網羅的な遺伝子発現のメタ解析による悪性脳腫瘍の分子標的治療薬の探索

Research Project

Project/Area Number	16K18466
Research Category	Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
Allocation Type	Multi-year Fund
Research Field	Tumor therapeutics
Research Institution	National Cancer Center Japan
Principal Investigator	喬志偉国立研究開発法人国立がん研究センター, 研究所, 研究員 (80759944)
Project Period (FY)	2016-04-01 – 2019-03-31
Project Status	Discontinued (Fiscal Year 2018)
Budget Amount *help	¥2,600,000 (Direct Cost: ¥2,000,000、Indirect Cost: ¥600,000) Fiscal Year 2018: ¥1,040,000 (Direct Cost: ¥800,000、Indirect Cost: ¥240,000) Fiscal Year 2017: ¥780,000 (Direct Cost: ¥600,000、Indirect Cost: ¥180,000) Fiscal Year 2016: ¥780,000 (Direct Cost: ¥600,000、Indirect Cost: ¥180,000)
Keywords	悪性脳腫瘍 / Connectivity map / 既存薬の適応拡大 / 膠芽腫 / 適応拡大 / 分子標的薬 / 癌 / 脳神経疾患 / 遺伝子 / マイクロアレイ / 薬剤反応性
Outline of Annual Research Achievements	Connectivity map と既存薬のスクリーニングで同定された化合物を対象に、薬剤の相乗効果を調べたところ、腫瘍細胞増殖の抑制の相乗効果がなかった。薬剤スクリーニング実験について、既存のプログラムをアップデートし、より効率よいハイスループットのシステムの構築ができた。膠芽腫の以外の悪性脳腫瘍の遺伝子発現データの基盤整備を行った。具体的に、Gene expression omnibus (GEO)とArrayExpressにて悪性脳腫瘍を組織型ごとに遺伝子発現データをダウンロードして整理した。また、サンプルに付随する詳細な臨床病理情報を収集した。悪性脳腫瘍研究に適合する遺伝子発現データをまとめ、カスタム・データベースを構築した。既存薬の適応拡大研究を進むために、Connectivity map解析に使用するデータセットの整備を行った。