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試験管内遺伝子発現系を用いたタンパク質の機能発現プロセスの研究

Research Project

Project/Area Number 17028010
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Biological Sciences
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

上田 卓也  東京大学, 大学院新領域創成創成科学研究科, 教授 (80184927)

Project Period (FY) 2005 – 2006
Project Status Completed (Fiscal Year 2006)
Budget Amount *help
¥8,000,000 (Direct Cost: ¥8,000,000)
Fiscal Year 2006: ¥4,000,000 (Direct Cost: ¥4,000,000)
Fiscal Year 2005: ¥4,000,000 (Direct Cost: ¥4,000,000)
Keywords生体外蛋白質合成系 / シャペロン / フォールディング / リボソーム / GroEL / GroES / 反転膜小胞
Research Abstract

リボソーム上で合成された新生ペプチドは、複雑なプロセスをへて、機能を持つ多様な形態の成熟型蛋白質となる。私たちは、近年、翻訳過程に必須な因子のみ構成された試験管内遺伝子発現系PUREsystemを再構築し、蛋白質の誕生プロセスを無細胞化した。このシステムの発展型として蛋白質成熟プロセスに関与する因子群をPURESYSTEMに共存させた複合型無細胞システムを開発し、蛋白質の成熟過程のメカニズム解明することを本研究の目標としている。
まず、新生蛋白質のフォールディングにおける分子シャペロンの役割、および翻訳と共役したフォールディングプロセスを解析するために、フォールディングに関与するシャペロンの共存させたPURESYSTEMを構築した。従来のシャペロンのフォールディングへの関与に関する仮説を検証することを目的として、このシステムを用いた解析を進めている。単鎖抗体(scFv)を用いた実験では、DnaKシステム(DnaK-J/GrpE)とトリガーファクターは、新生蛋白質の可溶化率とその抗原結合活性の向上に著しく効果があり、合成されたscFvの正確な折り畳みを促進することが示された。また、トリガーファクターとDnaKシステムがco-translationalおよびpost-translationalの両プロセスで新生蛋白質の凝集を抑えることが明らかとなった。また、これらのシャペロンの基質となる蛋白質を、大腸菌遺伝子から検索し、シャペロンニン(GroEL/ES)に依存してフォールディングする基質蛋白質-stringent substrate-を見いだした。GroEL/ES-dependentフォールディングプロセスをin vitroで解析したところ、今まで言われたpost-translationalプロセスではなく、新生ポリペプチドーリボソーム-mRNA複合体に結合し、co-translationalプロセスでフォールディングに寄与する可能性が高いことが示された。またsingle-ringのGroELを用いた実験から、GroELが翻訳途中の新生ペプチドに結合し、翻訳終了後にGroESがGroELに結合し、フォールディングを誘導することが示された。

Report

(2 results)
  • 2006 Annual Research Report
  • 2005 Annual Research Report
  • Research Products

    (12 results)

All 2007 2006 2005

All Journal Article (12 results)

  • [Journal Article] Efficient protein selection based on ribosome display system with purified components.2007

    • Author(s)
      Ohashi, H., Shimizu, Y., Ying, B.W., Ueda, T.
    • Journal Title

      Biochem Biophys Res Commun 352

      Pages: 270-276

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] Ribosomal Protein S1 Is not Essential for the trans-translation Machinery.2007

    • Author(s)
      Qi, H., Shimizu, Y., Ueda, T.
    • Journal Title

      J Mol Biol 368

      Pages: 845-852

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] Chaperone properties of mammalian mitochondrial translation elongation factor Tu.2007

    • Author(s)
      Suzuki, H., Ueda, T., Taguchi, H., Takeuchi.N.
    • Journal Title

      J Biol Chem 282

      Pages: 4076-4084

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] Co-translational binding of GroEL to nascent polypeptides is followed by post-translational encapsulation by GroES to mediate protein folding.2006

    • Author(s)
      Ying, B.W., Taguchi, H., Ueda, T.
    • Journal Title

      J Biol Chem 281

      Pages: 21813-21819

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] Spermidine inhibits transient and stable ribosome subunit dissociation.2006

    • Author(s)
      Umekage, S., Ueda, T.
    • Journal Title

      EBS Lett 580

      Pages: 1222-1226

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] SmpB triggers GTP hydrolysis of elongation factor Tu on ribosomes by compensating for the lack of codon-anticodon interaction during trans-translation initiation.2006

    • Author(s)
      Shimizu, Y., Ueda, T.
    • Journal Title

      J Biol Chem 281

      Pages: 15987-15996

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] Spermidine inhibits transient and stable ribosome subunit dissociation.2006

    • Author(s)
      Umekage, S., Ueda, T.
    • Journal Title

      FEBS Lett 580(5)

      Pages: 1222-1226

    • Related Report
      2005 Annual Research Report
  • [Journal Article] Co-translational involvement of the chaperonin GroEL in the folding of newly translated polypeptides.2005

    • Author(s)
      Ying, B.W., Taguchi, H., Kondo, M., Ueda, T.
    • Journal Title

      J Biol Chem 280(12)

      Pages: 12035-12040

    • Related Report
      2005 Annual Research Report
  • [Journal Article] Esterification of Escherichia coli tRNAs with D-histidine and D-lysine by aminoacyl-tRNA synthetases.2005

    • Author(s)
      Takayama, T., Ogawa, T., Hidaka, M., Shimizu, Y., Ueda, T., Masaki, H.
    • Journal Title

      Biosci Biotechnol Biochem 69(5)

      Pages: 1040-1041

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      2005 Annual Research Report
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    • Author(s)
      Shimizu, Y., Kanamori, T., Ueda, T.
    • Journal Title

      Methods 36(3)

      Pages: 299-304

    • Related Report
      2005 Annual Research Report
  • [Journal Article] Human mitochondrial mRNAs are stabilized with polyadenylation regulated by mitochondria-specific poly(A) polymerase and polynucleotide phosphorylase.2005

    • Author(s)
      Nagaike, T., Suzuki, T., Katoh, T., Ueda, T.
    • Journal Title

      J Biol Chem 280(20)

      Pages: 19721-19727

    • Related Report
      2005 Annual Research Report
  • [Journal Article] Development of a minimal cell-free translation system for the synthesis of presecretory and integral membrane proteins.2005

    • Author(s)
      Kuruma, Y., Nishiyama, K., Shimizu, Y., Muller, M., Ueda, T.
    • Journal Title

      Biotechnol Prog 21(4)

      Pages: 1243-1251

    • Related Report
      2005 Annual Research Report

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Published: 2005-04-01   Modified: 2018-03-28  

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