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Epitope mapping using the genome sequence of fish pathogen

Research Project

Project/Area Number 16K14977
Research Category

Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research

Allocation TypeMulti-year Fund
Research Field Aquatic bioproduction science
Research InstitutionFisheries Research and Education Agency

Principal Investigator

Takano Tomokazu  国立研究開発法人水産研究・教育機構, 増養殖研究所, 研究員 (40533998)

Project Period (FY) 2016-04-01 – 2019-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2018)
Budget Amount *help
¥3,510,000 (Direct Cost: ¥2,700,000、Indirect Cost: ¥810,000)
Fiscal Year 2018: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2017: ¥1,040,000 (Direct Cost: ¥800,000、Indirect Cost: ¥240,000)
Fiscal Year 2016: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000)
Keywordsファージディスプレイ / エピトープ / マダイイリドウイルス / 細菌性冷水病 / ワクチン / Red sea bream iridovirus / 冷水病 / F. psychrophilum / 魚病 / エピトープマッピング / ウィルス / 細菌 / 免疫学 / 遺伝子 / ゲノム
Outline of Final Research Achievements

Identification of the component of the pathogen recognized by the host antibody can be applied to the development of a component vaccine. In this study, with the combination of the genome information of fish pathogens (Red sea bream iridovirus and Flavobacterium psychrophilum) and phage display method, the antigens of fish pathogens were predicted comprehensively. A phage display library covering the entire genome of each pathogen was constructed individualy. Phage clones reactive to the antiserum from the immunized fish against the pathogen were concentrated by affinity selection. Sequences of the inserts harbored by the concentrated phages were analyzed by next-generation sequencing, and then antigen genes were predicted from genome sequence of pathogens. As a result of the analysis, a large number of antigen candidates were successfully predicted from each fish pathogen.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

魚病被害を軽減し、計画的に安心・安全な養殖魚を生産する技術が求められている。計画的な生産には、抗菌剤による治療よりも、ワクチンによる感染予防が重要である。しかし、難培養な魚類病原体については、不活化した病原体を準備することが困難であり、ワクチンを調製することができない。このような場合は、感染防御抗原を人工的に調製した成分ワクチンの利用が妥当だと考えられる。そのため、成分ワクチン開発では、宿主の抗体が認識する病原体の成分(抗原やエピトープ)を同定する必要がある。本研究で確立した抗原の網羅的な推定手法は、水産用の成分ワクチンを開発を進める上で重要な手法になると考えられる。

Report

(4 results)
  • 2018 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2017 Research-status Report
  • 2016 Research-status Report
  • Research Products

    (5 results)

All 2019 2018 2017

All Presentation (4 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results) Book (1 results)

  • [Presentation] ファージディスプレイ法を用いた網羅的な抗原の推定2019

    • Author(s)
      高野 倫一, 松山 知正, 西木 一生, 藤原 篤志, 河東 康彦, 坂井 貴光, 寺島 祥子, 松浦 雄太, 中易 千早
    • Organizer
      H30年度 日本魚病学会春期大会
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
  • [Presentation] DETERMINATION OF THE ANTIGEN RECOGNIZED BY ANTI-RSIV MONOCLONAL ANTIBODY (M10)2017

    • Author(s)
      Tomokazu Takano, Tomomasa Matsuyama, Takamitsu Sakai, Yasuhiko Kawato, Sachiko Terashima, Jun Kurita, Kazuhiro Nakajima, Chihaya Nakayasu
    • Organizer
      10th Symposium on Diseases in Asian Aquaculture (DAA10)
    • Related Report
      2017 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 高野倫一・松山知正・河東康彦・坂井貴光・寺島祥子・栗田潤・中島員洋・中易千早2017

    • Author(s)
      ファージディスプレイ法による抗マダイイリドウイルス単クローン抗体M10のエピトープの決定
    • Organizer
      平成29年度 日本魚病学会秋季大会
    • Related Report
      2017 Research-status Report
  • [Presentation] 分子生物学的手法を応用した魚類病原体に対するワクチンの開発2017

    • Author(s)
      高野 倫一
    • Organizer
      平成29年度日本水産学会春季大会
    • Place of Presentation
      東京海洋大学
    • Related Report
      2016 Research-status Report
  • [Book] よくわかる!魚病対策と水産用医薬品「ワクチン」 養殖ビジネス増刊号.2018

    • Author(s)
      高野倫一
    • Total Pages
      152
    • Publisher
      緑書房
    • Related Report
      2017 Research-status Report

URL: 

Published: 2016-04-21   Modified: 2020-03-30  

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