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X線結晶構造解析に基づく嗅覚・味覚・温覚レセプターの情報変換メカニズムの解明

Research Project

Project/Area Number 17048007
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Biological Sciences
Research InstitutionTokyo Institute of Technology

Principal Investigator

深井 周也  東京工業大学, バイオ研究基盤支援総合センター, 助教授 (10361792)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 濡木 理  東京工業大学, 大学院生命理工学研究科, 教授 (10272460)
大方 香代子  東京工業大学, 大学院生命理工学研究科, 教務職員 (60213641)
Project Period (FY) 2005 – 2006
Project Status Completed (Fiscal Year 2006)
Budget Amount *help
¥6,300,000 (Direct Cost: ¥6,300,000)
Fiscal Year 2006: ¥3,200,000 (Direct Cost: ¥3,200,000)
Fiscal Year 2005: ¥3,100,000 (Direct Cost: ¥3,100,000)
KeywordsX線結晶構造解析 / 膜タンパク質 / イオン輸送体 / 受容体 / 膜透過装置 / イオンチャネル / Gタンパク質共役型受容体
Research Abstract

高等真核生物には,外界からの刺激に対応して行動を決定するため視覚・聴覚・嗅覚・味覚・触覚からなる五感が備わっている.視覚・聴覚・触覚(圧覚・温覚)は物理刺激の受容であり,嗅覚・味覚は化学刺激の受容である.一方,刺激を電気シグナルに変換する仕組みから考えると,視覚・嗅覚・味覚(甘・苦・旨味)受容体は,三量体型Gタンパク質と共役してホスホリパーゼCを活性化し,生成したイノシトール三リン酸(IP3)により,小胞体のIP3受容体が活性化され,小胞体中のCa^<2+>イオンが細胞質に放出されて膜が脱分極する.これに対し,聴覚・圧覚・温覚および味覚の一部(酸・塩味)では,受容体が直接イオンチャネルとして働き,Ca^<2+>イオンなどの陽イオンの細胞内への流入を引き起こし,膜の脱分極を生ずる.本研究では,刺激による受容体の活性化メカニズムを原子分解能レベルで解明することを目的として,感覚受容体のX線結晶構造解析を目標とした.Gタンパク質共役型受容体のリガンド結合ドメインやチャネル型受容体の全長および細胞内ドメインの大量発現を試みてきたが,結晶化条件のスクリーニングを行なうには至らなかった.一方,我々は膜タンパク質の結晶構造決定を目標として,好熱菌由来の膜タンパク質の結晶構造決定を試みて来た.京都大学ウイルス研究所の伊藤維昭教授との共同研究により,膜透過装置複合体SecDFおよびSecYEそれぞれについて分解能3.7Åおよび3.2Åの結晶を得て,セレン原子の異常分散を利用して位相を決定し電子密度を得た.SecYEについては,3.2Å分解能での構造精密化を終えた(R_<free>0.32).また,好熱菌由来の金属イオン輸送体の高分解能結晶の調製し,セレン原子の異常分散を利用して3.5Å分解能で構造を決定した.また,細胞質ドメインについては二種類のイオン輸送体について2.5Å分解能で構造を決定した.

Report

(2 results)
  • 2006 Annual Research Report
  • 2005 Annual Research Report
  • Research Products

    (12 results)

All 2006 2005

All Journal Article (12 results)

  • [Journal Article] tructural basis for sulfur relay to RNA mediated by heterohexameric TusBCD complex2006

    • Author(s)
      T.Numata, S.Fukai, Y.Ikeuchi, T.Suzuki, O.Nureki
    • Journal Title

      Structure 14

      Pages: 357-366

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      2006 Annual Research Report
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    • Author(s)
      T.Numata, Y.Ikeuchi, S.Fukai, H.Adachi, H.Matsumura, K.Takano, S.Murakami, T.Inoue, Y.Mori, T.Sasaki, T.Suzuki, O.Nureki
    • Journal Title

      Acta Crystallographica F 62

      Pages: 368-371

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] Purification, crystallization and preliminary X-ray diffraction of SecDF, a translocon-associated membrane protein, from Thermus thermophilus2006

    • Author(s)
      T.Tsukazaki, H.Mori, S.Fukai, T.Numata, A.Perederina, H.Adachi, H.Matsumura, K.Takano, S.Murakami, T.Inoue, Y.Mori, T.Sasaki, D.G.Vassylyev, O.Nureki, K.Ito
    • Journal Title

      Acta Crystallographica F 62

      Pages: 376-380

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      2006 Annual Research Report
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    • Author(s)
      H.Oshikane, K.Sheppard, S.Fukai, Y.Nakamura, R.Ishitani, T.Numata, R.L.Sherrer, L.Feng, E.Schmitt, M.Panvert, S.Blanquet, Y.Mechulam, D.Soll, O.Nureki
    • Journal Title

      Science 3122

      Pages: 1950-1954

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    • Author(s)
      T.Numata, Y.Ikeuchi, S.Fukai, T.Suzuki, O.Nureki
    • Journal Title

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    • Author(s)
      K.Tomita, R.Ishitani, S.Fukai, O.Nureki
    • Journal Title

      Nature 443

      Pages: 956-960

    • NAID

      130006997728

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    • Author(s)
      K.Suto, Y.Shimizu, K.Watanabe, T.Ueda, S.Fukai, O.Nureki, K.Tomita
    • Journal Title

      EMBO Journal 25

      Pages: 5942-5950

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      Y.Sato, R.Shirakawa, H.Horiuchi, N.Dohmae, S.Fukai, O.Nureki
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      Structure 15

      Pages: 245-252

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    • Author(s)
      Watanabe, K., Nureki, O., Fukai, S., Ishii, R., Okamoto, H., Yokoyama, S., Endo, Y., Hori, H.
    • Journal Title

      Journal of Biological Chemistry 280

      Pages: 10368-10377

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      Nakanishi, K., Fukai, S., Ikeuchi, Y., Soma, A., Sekine, Y., Suzuki, T., Nureki, O.
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      Pages: 7487-7492

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    • Author(s)
      Nakanishi, K., Ogiso, Y., Fukai, S., Nureki, O.
    • Journal Title

      Nature Structural and Molecular Biology 12

      Pages: 931-932

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      2005 Annual Research Report
  • [Journal Article] Structural basis for sulfur relay to RNA mediated by heterohexameric TusBCD complex.2005

    • Author(s)
      Numata, T., Fukai, S., Ikeuchi, Y, Suzuki, T., Nureki, O.
    • Journal Title

      Structure 4

      Pages: 357-366

    • Related Report
      2005 Annual Research Report

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Published: 2005-04-01   Modified: 2018-03-28  

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