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染色体末端テロメアの構造生物学

Research Project

Project/Area Number 17012020
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Biological Sciences
Research InstitutionYokohama City University

Principal Investigator

西村 善文  横浜市立大学, 国際総合科学研究科, 教授 (70107390)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 明石 知子  横浜市立大学, 国際総合科学研究科, 準教授 (10280728)
Project Period (FY) 2005
Project Status Completed (Fiscal Year 2005)
Budget Amount *help
¥8,500,000 (Direct Cost: ¥8,500,000)
Fiscal Year 2005: ¥8,500,000 (Direct Cost: ¥8,500,000)
KeywordsDNA / TRF2 / ゲノム / タンパク質 / 転写 / テロメア / 老化 / がん化
Research Abstract

染色体末端のテロメアの構造は細胞老化やがん化に密接に関連する。テロメアDNAに結合するタンパク質としてTRF1とTRF2の2種類が知られている。今回我々はTRF2とテロメア二重鎖DNAとの複合体構造をNMR法で決定しTRF2によるテロメアDNAの認識機構を解明した。既に当研究室で決定していたTRF1とテロメア二重鎖DNA複合体構造と比較することによりテロメアDNAへの結合能が強くなったTRF2変異体を作成することが出来た。さらにTRF2はテロメアDNAの1本鎖3'突出末端が作るグアニン4重らせん構造と相互作用することを見出した。特に平行4重らせん構造と強く相互作用することからテロメア保護におけるTRF2の役割の一端を解明した。その他にも基本転写因子のTFIIEに関しては既に当研究室で決定していたβサブユニットのコアドメインの構造に引き続きαサブユニットのコアドメインであるZn結合ドメインの構造をNMR法で決定し、また基本転写因子のTFIIEの質量をMSで正確に測定した結果TFIIEはこれまで言われてきたようなααββのヘテロテトラマーではなくαβのヘテロダイマーであることを解明した。さらにがん抑制因子でもある神経特異的な転写抑制因子NRSF/RESTはサイレンサーに結合し非常に数多くの神経特異的な遺伝子の発現を抑制するタンパク質であるが、NRSF/RESTの転写抑制機構を解明するため転写コリプレッサーSin3との複合体の構造を解析した。NRSF/RESTのN末約80アミノ酸領域が相互作用領域だと知られていたが、その領域は単独では天然変成状態であり、その中の約10数アミノ酸からなる疎水性領域がSin3と相互作用してヘリックスを形成し遺伝子近傍にSin3をリクルートする。

Report

(1 results)
  • 2005 Annual Research Report
  • Research Products

    (6 results)

All 2005

All Journal Article (5 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] The Neural Repressor NRSF/REST Binds the PAH1 Domain of the Sin3 Corepressor by Using its Distinct Short Hydrophobic Helix.2005

    • Author(s)
      Nomura, M., Uda-Tochio, H., Murai, K., Mori, N., Nishimura, Y.
    • Journal Title

      J.Mol.Biol. 354

      Pages: 903-915

    • Related Report
      2005 Annual Research Report
  • [Journal Article] Investigation of molecular size of Transcription Factor TFIIE in solution.2005

    • Author(s)
      Itoh, Y., Unzai, S., Sato, M., Nagadoi, A., Okuda, M., Nishimura, Y., Akashi, S.
    • Journal Title

      PROTEINS. 61

      Pages: 633-641

    • Related Report
      2005 Annual Research Report
  • [Journal Article] Structural Insights into the Asymmetric Effects of Zinc-Ligand Cysteine Mutations in the Novel Zinc Ribbon Domain of Human TFIIEα for Transcription.2005

    • Author(s)
      Okuda, M., Tanaka, A., Hanaoka, F., Ohkuma, Y., Nishimura, Y.
    • Journal Title

      J.Biochem. 138

      Pages: 443-449

    • NAID

      10017347670

    • Related Report
      2005 Annual Research Report
  • [Journal Article] Evaluation of Protein-DNA Binding Affinity by Electrospray Ionization Mass Spectrometry.2005

    • Author(s)
      Akashi, S., Osawa, R., Nishimura, Y.
    • Journal Title

      J.Amer.Soc.Mass Spectrom. 16

      Pages: 116-125

    • Related Report
      2005 Annual Research Report
  • [Journal Article] Comparison between TRF2 and TRF1 on their telomeric DNA-bound structures and DNA-binding activities.2005

    • Author(s)
      Hanaoka, S., Nagadoi, A., Nishimura, Y.
    • Journal Title

      Protein Sci. 14

      Pages: 119-130

    • Related Report
      2005 Annual Research Report
  • [Book] ラマンおよびCDによる高次構造解析-生物薬科学実験講座、核酸II核酸の分離と構造2005

    • Author(s)
      西村善文
    • Publisher
      廣川書店
    • Related Report
      2005 Annual Research Report

URL: 

Published: 2005-04-01   Modified: 2018-03-28  

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