• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to previous page

高精細な4次元医用画像の高速計算に関する研究

Research Project

Project/Area Number 17032007
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Science and Engineering
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

萩原 兼一  大阪大学, 大学院情報科学研究科, 教授 (00133140)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 伊野 文彦  大阪大学, 大学院情報科学研究科, 助手 (90346172)
Project Period (FY) 2005 – 2006
Project Status Completed (Fiscal Year 2006)
Budget Amount *help
¥6,900,000 (Direct Cost: ¥6,900,000)
Fiscal Year 2006: ¥3,800,000 (Direct Cost: ¥3,800,000)
Fiscal Year 2005: ¥3,100,000 (Direct Cost: ¥3,100,000)
KeywordsPCクラスタ / 医用画像処理 / 高速化 / GPU / モルフォロジー演算 / 4次元ボリュームレンダリング
Research Abstract

本研究の目的は,高精細な4次元医用画像に対する実時間処理を実現することである.この実現のために,GPUやPCクラスタを用いた高性能計算に関して研究してきた.平成18年度の成果として,(1)4次元ボリュームレンダリングの高速化,(2)モルフォロジー演算の高速化,および(3)GPU装備のノートPCによる2次元/3次元剛体位置合わせの性能評価および精度評価について述べる.
(1)512×512××295ボクセルの肺データに対しては,秒間あたり5フレームの性能を達成でき,ほぼ実時間の可視化を実現できている.残りの小規模なデータに対しては30フレームに到達するものもある.一方,技術を何ら用いない安易な実装では,概ね1/5の性能であることから,1台のPCであってもディスク,CPUおよびGPUの多重化,およびデータ圧縮やパイプラインなどの工夫により目標性能を達成できた.
(2)GPUにより数秒程度の実行時間をモルフォロジー演算に対して達成した.集約型は大きい元画像に対して高速であり,ばらまき型は大きい構造要素に対して高速であることを示した.
(3)64個のCPUを持つPCクラスタは,位置合わせに要する計算時間を5分から15秒,15分から58秒に短縮できた.一方,GPUはほぼ30秒以下の実行時間で位置合わせを完了できている.この実行時間は術中用途に耐える短さであるため,提案手法は位置合わせを前処理とする様々な手術支援に貢献できる.PCクラスタが管理や運営などの維持コストを必要とするのに対し,GPUではノートPCを1台のみ手術室に持ち込めばよいので,高性能計算環境を導入するときの敷居は格段に低く,実用性が高い.

Report

(2 results)
  • 2006 Annual Research Report
  • 2005 Annual Research Report
  • Research Products

    (51 results)

All 2007 2006 2005

All Journal Article (51 results)

  • [Journal Article] グリッドアプリケーションの実行時間を短縮するための計算結果再利用機構の評価2007

    • Author(s)
      松尾 勝則
    • Journal Title

      情報処理学会研究報告 2007-EVA-201(発表予定)

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] Three-Dimensional Parallel Image Processing Library2007

    • Author(s)
      Yasushi Hirano
    • Journal Title

      Proceedings of the 10th International Workshop on Advanced Image Technology

      Pages: 929-933

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] 並列型画像処理ライブラリの高効率化2007

    • Author(s)
      平野 靖
    • Journal Title

      電子情報通信学会技術研究報告 MI2006-87

      Pages: 17-20

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] Parallel Adaptive Estimation of Range of Motion Simulation for Total Hip Replacement Surgery2007

    • Author(s)
      Yasuhiro Kawasaki
    • Journal Title

      IEICE Transactions on Information and Systems E90-D・1

      Pages: 30-39

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] 適合格子細分化法を用いる画像処理のための実行時間予測手法2007

    • Author(s)
      川崎 康博
    • Journal Title

      電子情報通信学会技術研究報告 MI2006-145

      Pages: 235-238

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] Real-Time Rendering of Time-Varying Volume Data Using a Single COTS PC2007

    • Author(s)
      Daisuke Nagayasu
    • Journal Title

      Proceedings of the 2nd International Conference on Computer Graphics Theory and Applications (採録決定)

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] 大規模なマルチスケールポリュームレンダリングのための先読み手法の検討2007

