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siRNAライブラリーを用いた刷り込み遺伝子発現調節分子の同定

Research Project

Project/Area Number 17019054
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Biological Sciences
Research InstitutionSaga University

Principal Investigator

副島 英伸  佐賀大学, 医学部, 助手 (30304885)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 三ツ矢 幸造  東北大学, 先進医工学研究機構, 助手 (30375191)
押村 光雄  鳥取大学, 大学院医学系研究科, 教授 (20111619)
Project Period (FY) 2005
Project Status Completed (Fiscal Year 2005)
Budget Amount *help
¥2,500,000 (Direct Cost: ¥2,500,000)
Fiscal Year 2005: ¥2,500,000 (Direct Cost: ¥2,500,000)
Keywordsゲノム刷り込み / 刷り込みドメイン / siRNAライブラリー / non-coding RNA / ヒストンメチル化
Research Abstract

ゲノム刷り込みはエピジェネティクスの代表的現象で、一対の対立遺伝子において一方の親由来の遺伝子のみが発現する。複数の刷り込み遺伝子がドメインを作り、ドメイン内の刷り込み調節領域(ICR)に付けられた刷り込みマークに基づき遺伝子発現が決定されている。しかし、その遺伝子発現調節機構はほとんど未解明のままである。本研究では、ヒト疾患に関連する11p15.5のKIP2/LIT1刷り込みドメインに着目し、刷り込み遺伝子の発現制御機構の解明を目的とする。
1.刷り込み調節分子の同定:KIP2/LIT1ドメインの刷り込み破綻を単純な表現型(GFPの蛍光や薬剤耐性)で判定できる細胞を作製し、この細胞にsiRNAライブラリーを感染させ、表現型の変化で刷り込み破綻細胞を選別する。選別した刷り込み破綻細胞からsiRNAベクターを回収後、塩基配列を決定し、ゲノムデータベースを検索して刷り込み破綻を引きおこした候補遺伝子を同定する。また、non-coding RNAであるLIT1遺伝子の転写物を様々な長さで発現するような細胞を作製し、刷り込み破綻の有無を解析して、刷り込み調節分子としての可能性を検証する。上記目的のために、細胞系構築に必要なベクター合計5種類を作製した。現在、これらのベクターを細胞に導入している。
2.新規刷り込みマークの同定:F1マウス由来線維芽細胞を用いたクロマチン免疫沈降法(ChIP法)によりICRのヒストンH3K9、H3K27、H4K20のモノ、ジ、トリメチル化について解析した。その結果、H3K20のモノメチル化のみが父アレルに優位に存在することが判明した。ヒストンH3のメチル化は遺伝子抑制のマークであり、父アレル上ではLit1を除く他の刷り込み遺伝子は抑制されていることから、H3K20モノメチル化がドメイン内の刷り込み遺伝子の発現を抑制するマークである可能性が示唆された。

Report

(1 results)
  • 2005 Annual Research Report
  • Research Products

    (7 results)

All 2006 2005

All Journal Article (7 results)

  • [Journal Article] Comparative analyses of genomic imprinting and CpG island-methylation in mouse Murrl and human MURR1 loci revealed a putative imprinting control region in mice.2006

    • Author(s)
      Zhang Z
    • Journal Title

      Gene 366・1

      Pages: 77-86

    • Related Report
      2005 Annual Research Report
  • [Journal Article] Imprinting, Chromatin Structure, and Disease.2005

    • Author(s)
      Soejima H
    • Journal Title

      J Cell Biochem 95・2

      Pages: 226-233

    • Related Report
      2005 Annual Research Report
  • [Journal Article] ZAC, LIT1 (KCNQ1OT1) and p57^<KIP2> (CDKN1C) are in an imprinted gene network that may play a role in Beckwith-Wiedemann syndrome.2005

    • Author(s)
      Arima T
    • Journal Title

      Nucleic Acids Res 33・8

      Pages: 2650-2660

    • Related Report
      2005 Annual Research Report
  • [Journal Article] Neuron-specific relaxation of Igf2r imprinting is associated with neuron-specific histone modifications and lack of its antisense transcript Air.2005

    • Author(s)
      Yamasaki Y
    • Journal Title

      Hum Mol Genet 14・17

      Pages: 2511-2520

    • Related Report
      2005 Annual Research Report
  • [Journal Article] Epigenetic silencing of the MGMT gene in cancer.2005

    • Author(s)
      Soejima H
    • Journal Title

      Biochem Cell Biol 83・4

      Pages: 429-437

    • Related Report
      2005 Annual Research Report
  • [Journal Article] Narrowed abrogation of the Angelman syndrome critical interval on human chromosome 15 does not interfere with epigenotype maintenance in somatic cells.2005

    • Author(s)
      Haruta M
    • Journal Title

      J Hum Genet 50・3

      Pages: 124-132

    • Related Report
      2005 Annual Research Report
  • [Journal Article] インプリンティングと先天異常、癌2005

    • Author(s)
      副島英伸
    • Journal Title

      Molecular Medicine 42・2

      Pages: 201-208

    • Related Report
      2005 Annual Research Report

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Published: 2005-04-01   Modified: 2018-03-28  

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