Such variations seemingly disadvantageous to information transfer. So, is there any advantage to transfer the information in such a small place? In this project, using the analysis using stochastic simulation and Shannon's information theory, we reveals that information transfer in a small field can provide robustness against input intensity fluctuation. Furthermore, we also found that this robustness is universal under certain conditions.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

本研究による成果は、小さな細胞を基本単位とする生物において、小ささの利点を情報伝達という観点から解き明かしたものであり、今後様々な生物システムの情報伝達のメカニズム解明の足がかりになると考える。また、生物システムにおけるゆらぎを利用した情報伝達の利点は、従来のノイズを極力減らそうとする人工的な通信システムとは全く逆の戦略であると考えられる。このようなゆらぎを利用した通信システムによって、より頑健で、省エネルギーの通信システムへのブレイクスルーになると期待できる。

Report

(4 results)
  • 2018 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2017 Research-status Report
  • 2016 Research-status Report
  • Research Products

    (38 results)

All 2019 2018 2017 2016 Other

All Journal Article (7 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Peer Reviewed: 7 results,  Open Access: 5 results,  Acknowledgement Compliant: 1 results) Presentation (28 results) (of which Invited: 3 results) Remarks (3 results)

  • [Journal Article] NMDAR-mediated Ca2+ increase shows robust information transfer in dendritic spines2019

    • Author(s)
      Tottori Takehiro、Fujii Masashi、Kuroda Shinya
    • Journal Title

      Biophysical Journal

      Volume: 印刷中 Issue: 9 Pages: 1748-1758

    • DOI

      10.1016/j.bpj.2019.03.030

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      Kawata Kentaro、Yugi Katsuyuki、Hatano Atsushi、Kokaji Toshiya、Tomizawa Yoko、Fujii Masashi、Uda Shinsuke、Kubota Hiroyuki、Matsumoto Masaki、Nakayama Keiichi I.、Kuroda Shinya
    • Journal Title

      Genes to Cells

      Volume: 24 Issue: 1 Pages: 82-93

    • DOI

      10.1111/gtc.12655

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    • Author(s)
      Kawata Kentaro、Hatano Atsushi、Yugi Katsuyuki、Kubota Hiroyuki、Sano Takanori、Fujii Masashi、Tomizawa Yoko、Kokaji Toshiya、Tanaka Kaori Y.、Uda Shinsuke、Suzuki Yutaka、Matsumoto Masaki、Nakayama Keiichi I.、Saitoh Kaori、Kato Keiko、Ueno Ayano、Ohishi Maki、Hirayama Akiyoshi、Soga Tomoyoshi、Kuroda Shinya
    • Journal Title

      iScience

      Volume: 7 Pages: 212-229

    • DOI

      10.1016/j.isci.2018.07.022

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      Ohashi Kaoru、Fujii Masashi、Uda Shinsuke、Kubota Hiroyuki、Komada Hisako、Sakaguchi Kazuhiko、Ogawa Wataru、Kuroda Shinya
    • Journal Title

      npj Systems Biology and Applications

      Volume: 4 Issue: 1 Pages: 14-14

    • DOI

      10.1038/s41540-018-0051-6

    • NAID

      120006599090

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      FUJII Masashi、KURODA Shinya
    • Journal Title

      Seibutsu Butsuri

      Volume: 57 Issue: 6 Pages: 305-308

    • DOI

      10.2142/biophys.57.305

    • NAID

      130006230284

    • ISSN
      0582-4052, 1347-4219
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      Tsuchiya Takaho、Fujii Masashi、Matsuda Naoki、Kunida Katsuyuki、Uda Shinsuke、Kubota Hiroyuki、Konishi Katsumi、Kuroda Shinya
    • Journal Title

      PLoS Computational Biology

      Volume: 13 Issue: 12 Pages: e1005913-e1005913

    • DOI

      10.1371/journal.pcbi.1005913

    • NAID

      120006555357

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    • Author(s)
      M. Fujii, K. Ohashi, Y. Karasawa, M. Hikichi, S. Kuroda
    • Journal Title

      Biophysical Journal

      Volume: 112 Issue: 4 Pages: 813-826

    • DOI

      10.1016/j.bpj.2016.12.043

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      自然科学研究機構 岡崎カンファレンスセンター(愛知県岡崎市)
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      藤井雅史、大橋郁、唐沢康暉、引地穣、黒田真也
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      第54回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      つくば国際会議場(茨城県つくば市)
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      第54回日本生物物理学会年会
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      つくば国際会議場(茨城県つくば市)
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      2016-11-25
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      研究会「理論と実験」2016
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      広島大学 東広島キャンパス(広島県東広島市)
    • Year and Date
      2016-10-07
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      研究会「理論と実験」2016
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      広島大学 東広島キャンパス(広島県東広島市)
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      2016-10-07
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      藤井雅史、大橋郁、唐沢康暉、引地穣、黒田真也
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      研究会「理論と実験」2016
    • Place of Presentation
      広島大学 東広島キャンパス(広島県東広島市)
    • Year and Date
      2016-10-06
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      大橋 郁, 藤井 雅史, 宇田 新介, 駒田 久子, 坂口 一彦, 小川 渉, 黒田 真也
    • Organizer
      日本物理学会 2016年秋季大会
    • Place of Presentation
      金沢大学角間キャンパス(石川県金沢市)
    • Year and Date
      2016-09-13
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  • [Presentation] SpineにおけるSmall-volume effect: Robust, Sensitive, Efficientな情報伝達のメカニズム2016

    • Author(s)
      藤井雅史、大橋郁、唐沢康暉、引地穣、黒田真也
    • Organizer
      数理で解き明かす森羅万象 ~ 小林亮と”ゆかい”な仲間たち~
    • Place of Presentation
      広島大学 東広島キャンパス(広島県東広島市)
    • Year and Date
      2016-08-19
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  • [Presentation] SpineにおけるSmall-volume effect: Robust, Sensitive, Efficientな情報伝達のメカニズム2016

    • Author(s)
      藤井雅史、大橋郁、唐沢康暉、引地穣、黒田真也
    • Organizer
      第6回JST数理デザイン道場
    • Place of Presentation
      東レ(株)総合研修センター(静岡県三島市)
    • Year and Date
      2016-06-13
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  • [Remarks] 研究代表者(藤井)のwebページ

    • URL

      https://home.hiroshima-u.ac.jp/~mafujii/publications

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  • [Remarks] 研究者個人が作成したwebページ(日本語)

    • URL

      http://kurodalab.bs.s.u-tokyo.ac.jp/member/fujii/japanese/Paper.html

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  • [Remarks] 研究者個人が作成したwebページ(英語)

    • URL

      http://kurodalab.bs.s.u-tokyo.ac.jp/member/fujii/english/Paper.html

    • Related Report
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URL: 

Published: 2016-04-21   Modified: 2020-03-30  

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