    • Author(s)
      辻 顯
    • Journal Title

      電子情報通信学会2007総合大会講演論文集 (発表予定)

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] GPGPUアプリケーションを開発するための性能モデルの検討2007

    • Author(s)
      伊藤 信悟
    • Journal Title

      第7回ハイパフォーマンスコンピューティングと計算科学シンボジウム論文集

      Pages: 67-67

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] GPUを用いたモルフォロジ-演算のベクトル化2007

    • Author(s)
      前野 滝授
    • Journal Title

      情報処理学会研究報告 2007-CG-126

      Pages: 73-78

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] Grid Resource Monitoring and Selection for Rapid Turnarround Applications2006

    • Author(s)
      Kensuke Muraki
    • Journal Title

      IEICE Transactions on Information and Systems E89-D・9

      Pages: 2491-2501

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] A Resource Selection Method for-Cycle Stealing in the GPU Grid2006

    • Author(s)
      Yuki Kotani
    • Journal Title

      Proceedings of the 4th International Symposium on Parallel and Distributed Processing and Applications Workshops

      Pages: 769-780

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] グリッド環境において遊休GPUを活用するための資源選択手法2006

    • Author(s)
      小谷裕基
    • Journal Title

      情報処理学会研究報告 2006-HPC-108

      Pages: 37-42

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] Minimizing Data Size for Efficient Data Reuse in Grid-Enabled Medical Applications2006

    • Author(s)
      Fumihiko Ino
    • Journal Title

      Proceedings of the 7th International Symposium on Biological and Medical Data Analysis

      Pages: 195-206

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] グリッド環境において計算結果を効率よく再利用するための通信量削減2006

    • Author(s)
      松尾 勝則
    • Journal Title

      情報処理学会研究報告 2006-HPC-107

      Pages: 19-24

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] Trace Reduction for Performance Improvement Assessment of Message Passing Parallel Programs2006

    • Author(s)
      Fumihiko Ino
    • Journal Title

      Systems and Computers in Japan 37・5

      Pages: 1-13

    • NAID

      110003203349

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] メッセージ通信プログラムにおける性能解析のための大規模な実行履歴の生成2006

    • Author(s)
      置田 真生
    • Journal Title

      情報処理学会 : コンピューティングシステム 47・SIG7

      Pages: 1-11

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] 3次元並列型画像処理ライブラリの構築とその性能評価2006

    • Author(s)
      平野 靖
    • Journal Title

      第15回日本コンピュータ外科学会大会/第16回コンピュータ支援画像診断学会大会合同論文集

      Pages: 313-314

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] A Parallel Implementation of 2-D/3-D Image Registration for Computer-Assisted Surgery2006

    • Author(s)
      Fumihiko Ino
    • Journal Title

      International Journal of Bioinformatics Research and Applications 2・4

      Pages: 341-358

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] 汎用グラフィクスハードウェアを用いた2次元/3次元剛体位置合わせの高速化2006

    • Author(s)
      五味田 遵
    • Journal Title

      情報処理学会論文誌 47・10

      Pages: 2947-2958

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] Fast 2-D/3-D Registration Using a Laptop PC with Commodity Graphics Hardware2006

    • Author(s)
      Fumihiko Ino
    • Journal Title

      Proceedings of Computer Assisted Radiology and Surgery : 20th International Congress and Exhibition

      Pages: 53-54

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] A GPGPU Approach for Accelerating 2-D/3-D Rigid Registration of Medical Images2006

    • Author(s)
      Fumihiko Ino
    • Journal Title

      Proceedings of the 4th International Symposium on Parallel and Distributed Processing and Applications

      Pages: 939-950

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] Two-Stage Compression for Fast Volume Rendering of Time-Varying Scalar Data2006

    • Author(s)
      Daisuke Nagayasu
    • Journal Title

      Proceedings of the 4th International Conference on Computer Graphics and Interactive Techniques in Australasia and Southeast Asia

      Pages: 275-284

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] A Code Motion Technique for Accelerating General-Purpose Computation on the GPU2006

    • Author(s)
      Takatoshi Ikeda
    • Journal Title

      Proceedings of the 20th IEEE International Parallel and Distributed Processing Symposium (CD-ROM)

      Pages: 10-10

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] GPU内命令移動のための性能指標の実験的評価2006

