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原子レベルでの構造解析に基づくウィルスのDNAパッケージングモーターの動作基盤

Research Project

Project/Area Number 17687014
Research Category

Grant-in-Aid for Young Scientists (A)

Allocation TypeSingle-year Grants
Research Field Biophysics
Research InstitutionTokyo Institute of Technology

Principal Investigator

金丸 周司  Tokyo Institute of Technology, 大学院・生命理工学研究科, 助教 (50376951)

Project Period (FY) 2005 – 2007
Project Status Completed (Fiscal Year 2007)
Budget Amount *help
¥19,370,000 (Direct Cost: ¥14,900,000、Indirect Cost: ¥4,470,000)
Fiscal Year 2007: ¥3,250,000 (Direct Cost: ¥2,500,000、Indirect Cost: ¥750,000)
Fiscal Year 2006: ¥3,250,000 (Direct Cost: ¥2,500,000、Indirect Cost: ¥750,000)
Fiscal Year 2005: ¥12,870,000 (Direct Cost: ¥9,900,000、Indirect Cost: ¥2,970,000)
Keywords蛋白質 / ウイルス / 分子機械 / 複合体 / 分子モーター / 分子認識 / ウィルス / バクテリオファージ / DNAパッケージング
Research Abstract

本研究は、T4ファージを対象として、DNAがウィルス頭殻に詰め込まれる現象を原子レベルで明らかにしようとするものである。本年度の成果は下記の通りである:
1.ネック蛋白質の発現・精製
ネック蛋白質(gp13,gp14)について、発現・精製を行った。gp13,gp14はそれぞれ、単独で精製することに成功し、それぞれが単量体で存在することがわかった。また、0.4M以上濃度の硫酸アンモニウム存在下で二つの蛋白質を混合すると、(gp13)_<10>-(gp14)_5からなる複合体が形成することがわかった。
2.ネック蛋白質の物理化学的解析
上記(gp13)_<10>-(gp14)_5の電子顕微鏡観察、超遠心分析を行いこの複合体が溶液中で均一のリング状の構造を持ち、ファージ粒子中に存在する複合体であることを示した。
3.結晶化、構造解析
gp13,(gp13)_<10>-(gp14)_5について、結晶化に適した精製試料を用いて結晶化を試みている。具体的には、市販のグローバルな結晶化条件スクリーニングキットを用いて、蒸気拡散法により結晶化条件の初期検索を行っている。現在、構造解析に向けて充分な質と大きさを持った結晶を得るための条件を探索中である。

Report

(3 results)
  • 2007 Annual Research Report
  • 2006 Annual Research Report
  • 2005 Annual Research Report
  • Research Products

    (26 results)

All 2008 2007 2006 2005

All Journal Article (10 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Presentation (15 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Molecular design of heteroprotein assemblies providing a bionanocup as a chemical reactor.2008

    • Author(s)
      Koshiyama T, Yokoi N, Ueno T, Kanamaru S, Nagano S, Shiro Y, Arisaka F, Watanabe Y.
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      Small 4

      Pages: 50-54

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    • Journal Title

      Acta Crystallogr D Biol Crystallogr. 63

      Pages: 9-16

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      Akhter T, Zhao L, Kohda A, Mio K, Kanamaru S, Arusaka F.
    • Journal Title

      Biochim Biophys Acta. 1774

      Pages: 1036-1043

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      金丸周司、有坂文雄
    • Journal Title

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      金丸周司、有坂文雄
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      日本結晶学会誌 49

      Pages: 161-170

    • NAID

      10019748100

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    • Journal Title

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      Pages: 4508-4512

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      蛋白質・核酸・酵素 50・10

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    • Total Pages
      358
    • Publisher
      シーエムシー出版
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Published: 2005-04-01   Modified: 2016-04-21  

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