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遺伝情報発現を転写伸長段階で制御するDECODE複合体の機能・構造解析

Research Project

Project/Area Number 17054014
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Biological Sciences
Research InstitutionTokyo Institute of Technology

Principal Investigator

和田 忠士  Tokyo Institute of Technology, 大学院・生命理工学研究科, 准教授 (60262309)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 濡木 理  東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 教授 (10272460)
山口 雄輝  東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 助教 (50345360)
半田 宏  東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 教授 (80107432)
Project Period (FY) 2005 – 2007
Project Status Completed (Fiscal Year 2007)
Budget Amount *help
¥29,900,000 (Direct Cost: ¥29,900,000)
Fiscal Year 2007: ¥9,500,000 (Direct Cost: ¥9,500,000)
Fiscal Year 2006: ¥9,500,000 (Direct Cost: ¥9,500,000)
Fiscal Year 2005: ¥10,900,000 (Direct Cost: ¥10,900,000)
Keywords転写 / 遺電子 / タンパク質 / ノックアウトマウス / 発現抑制 / 分化 / マイクロアイレ / ゼブラフイッシュ / 遺伝子 / 構造 / 生化学 / サイトカイン / マイクロアレイ / ゼブラフィッシュ / 蛋白質 / 生体生命情報学
Research Abstract

mRNA合成速度を可変するDECODE複合体は、細胞の発生や分化、癌化過程に関与する。その複合体は、情報読み取り速度を可変することでDECODE回路への情報の流れを制御する。具体的には、転写伸長因子DSIFとNELFによって構成され、キナーゼP-TEFbがセリン・スレオニンのリン酸化でON/0FF活性を調節する。今年度は、試験管内転写実験によりモデル転写因子Ga14-VP16による転写反応の活性化にDSIFとP-TEFbが必須で、DSIFは伸長反応中のRNAポリメラーゼIIの一時停止を回(ポジティブ効果)することを明らかにした。またDSIFのサブユニットの一つであるゼブラフィッシュzSpt5のモルフォリノオリゴによる発現抑制を行い、マイクロアレイを用いた網羅的遺伝子発現解析から赤血球特異的転写因子gata1の発現が低下することがわり、in situハイブリダイゼーション法とレスキュー実験により、gata1遺伝子の発現上昇はDSIFのポジティブ効果に依存することを明らかにした。今年度は、NElF-Aノックアウトマウスの解析を引き続き行った。-/-マウスは早期の胎性致死となるが、そこから単離した-/-ES細胞はfeeder上で増殖することが前年度までに明らかとなったので、NELFが細胞の分化過程に関与するとの予想をたて、ES細胞の多分化能をin vitro分化系により検討した。その結果、-/-細胞では調べた多くの組織特異的マーカーが誘導発現されないことが分かった。ES細胞では繊維芽細胞などの分化した細胞と較べて、転写開始後に制御されている遺伝子が多いことが他のグループによって報告されており、そういった知見も考え合わせると、NELFが特定の分化過程というよりも、もっと根本的な過程-多能性細胞が分化に踏み出す最初のステップーに寄与しているのではないかと考えられる。

Report

(3 results)
  • 2007 Annual Research Report
  • 2006 Annual Research Report
  • 2005 Annual Research Report
  • Research Products

    (18 results)

All 2008 2007 2006 2005

All Journal Article (17 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Presentation (1 results)

  • [Journal Article] Isolation of XAB2 complex involved in pre-mRNA splicing, transcription and transcription-coupled rrepair.2008

    • Author(s)
      Kuraoka I, et. al.
    • Journal Title

      J Biol Chem 283

      Pages: 940-950

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    • Author(s)
      Zhu W, et. al.
    • Journal Title

      Mucleic Acid Res 35

      Pages: 4064-4075

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    • Author(s)
      Agawa Y, et. al.
    • Journal Title

      Mol Cell Biol 27

      Pages: 8739-874

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    • Author(s)
      Yamamoto N et al.
    • Journal Title

      J Virol 81・4

      Pages: 1990-2001

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    • Journal Title

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      Pages: 1-7

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      Aida M et al.
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      Kubo T et al.
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      Nucleic Acid Res 34・21

      Pages: 6264-6271

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      Ogura, Y., et al.
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      Kawano, MA., et al.
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      J.Biol.Chem. (in press)

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      Pages: 357-366

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      Yamada, T., et al.
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      Mol.Cell. 21・2

      Pages: 227-237

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      Nakanishi, K., et al.
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      Pages: 931-932

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      Urano, A., et al.
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      Mol.Cell.Biol. 25・15

      Pages: 6834-6845

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      Pages: 717-731

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      Shimizu, N., et al.
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      Proc.Natl.Acad.Sci. U S A 102・24

      Pages: 8555-8560

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  • [Presentation] Disruption of zebrafish hematopoiesis by knockdown of transcription elongtion factor SPT5.2007

    • Author(s)
      Taneda, et. al.
    • Organizer
      Mechanisms of eukaryotic transcription
    • Place of Presentation
      New York, USA
    • Year and Date
      2007-08-31
    • Related Report
      2007 Annual Research Report

URL: 

Published: 2005-04-01   Modified: 2018-03-28  

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