    • Author(s)
      池田 孝利
    • Journal Title

      第4回先進的計算基盤システムシンポジウム論文集

      Pages: 51-58

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] モルフォロジー演算の高速化のためのGPU実装の比較2006

    • Author(s)
      前野 滝授
    • Journal Title

      第10回Visual Computing/グラフィクスとCAD合同シンポジウム予稿集

      Pages: 239-244

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] 汎用グラフィクスハードウェアを用いた2方向投影による2次元/3次元剛体位置合わせ2006

    • Author(s)
      五味田 遵
    • Journal Title

      電子情報通信学会技術研究報告 MI2005-115

      Pages: 29-32

    • Related Report
      2005 Annual Research Report
  • [Journal Article] 3次元並列型画像処理ライブラリ開発における基礎的検討2006

    • Author(s)
      平野 靖
    • Journal Title

      電子情報通信学会技術研究報告 MI2005-116

      Pages: 33-36

    • Related Report
      2005 Annual Research Report
  • [Journal Article] グリッド環境における計算結果再利用の検討2006

    • Author(s)
      田中 裕也
    • Journal Title

      第6回ハイパフォーマンスコンピューティングと計算科学シンポジウム論文集告

      Pages: 47-47

    • Related Report
      2005 Annual Research Report
  • [Journal Article] GPUを装備する計算機を計算資源とするグリッドにおける資源選択手法の検討2006

    • Author(s)
      小谷 裕基
    • Journal Title

      情報処理学会研究報告 2005-EVA-16(発表予定)

    • Related Report
      2005 Annual Research Report
  • [Journal Article] 適合格子細分化法のアプリケーションのためのフラクタルに基づく計算量予測手法2006

    • Author(s)
      川崎 康博
    • Journal Title

      第6回ハイパフォーマンスコンピューティングと計算科学シンポジウム論文集

      Pages: 43-43

    • Related Report
      2005 Annual Research Report
  • [Journal Article] GPUを用いたモルフォロジー演算の高速化手法2006

    • Author(s)
      前野 滝授
    • Journal Title

      電子情報通信学会2006総合大会講演論文集 (発表予定)

    • Related Report
      2005 Annual Research Report
  • [Journal Article] メッセージ通信プログラムにおける性能解析のための大規模な実行履歴の作成2006

    • Author(s)
      置田 真生
    • Journal Title

      第6回ハイパフォーマンスコンピューティングと計算科学シンポジウム論文集告

      Pages: 129-136

    • Related Report
      2005 Annual Research Report
  • [Journal Article] メッセージ通信プログラムにおける性能解析のための大規模な実行履歴の作成2006

    • Author(s)
      置田 真生
    • Journal Title

      情報処理学会論文誌:コンピューティングシステム 47・SIG14(採録決定)

    • Related Report
      2005 Annual Research Report
  • [Journal Article] 術中二次元/三次元剛体位置合せのための並列化手法2005

    • Author(s)
      川崎 康博
    • Journal Title

      電子情報通信学会論文誌 J88-D-I・10

      Pages: 1534-1546

    • Related Report
      2005 Annual Research Report
  • [Journal Article] A Parallel Implementation of 2-D/3-D Image Registration for Computer-Assisted Surgery2005

    • Author(s)
      Fumihiko Ino
    • Journal Title

      Proceedings of the 11th International Conference on Parallel and Distributed Systems, Volume II Workshops

      Pages: 316-320

    • Related Report
      2005 Annual Research Report
  • [Journal Article] Performance Evaluation of Nonrigid Registration Algorithm on Three Off-the-Shelf Supercomputers2005

    • Author(s)
      Fumihiko Ino
    • Journal Title

      Proceedings of Computer Assisted Radiology and Surgery : 19th International Congress and Exhibition

      Pages: 1276-1276

    • Related Report
      2005 Annual Research Report
  • [Journal Article] Performance Study of Nonrigid Registration Algorithm for Investigating Lung Disease on Clusters2005

    • Author(s)
      Fumihiko Ino
    • Journal Title

      Proceedings of the 6th International Conference on Parallel and Distributed Computing, Applications and Technologies

