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多細胞生物様の細胞分化により誘導される野性型枯草菌のバイオフィルム形成機構の解析

Research Project

Project/Area Number 17681023
Research Category

Grant-in-Aid for Young Scientists (A)

Allocation TypeSingle-year Grants
Research Field 基礎ゲノム科学
Research InstitutionNara Institute of Science and Technology

Principal Investigator

小林 和夫  Nara Institute of Science and Technology, 情報科学研究科, 助教 (70324978)

Project Period (FY) 2005 – 2007
Project Status Completed (Fiscal Year 2007)
Budget Amount *help
¥28,990,000 (Direct Cost: ¥22,300,000、Indirect Cost: ¥6,690,000)
Fiscal Year 2007: ¥6,370,000 (Direct Cost: ¥4,900,000、Indirect Cost: ¥1,470,000)
Fiscal Year 2006: ¥6,370,000 (Direct Cost: ¥4,900,000、Indirect Cost: ¥1,470,000)
Fiscal Year 2005: ¥16,250,000 (Direct Cost: ¥12,500,000、Indirect Cost: ¥3,750,000)
Keywordsバイオフィルム / 枯草菌 / 鞭毛形成 / 糖代謝 / バイオフィル / 形態形成 / 鞭毛形 / 転写因子
Research Abstract

1.鞭毛形成と共役したペリクル形成開始の制御motAやhag遺伝子など鞭毛形成後期遺伝子の欠損株では、ペリクル形成の遅延が見られる。それらの変異株では、ペリクル形成開始に必要な転写因子SlrRの活性が低下していた。また、枯草菌実験室株では、SlrR制御下の遺伝子群の発現が低下していることを見出し、その原因を探った結果、実験室株ではSlrAと名付けた遺伝子の発現が低下していることが明らかになった。SlrAは、SlrRのC末端側のドメインと高い相同性を持つこと、slrA欠損株では、SlrRの活性が消失することから、SlrAはSlrRと複合体を形成して機能していると考えられた。motAやhag変異がSlrR/SlrAにどのように影響するのかさらに解析を進めている。
2.DegUによる代謝制御
枯草菌のペリクル形成は、炭素源の量に依存して促進される。野性株を1%グリセロールを含む培地で培養した場合、対数増殖期には、炭素源の消費に伴い生じる酢酸などの酸の分泌により培地pHが低下し続けるが、定常期にはいるとTCA回路の活性に依存して培地pHが中性になる。しかし、degU変異株では,定常期に培地pHが酸性化じ、degUが糖代謝に何らかの役割を果たしていることが示唆された。しかし、degU変異では、解糖系、TCを構成する遺伝子群の発現に大きな影響は見られなかった。培地pHが酸性になると、定常期に活性化するシグマ因子σHが、不安定化するが、degU変異株でも、σHで転写されるkinA,spoVGの発現が低下していた。また、spoVG変異株では、degUと同様に、定常期に培地pHの低下が見られた。このことから、σHの活性化自体が定常期のpH上昇に必要であること、DegUがσHの活性化に関与している可能性が示唆された。

Report

(3 results)
  • 2007 Annual Research Report
  • 2006 Annual Research Report
  • 2005 Annual Research Report
  • Research Products

    (7 results)

All 2008 2007 2006

All Journal Article (7 results) (of which Peer Reviewed: 5 results)

  • [Journal Article] kinA mRNA is missing a stop codon in the undomesticated Bacillussubtilis strain ATCC 60512008

    • Author(s)
      Kobayashi K, et. al.
    • Journal Title

      Microbiology 154

      Pages: 54-63

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Bacillus subtilis pellicle formation proceeds through genetically defined morphological changes2007

    • Author(s)
      Kobayashi K
    • Journal Title

      Journal of Bacteriology 189

      Pages: 4920-4931

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Gradual activation of the response regulator DegU controls serial expression of genes for flagellum formation and biofilm formation in Bacillus subtilis2007

    • Author(s)
      Kobyyashi K
    • Journal Title

      Molecular Microbiology 66

      Pages: 395-409

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The MarR-type repressor MhqR (YkvE) regulates multiple dioxygenases/glyoxalases and an azoreductase which confer resistance to 2-methylhydroquinone and catechol in Bacillus subtilis.2007

    • Author(s)
      Towa S, et. al.
    • Journal Title

      Molecular Microbiology 66

      Pages: 40-54

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Dual negative control of spx transcription initiation from the P3 promoter by repressors PerR and YodB in Bacillus subtilis2007

    • Author(s)
      Leelakriangsak M, et. al.
    • Journal Title

      Journal of Bacteriology 189

      Pages: 1736-1744

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Dual negative control of spx transcription initiation from the P3 promoter by repressors PerR and YodB in Bacillus subtilis.2007

    • Author(s)
      Leelakriangsak M
    • Journal Title

      J. Bacteriol 189

      Pages: 1736-1744

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] The nitric oxide-responsive regulator NsrR controls ResDE-dependent gene expression.2006

    • Author(s)
      Nakano MM
    • Journal Title

      J. Bacteriol 188

      Pages: 5878-5887

    • Related Report
      2006 Annual Research Report

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Published: 2005-04-01   Modified: 2016-04-21  

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