• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to previous page

分布関数を用いた細胞核内の微環境の解析と新しい細胞像の構築

Research Project

Project/Area Number 17657061
Research Category

Grant-in-Aid for Exploratory Research

Allocation TypeSingle-year Grants
Research Field Cell biology
Research InstitutionHokkaido University

Principal Investigator

金城 政孝  北海道大学, 電子科学研究所, 助教授 (70177971)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 中村 美浩  名古屋工業大学, 大学院工学研究科, 助教授 (50155868)
Project Period (FY) 2005 – 2006
Project Status Completed (Fiscal Year 2006)
Budget Amount *help
¥3,000,000 (Direct Cost: ¥3,000,000)
Fiscal Year 2006: ¥800,000 (Direct Cost: ¥800,000)
Fiscal Year 2005: ¥2,200,000 (Direct Cost: ¥2,200,000)
Keywords拡散測定 / 分布関数 / 微環境 / 細胞質 / 分子間相互作用
Research Abstract

蛍光相関分光法はこれまで細胞内の微環境を解析できる手法として用いられるようになってきた。これまで多くの研究ではFCSの測定で得られる分子の動きの成分は最大3つであると仮定してきた。ところで細胞の中でのタンパク質や分子の動きを示すのに、平均値などの一つの代表値だけで十分なのであろうか?細胞の中は様々な構造体を有し、その分布も様々であろう。また、同じ場所でも時間によっても変化していることが予想される。これまでの3成分解析を一挙に多成分に拡張するには、これまでの方程式の成分を単純に増やすのではなく、新たなアルゴリズムを導入することが必要とされる。そこで我々は散乱測定に既に用いられ数々の成果を上げているCONTINを利用した。初年度は解析法の開発を行い,2年度はモデル系で得られた測定データの解析を行い,モデルと結果の間の関係を明らかにしつつ,さらなる解析法の確立を行った。
測定した系は、蛋白の凝集体をモデルとして、アミロイドベータ蛋白質の一部を利用して凝集過程を解析した。時間とともに凝集する過程を分布関数として解析し、表現することができた。蛍光標識オリゴDNAを細胞内に導入してオリゴDNAの動きを拡散時間の分布で解析した
これまでのような2種類の拡散定数(または拡散時間)とその割合という単純な表現ではなく、二つのピークを中心に様々な動きを持った分布をしていることを示している。溶液の中の拡散運動とは異なり、細胞の中ではひとつの分子種でもその動きには幅があることが予想され、分布関数として表現するのが妥当だろうことが示された。今後は,さらに,この手法を空間相関へと展開し,新たな細胞像を構築したいと考えている。

Report

(2 results)
  • 2006 Annual Research Report
  • 2005 Annual Research Report
  • Research Products

    (19 results)

All 2006 2005

All Journal Article (19 results)

  • [Journal Article] Quantification of size distribution of restriction fragments in mitochondrial genome using fluorescence correlation spectroscopy2006

    • Author(s)
      Y.Nomura, H.Fuchigami, H.Kii, Z.Feng, T.Nakamura, M.Kinjo
    • Journal Title

      Experimental and Molecular Pathology 80・3

      Pages: 275-278

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] A fluorescent variant of a protein from the stony coral Montipora facilitates dual-color single-laser fluorescence cross-correlation spectroscopy2006

    • Author(s)
      T.Kogure, S.Karasawa, T.Araki, K.Saito, M.Kinjo, A.Miyawaki
    • Journal Title

      Nat Biotechnol 30

      Pages: 577-581

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] Iuorescence cross-correlation analyses of molecular interaction between an Aux/IAA protein, MSG2/IAA19, and protein-protein interaction domains of auxin response factors of Arabidopsis expressed in HeLa cells2006

    • Author(s)
      H.Muto, N.Issei, T.Demura, H.Fukuda, M.Kinjo, K.Yamamoto
    • Journal Title

      Plant Cell Physiol 47

      Pages: 1095-1101

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] Lateral Mobility of Membrane-Binding Proteins in Living Cells Measured by Total Internal Reflection Fluorescence Correlation Spectroscopy.2006

    • Author(s)
      Y.Ohsugi, K.Saito, M.Tamura, M.Kinjo
    • Journal Title

      Biophys J. 91・9

      Pages: 3456-3464

    • NAID

      120000958503

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] Control of the optical properties of quantum dots by surface coating with calix[n]arene carboxylic acids2006

    • Author(s)
      T.Jin, F.Fujii, E.Yamada, Y.Nodasaka, M.Kinjo
    • Journal Title

      J American Chemical Society 128・29

      Pages: 9288-9289

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] Dynamics of yeast prion aggregates in single living cells.2006

    • Author(s)
      S.Kawai-Noda, S.Ayano, C.Back, M.Kinjo, M.Yoshida, K.Yasuda, H.Taguchi
    • Journal Title

      Genes to Cells 11

      Pages: 1085-1096

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] Cytosolic chaperonin prevents polyglutamine toxicity with altering the aggregation state2006

    • Author(s)
      A.Kitamura, H.Kubota, C.Back, G.Matsumoto, S.Hirayama, Y.Takahashi, H.Kimura, M.Kinjo, R.Morimoto, K.Nagata
    • Journal Title

      Nature Cell Biology 8・10

      Pages: 1163-1169

    • NAID

      120005549596

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] The regulator of the F1 motor : Inhibition of rotation of cyanobacterial F1-ATPase by the ε subunit.2006

    • Author(s)
      H.Konnno, T.Murakami, F.Fujii, F.Koyama, H.Ueoka-Nakanishi, C.Back, M.Kinjo, T.Hisabori
    • Journal Title

      EMBO J 25・19

      Pages: 4596-4604

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] Protein-protein interaction analysis by C-terminally specific fluorescence labeling and fluorescence cross-correlation spectroscopy.2006

    • Author(s)
      R.Oyama, H.Takahashi, M.Yonezawa, N.Doi, E.Miyamoto-Sato, M.Kinjo, H.Yanagawa
    • Journal Title

      Necleic Acids Research 34・14

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] Analysis of membrane-binding protein mobility in living cells using total internal reflection fluorescence correlation spectroscopy2006

    • Author(s)
      Y.Ohsugi, M.Kinjo
    • Journal Title

      Biophysical Review and Letters 1・3

      Pages: 293-299

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] Microenvironment and effect of energy depletion in the nucleus analyzed by mobility of multiple oligomeric EGFPs.2006

    • Author(s)
      C.Back, K.Saito, M.Tamura, M.Kinjo
    • Journal Title

      Biophys J. 91

      Pages: 3921-3936

    • NAID

      120000954034

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] 細胞生物学における蛍光相関分光法と蛍光相互相関分光法2006

    • Author(s)
      三國 新太郎, 金城 政孝
    • Journal Title

      蛋白核酸酵素 51

      Pages: 1998-2005

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] Quantification of size distribution of restriction fragments in mitochondrial genome using fluorescence correlation spectroscopy2006

    • Author(s)
      Yasutomo Nomura, Hirobumi Fuchigami, Hiroaki Kii, Zhonggang Feng, Takao Nakamura, Masataka Kinjo
    • Journal Title

      Experimental and Molecular Pathology (In press)

    • Related Report
      2005 Annual Research Report
  • [Journal Article] Detection of oxidative stress-induced mitochondrial DNA damage using fluorescence correlation spectroscopy2006

    • Author(s)
      Yasutomo Nomura, Hirobumi Fuchigami, Hiroaki Kii, Zhonggang Feng, Takao Nakamura, Masataka Kinjo
    • Journal Title

      Analytical Biochemistry (In press)

    • Related Report
      2005 Annual Research Report
  • [Journal Article] 蛍光寿命イメージングシステムの作成と生体試料および高分子試料への応用2006

    • Author(s)
      中林孝和, 飯森俊文, 金城政孝, 太田信廣
    • Journal Title

      分光研究 55

      Pages: 31-39

    • Related Report
      2005 Annual Research Report
  • [Journal Article] Interaction of a small heat shock protein of the fission yeast, Schizosaccharomyces pombe, with a denatured protein at elevated temperature2005

    • Author(s)
      Maya Hirose, Hideki Tohda, Yuko Giga一Hama, Reiko Tsushima, Tamotsu Zako, Ryo Iizuka, Changi Pack, Masataka Kinjo, Noriyuki Ishii, Masafumi Yohda
    • Journal Title

      J.Biol.Chem 280

      Pages: 32586-32593

    • Related Report
      2005 Annual Research Report
  • [Journal Article] Amphiphilic p-sulfonatocalix[4]arene-coated CdSe-ZnS quantum dots for the optical detection of the neurotransmitter acetylcholine2005

    • Author(s)
      Takashi Jin, Fumihiko Fujii, Hiroshi Sakata, Mamoru Tamura, Masataka Kinjo
    • Journal Title

      Chem. Commun.

      Pages: 4300-4302

    • Related Report
      2005 Annual Research Report
  • [Journal Article] Analysis of Cellular Functions by Multipoint Fluorescence Correlation Spectroscopy2005

    • Author(s)
      Yasuo Takahashi, Ryuji Sawada, Kiyochika Ishibashi, Sintarou Mikuni, Masataka kinjo
    • Journal Title

      Current Pharmaceutical Biotechnology 6

      Pages: 156-159

    • Related Report
      2005 Annual Research Report
  • [Journal Article] Calixarene-coated water-soluble CdSe/ZnS semiconsuctor quantum dots that are highly fluorescent and stable in aqueous solution2005

    • Author(s)
      Takashi Jin, Fumihiko Fujii, Hiroshi Sakata, Mamoru Tamura, Masataka Kinjo
    • Journal Title

      Chem. Commun.

      Pages: 2829-2831

    • Related Report
      2005 Annual Research Report

URL: 

Published: 2005-04-01   Modified: 2016-04-21  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi