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東京湾における窒素循環プロセスの解明に関する研究

Research Project

Project/Area Number 17688009
Research Category

Grant-in-Aid for Young Scientists (A)

Allocation TypeSingle-year Grants
Research Field General fisheries
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

浦川 秀敏  The University of Tokyo, 海洋研究所, 准教授 (90370262)

Project Period (FY) 2005 – 2007
Project Status Completed (Fiscal Year 2007)
Budget Amount *help
¥25,480,000 (Direct Cost: ¥19,600,000、Indirect Cost: ¥5,880,000)
Fiscal Year 2007: ¥6,500,000 (Direct Cost: ¥5,000,000、Indirect Cost: ¥1,500,000)
Fiscal Year 2006: ¥6,500,000 (Direct Cost: ¥5,000,000、Indirect Cost: ¥1,500,000)
Fiscal Year 2005: ¥12,480,000 (Direct Cost: ¥9,600,000、Indirect Cost: ¥2,880,000)
Keywords窒素循環 / 環境微生物 / 東京湾 / 富栄養化 / 硝化作用 / 環境修複 / 水質汚染 / 環境修復
Research Abstract

東京湾の硝化細菌に関する研究
東京湾における水質調査をこれまで,東京都環境局や東京都環境科学研究所などと連携をとりながら行ってきた。この中で特に,硝化に重要な役目を果たすアンモニア酸化細菌に着目して,これらの細菌の多様性を解析したり,群集構造を把握したり,定量法を確立するための研究を行ってきた。
・運河堆積物がもつ環境浄化能力について
東京湾につながっている運河の堆積物が持つ脱窒作用についてリアクターを作成して研究を行ってきた。その結果,運河の堆積物が強い脱窒作用をもつことを確認した。
・硝化細菌の単離
硝化細菌の分離菌株を得るために培養試料からの菌株の純化を試みてきた。これまでに一株の純粋分離に成功したが,それ以外のほとんどの菌株に関しては純化に至っていない。
・マイクロアレイを用いた環境微生物研究
また,さまざまなDNAマイクロアレイを作成し,作成したアレイをさまざまな環境試料に適用した。そのなかで,微生物群集構造を明らかにするマイクロアレイ,難分解性物質の分解に寄与する機能遺伝子を標的としたマイクロアレイを作成してきた。またアンモニア酸化細菌の全ゲノムをもとに作成したアレイを用いた化学物質暴露に対する発現解析なども行ってきた。
・アンモニア酸化古細菌の動態に関する研究
近年,古細菌の系統にアンモニア酸化細菌が含まれていることが見つかった。その微生物に関する知見を得るために,その菌が多く存在すると考えられる水族館濾過槽に着目して研究を行った。この中で,この古細菌に含まれるアンモニア酸化菌の多様性は普通のアンモニア酸化細菌のそれを上回ることが明らかになった。

Report

(3 results)
  • 2007 Annual Research Report
  • 2006 Annual Research Report
  • 2005 Annual Research Report
  • Research Products

    (11 results)

All 2008 2007 2006 2005

All Journal Article (9 results) (of which Peer Reviewed: 5 results) Presentation (1 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] DNA microarray mediated transcriptional profiling of Nitrosomonas europaea in response to linear alkylbenzene sulfonates2008

    • Author(s)
      Urakawa, H., J. Matsumoto, K. Inaba and S. Tsuneda
    • Journal Title

      FEMS Microbiology Letters(掲載確定) 印刷中

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Low temperature diminishes phylogenetic diversity of ammonia-oxidizing archaea and bacteria in aquarium biofiltration systems2008

    • Author(s)
      Urakawa, H., Y. Tajima, Y. Numata and S. Tsuneda
    • Journal Title

      Applied and Environmental Microbiology Vol.74,No.3

      Pages: 894-900

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    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] T-BAPS: a Bayesian statistical tool for comparison of microbial communities using terminal-restriction fragment length polymorphism (T-RFLP) data2007

    • Author(s)
      Tang, J., J. Tao, H. Urakawa and J. Corander
    • Journal Title

      Statistical Applications in Genetics and Molecular Biology 6:Iss.1(Article)

      Pages: 30-30

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Development of a 60-mer oligonucleotide microarray on the basis of benzene monooxygenase gene diversity2007

    • Author(s)
      Iwai, S., F. Kurisu., H. Urakawa, O. Yagi and H. Furumai
    • Journal Title

      Applied Microbiology and Biotechnology 75

      Pages: 929-939

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Direct profiling of rRNA in saline wastewater treatment samples using an oligonucleotide microarray2007

    • Author(s)
      Urakawa, H., J. Matsumoto, T. Hoshino and S. Tsuneda
    • Journal Title

      Microbes and Environments 22

      Pages: 116-122

    • NAID

      110006290373

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    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Abundance and population structure of ammonia-oxidizing bacteria that inhabit canal sediments receiving effluents from municipal wastewater treatment plants2006

    • Author(s)
      Urakawa, H., H.Maki, S.Kawabata, I.Fujiwara, H.Ando, T.Kawai, T.Hiwatari, K.Kohata, M.Watanabe
    • Journal Title

      Applied and Environmental Microbiology 72

      Pages: 6845-6850

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] Characterization and quantification of ammonia-oxidizing bacteria in eutrophic coastal marine sediments using polyphasic molecular approaches and immunofluorescence staining2006

    • Author(s)
      Urakawa, H, S.Kurata, I.Fujiwara, D.Kuroiwa, H.Maki, S.Kawabata, T.Hiwatari, H.Ando, T.Kawai, M.Watanabe, K.Kohata
    • Journal Title

      Environmental Microbiology 8

      Pages: 787-803

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  • [Journal Article] DNA microarray detection of nitrifying bacterial 16S rRNA in wastewater treatment plant samples2005

    • Author(s)
      Kelly, JJ., S.Siripong, J., McCormack, LR.Janus, H.Urakawa, S.El Fantroussi, PA.Noble, L.Sappelsa, BE.Rittmann, DA.Stahl
    • Journal Title

      Water Research 39

      Pages: 3229-3238

    • Related Report
      2005 Annual Research Report
  • [Journal Article] Characterization of depth-related and site-specific differences of microbial communities in marine sediments using quinone profiles2005

    • Author(s)
      Urakawa, H., T.Yoshida, M.Nishimura, K.Ohwada
    • Journal Title

      Fisheries Science 71

      Pages: 174-182

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  • [Presentation] 閉鎖性水域での物質循環と微生物2007

    • Author(s)
      浦川 秀敏
    • Organizer
      第17回東京大学環境安全研究センターシンポジウム「水環境の保全と水質の制御」
    • Place of Presentation
      東京大学
    • Year and Date
      2007-12-25
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Book] 水族館の仕事(猿渡敏郎, 西源二郎編著)「縁の下の力持ち-濾過バクテリアの話-」(部分執筆)2007

    • Author(s)
      浦川 秀敏
    • Total Pages
      243
    • Publisher
      東海大学出版会
    • Related Report
      2007 Annual Research Report

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Published: 2005-04-01   Modified: 2016-04-21  

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