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構造変化から見る生命エネルギー変遷の進化メカニズムとそれを利用した応用生物工学

Research Project

Project/Area Number 17360400
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Allocation TypeSingle-year Grants
Section一般
Research Field Biofunction/Bioprocess
Research InstitutionHiroshima University

Principal Investigator

黒田 章夫  Hiroshima University, 大学院・先端物質科学研究科, 教授 (50205241)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 片柳 克夫  広島大学, 大学院・理学研究科, 准教授 (20291479)
Project Period (FY) 2005 – 2008
Project Status Completed (Fiscal Year 2008)
Budget Amount *help
¥17,550,000 (Direct Cost: ¥15,300,000、Indirect Cost: ¥2,250,000)
Fiscal Year 2008: ¥4,810,000 (Direct Cost: ¥3,700,000、Indirect Cost: ¥1,110,000)
Fiscal Year 2007: ¥4,940,000 (Direct Cost: ¥3,800,000、Indirect Cost: ¥1,140,000)
Fiscal Year 2006: ¥3,800,000 (Direct Cost: ¥3,800,000)
Fiscal Year 2005: ¥4,000,000 (Direct Cost: ¥4,000,000)
Keywordsアデノシン三リン酸 / 生命エネルギー / ポリリン酸 / グルコキナーゼ / 構造解析 / 進化 / 耕造解析
Research Abstract

アデノシン三リン酸(ATP)は生命エネルギーの通貨と言われ、多くの酵素がATPをエネルギー源あるいはリン酸化の基質として利用している。ポリリン酸(polyP)はATPと同じ高エネルギーリン酸結合からなる無機ポリマーであり、原始生命が生まれた環境中に多く存在したと考えられている。Pillipsらの仮説によればATPグルコキナーゼ(ATP-GK)はポリリン酸グルコキナーゼ(PolyP-GK)から進化したものとされている。我々はATP-GKとPolyP-GKの立体構造を詳細に比較して、ポリリン酸を基質にする動作原理と、ポリリン酸からATPへ変化した生命エネルギー変遷の進化メカニズムを解明することを目的とした。スプリング8においてPolyP-GKの結晶を解析し、得られた回折像から構造解析を行った。PolyP-GKには、長鎖ポリリン酸に結合すると考えられる超塩基性領域(Lys222, Lys223, Lys226, Lys230, Lys232、 Lys234の6つのリジン残基が三次元構造上で一直線に並ぶ領域)が存在した。この領域はビフィズス菌由来のポリリン酸とATPの両方を利用するグルコキナーゼ(PolyP/ATP-GK)の立体構造には見られないこと、またこの領域がATP結合を阻害すると考えられることから、PolyP-GKは明らかに特別に進化した形であることが予想できた。このことから、原始タイプとしてPolyP/ATP-GKが存在し、一部はPolyP-GKへ、また一部はATP-GKへと別々に進化したとする独自のモデルを提唱した。

Report

(4 results)
  • 2008 Annual Research Report
  • 2007 Annual Research Report
  • 2006 Annual Research Report
  • 2005 Annual Research Report
  • Research Products

    (11 results)

All 2008 2007 2006 2005

All Journal Article (8 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (1 results) Book (1 results) Patent(Industrial Property Rights) (1 results)

  • [Journal Article] 耐熱性ポリリン酸キナーゼを用いたATP再生系と物質生産2008

    • Author(s)
      廣田隆一, 黒田章夫
    • Journal Title

      バイオインダストリー 25

      Pages: 21-28

    • Related Report
      2008 Annual Research Report
  • [Journal Article] 解明進む大腸菌ポリリン酸代謝調節機構2008

    • Author(s)
      黒田章夫, 本村圭
    • Journal Title

      化学と生物 46

      Pages: 173-179

    • NAID

      10021176809

    • Related Report
      2008 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Use of an Escherichia coli recombinant producing thermostable polyphosphate kinase as an ATP regenerator to produce fructose 1,6-diphoaphate2007

    • Author(s)
      S. Iwamoto, K. Motomura, Y. Shinoda, M. Urata, J. Kato, N. Takiguchi, H. Ohtake, R. Hirota, A. Kuroda
    • Journal Title

      Applied and Environmental Microbiology 73

      Pages: 5676-5678

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Polyphosphate-ATP Amplification Technology : Principle and its Application to Specific Bacteria Detection2006

    • Author(s)
      Yasuo Asami, Tetsuya Satoh, Akio Kuroda
    • Journal Title

      Journal of Environmental Biotechnology 6, 2

      Pages: 105-108

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] Polyamines affect polyphosphate accumulation in Echerichia coli2006

    • Author(s)
      K.Motomura, N.Takiguchi, H.Ohtake, A.Kuroda
    • Journal Title

      J. Environ. Biotech 6

      Pages: 41-46

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] Inorganic polyphosphate stimulates Lon-mediated proteolysis of nucleoid proteins in Escherichia coli2006

    • Author(s)
      K Nomura, J.Kato, N.Takiguchi, H.Ohtake, A.Kuroda
    • Journal Title

      Cell. Mol. Biol. 52

      Pages: 23-29

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] A polyphosphate-Lon protease complex in the adaptation of Escherichia coli to amino acid starvation2006

    • Author(s)
      Akio Kuroda
    • Journal Title

      Biosci.Biotechnol.Biochem. 70

      Pages: 325-331

    • NAID

      10018533868

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      2005 Annual Research Report
  • [Journal Article] リン資源枯渇の危機予測とそれに対応したリン有効利用技術開発2005

    • Author(s)
      黒田章夫, 滝口 昇, 加藤純一, 大竹久夫
    • Journal Title

      環境バイオテクノロジー学会誌 4

      Pages: 87-94

    • Related Report
      2005 Annual Research Report
  • [Presentation] 耐熱性ポリリン酸キナーゼを用いたリン酸化合物生産のプラットホーム構築2008

    • Author(s)
      黒田章夫
    • Organizer
      日本生物工学会
    • Place of Presentation
      仙台
    • Year and Date
      2008-08-29
    • Related Report
      2008 Annual Research Report
  • [Book] バイオプロセスハンドブック2007

    • Author(s)
      黒田章夫
    • Publisher
      NTS出版
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 大腸菌を用いたリン酸化反応方法2005

    • Inventor(s)
      黒田 章夫
    • Industrial Property Rights Holder
      広島大学
    • Industrial Property Number
      2005-341514
    • Filing Date
      2005-11-28
    • Related Report
      2005 Annual Research Report

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Published: 2005-04-01   Modified: 2016-04-21  

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