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プラスミド様2本鎖RNAレプリコンの起源と進化

Research Project

Project/Area Number 17657078
Research Category

Grant-in-Aid for Exploratory Research

Allocation TypeSingle-year Grants
Research Field Evolutionary biology
Research InstitutionTokyo University of Agriculture and Technology

Principal Investigator

福原 敏行  東京農工大学, 大学院共生科学技術研究院, 助教授 (90228924)

Project Period (FY) 2005 – 2006
Project Status Completed (Fiscal Year 2006)
Budget Amount *help
¥3,400,000 (Direct Cost: ¥3,400,000)
Fiscal Year 2006: ¥1,500,000 (Direct Cost: ¥1,500,000)
Fiscal Year 2005: ¥1,900,000 (Direct Cost: ¥1,900,000)
Keywords2本鎖RNA / レプリコン / プラスミド / Totivirus Chrysovirus / RNA依存RNA合成酵素 / ヤマヨツボシオオアリ / Alternalia alternata / 2本鎖 / Endornavirus / 紫紋羽病菌
Research Abstract

私たちは、1990年代から、宿主植物に対して病徴を示さず、宿主細胞に一定量存在し、垂直(種子)伝播するといったプラスミド様の性質をもち自己複製する2本鎖RNAレプリコンが種々の植物から検出されることを報告してきた。さらに、菌類、原生生物、昆虫からも同様な性質を示す2本鎖RNAが検出される。本研究では、植物だけでなく菌類、昆虫から検出される2本鎖RNAについて、塩基配列を中心とした分子構造を明らかにし、プラスミド様2本鎖RNAレプリコンの普遍性について明らかにした。
植物病原菌Alternalia alternate EGS35-193株からは、3.6-1.5kbpの4成分の2本鎖RNAが検出される。L鎖(3.6kbp)を鋳型としてcDNAクローニングをおこない全長の塩基配列を決定したところ、L鎖はTotivirusとChrysovirusのRNA依存RNA合成酵素(複製酵素)に相同性を示すタンパク質をコードするが、その相同性は低く、新規な2本鎖RNAウイルスに分類されうる可能性が示された。
昆虫ヤマヨツボシオオアリ(Camponotus yamaokai)からは、約6.3kbpの2本鎖RNAが検出される。この2本鎖RNAを鋳型にcDNAクローニングをおこない、約5kbpの塩基配列を決定・解析したところ、この2本鎖RNAは、TotivirusのRNA依存RNA合成酵素に相同性を示すタンパク質をコードすることが分かった。この結果は、昆虫に存在するプラスミド様2本鎖レプリコンから得られた初めての塩基配列情報である。また、Totivirusは、植物、原生生物、菌類から検出されていることから、動物(昆虫)も含めて、真核生物全般に分布するプラスミド様の性質を示す2本鎖RNAレプリコン(ウイルス)であることが示された。

Report

(2 results)
  • 2006 Annual Research Report
  • 2005 Annual Research Report
  • Research Products

    (8 results)

All 2007 2006 2005 Other

All Journal Article (5 results) Book (2 results) Patent(Industrial Property Rights) (1 results)

  • [Journal Article] The dsRNA-binding protein DRB4 interacts with the Dicer-like protein DCL4 in vivo and functions in the trans-acting siRNA pathway.2007

    • Author(s)
      Nakazawa Y., Hiraguri A., Moriyama H., Fukuhara T.
    • Journal Title

      Plant Molecular Biology 63

      Pages: 777-785

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] The wide distribution of endornaviruses, large double-stranded RNA replicons with plasmid-like properties.2006

    • Author(s)
      Fukuhara T., Koga R., Aoki N., Yuki C., Yamamoto N., Oyama N., Udagawa T., Horiuchi H., Miyazaki S., Higashi Y., Takeshita M., Ikeda K., Arakawa M., Matsumoto N., Moriyama H.
    • Journal Title

      Archives of Virology 151

      Pages: 995-1002

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] Specific interactions between Dicer-like proteins and HYL1/DRB-family dsRNA-binding proteins in Arabidopsis thaliana.2005

    • Author(s)
      Hiraguri A, Itoh R, Kondo N, Nomura Y, Aizawa D, Murai Y, Koiwa H, Seki M, Shinozaki K, Fukuhara T.
    • Journal Title

      Plant Molecular Biology 57

      Pages: 173-188

    • Related Report
      2005 Annual Research Report
  • [Journal Article] Diurnal expression of five protein phosphatase type 2C genes in the common ice plant, Mesembryanthemum crystallinum.

    • Author(s)
      Sato K., Ohsato H., Izumi S., Miyazaki S., Bohnert H.J., Moriyama H., Fukuhara T.
    • Journal Title

      Functional Plant Biology (in press)

    • Related Report
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  • [Journal Article] The wide distribution of endornaviruses, large double-stranded RNA replicons with plasmid-like properties.

    • Author(s)
      Fukuhara T., Koga R., Aoki N., Yuki C., Yamamoto N., Oyama N., Udagawa T., Horiuchi H., Miyazaki S., Higashi Y., Takeshita M., Ikeda K., Arakawa M., Matsumoto N., Moriyama H.
    • Journal Title

      Archives of Virology (in press)

    • Related Report
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  • [Book] Genus Endornavirus. In Virus Taxonomy : Eighth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses.2005

    • Author(s)
      Gibbs MJ, Pfeiffer P, Fukuhara T
    • Publisher
      Elsevier/Academic Press
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  • [Book] Endornaviruses in "Encyclopedia of Virology, Third Edition"

    • Author(s)
      Fukuhara T., Moriyama H.
    • Publisher
      Elsevier(in press)
    • Related Report
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  • [Patent(Industrial Property Rights)] 組換えベクターおよびその作製方法、ならびに、組換えタンパク質およびその産生方法2005

    • Inventor(s)
      福原敏行, 森山裕充
    • Industrial Property Rights Holder
      東京農工大学
    • Industrial Property Number
      2005-147256
    • Filing Date
      2005-05-19
    • Related Report
      2005 Annual Research Report

URL: 

Published: 2005-04-01   Modified: 2016-04-21  

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