      Pages: 820-825

    • Related Report
      2005 Annual Research Report
  • [Journal Article] 汎用グラフィクスハードウェアを用いた2次元/3次元剛体位置合わせの高速化2005

    • Author(s)
      五味田 遵
    • Journal Title

      情報処理学会研究報告 2005-HPC-104

      Pages: 25-30

    • Related Report
      2005 Annual Research Report
  • [Journal Article] グリッドにおいて短時間処理を実現するための資源選択手法2005

    • Author(s)
      村木 健介
    • Journal Title

      第3回先進的計算基盤システムシンポジウム論文集

      Pages: 253-254

    • Related Report
      2005 Annual Research Report
  • [Journal Article] Grid Resource Monitoring and Selection for Rapid Turnaround Applications2005

    • Author(s)
      Kensuke Muraki
    • Journal Title

      Proceedings of the 17th IASTED International Conference on Parallel and Distributed Computing and Systems

      Pages: 253-254

    • Related Report
      2005 Annual Research Report
  • [Journal Article] グリッドにおけるGPUの遊休状態を監視するためのシステムの提案2005

    • Author(s)
      小谷 裕基
    • Journal Title

      第3回先進的計算基盤システムシンポジウム論文集

      Pages: 205-206

    • Related Report
      2005 Annual Research Report
  • [Journal Article] フラクタル解析による適合格子細分化法の計算量予測2005

    • Author(s)
      川崎 康博
    • Journal Title

      電子情報通信学会技術研究報告 COMP2005-20

      Pages: 9-15

    • Related Report
      2005 Annual Research Report
  • [Journal Article] GPUを用いた時系列ボリュームレンダリングの2段階圧縮による高速化2005

    • Author(s)
      永安 大輔
    • Journal Title

      3次元画像コンファレンス講演論文集

      Pages: 21-24

    • Related Report
      2005 Annual Research Report
  • [Journal Article] 時系列ボリュームを高速レンダリングするための2段階データ圧縮方法の性能および画質評価2005

    • Author(s)
      永安 大輔
    • Journal Title

      情報処理学会研究報告 2005-CG-121

      Pages: 115-120

    • Related Report
      2005 Annual Research Report
  • [Journal Article] 医用画像処理の並列処理による高速化について2005

    • Author(s)
      萩原 兼一
    • Journal Title

      情報処理学会研究報告 2005-AL-102

      Pages: 33-33

    • NAID

      110002812597

    • Related Report
      2005 Annual Research Report
  • [Journal Article] プログラマブルGPUにおけるLU分解の設計と実装2005

    • Author(s)
      松井 学
    • Journal Title

      情報処理学会論文誌:コンピューティングシステム 46・SIG12

      Pages: 129-139

    • Related Report
      2005 Annual Research Report
  • [Journal Article] Performance Study of LU Decomposition on the Programmable GPU2005

    • Author(s)
      Fumihiko Ino
    • Journal Title

      Proceedings of the 12th International Conference on High Performance Computing

      Pages: 83-94

    • Related Report
      2005 Annual Research Report
  • [Journal Article] プログラマブルGPUにおけるLU分解の設計と実装2005

    • Author(s)
      松井 学
    • Journal Title

      第3回先進的計算基盤システムシンポジウム論文集

      Pages: 359-367

    • Related Report
      2005 Annual Research Report
  • [Journal Article] GPUアプリケーションを高速化するための命令割当方式2005

    • Author(s)
      池田 孝利
    • Journal Title

      情報処理学会論文誌:コンピューティングシステム 46・SIG12

      Pages: 140-149

    • Related Report
      2005 Annual Research Report
  • [Journal Article] GPUアプリケーションを高速化するための命令割当方式2005

    • Author(s)
      池田 孝利
    • Journal Title

      第3回先進的計算基盤システムシンポジウム論文集

      Pages: 7-16

    • Related Report
      2005 Annual Research Report
  • [Journal Article] メッセージ通信プログラムの性能改善可能性を評価するための実行履歴の削減2005

    • Author(s)
      伊野 文彦
    • Journal Title

      電子情報通信学会論文誌 J88-D-1・4

      Pages: 780-790

    • Related Report
      2005 Annual Research Report

URL: 

Published: 2005-04-01   Modified: 2018-03-28  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi