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網羅的遺伝子発現解析とQTL解析を組合せた新規2型糖尿病ラットの糖尿病遺伝子探索

Research Project

Project/Area Number 17700375
Research Category

Grant-in-Aid for Young Scientists (B)

Allocation TypeSingle-year Grants
Research Field Laboratory animal science
Research InstitutionResearch Institute, International Medical Center of Japan

Principal Investigator

岡村 匡史  国立国際医療センター(研究所), 研究所感染症制御研究部, 室長 (00333790)

Project Period (FY) 2005 – 2006
Project Status Completed (Fiscal Year 2006)
Budget Amount *help
¥3,600,000 (Direct Cost: ¥3,600,000)
Fiscal Year 2006: ¥1,000,000 (Direct Cost: ¥1,000,000)
Fiscal Year 2005: ¥2,600,000 (Direct Cost: ¥2,600,000)
KeywordsLEA / Sendaiラット / 糖尿病モデル / 量的形質遺伝子座(QTL) / 網羅的遺伝子発現解析 / SENDAIラット / DNAマイクロアレイ / 軽症糖尿病
Research Abstract

LEA/Sendaiラット(以下Sendaiラット)は非肥満とインスリン分泌能低下を主徴とする、非肥満型糖尿病モデルラットである。量的形質遺伝子座(QTL)解析により、Sendaiラットの糖尿病関連遺伝子は第1、第3および第14染色体上にある可能性が示されている。インスリン分泌不全に起因すると考えられる耐糖能異常は、雌雄共に8週齢から観察される。そこで膵島に病理学的変化が見られない、8週齢の雄Sendaiラットおよび非糖尿病Brown Norway (BN)ラット膵島からTotal RNAを抽出後、Affymetrix社GeneChip Rat Expression Array Set 230を用いて網羅的に遺伝子発現解析を行った。その結果、Sendaiラットでは、46遺伝子が有意に増加(34遺伝子)あるいは減少(12遺伝子)していた。Ensemble genome databaseを用い、各遺伝子の染色体上の位置を調べたところ、27遺伝子については染色体領域が同定できた。そのうち、上記QTL近傍に位置した遺伝子は3遺伝子であった。現在までに、糖尿病と直接関連する遺伝子は見つかっていない。しかし、ラットはヒト、マウスに比べるとデータベースの整備が遅れており、アノテーション解析ができない遺伝子が多く存在したため、データベースの整備が進むにつれて、これらは有力な候補遺伝子になることが期待される。さらに、BNラットへの戻し交配により、第1、第3および第14染色体を個別に導入したコンジェニック系統を樹立し、ホモ接合体を作製した。糖負荷試験による耐糖能異常とQTLとの関連性を調べたが、今のところ関連性を示すデータは得られていない。今後は2つ以上のQTLをもつコンジェニック系を作製すると共に、高脂肪食投与など環境負荷を加え、糖尿病関連遺伝子座を絞り込んでいく予定である。

Report

(2 results)
  • 2006 Annual Research Report
  • 2005 Annual Research Report
  • Research Products

    (3 results)

All 2006 2005 Other

All Journal Article (3 results)

  • [Journal Article] Phenotypic an genetic characterization of the ATP7a^<Mo-Tohm> mottled mouse : A new murine model of Menkes disease2006

    • Author(s)
      Yasumasa Mototani
    • Journal Title

      GENOMICS Vol.87

      Pages: 191-199

    • Related Report
      2005 Annual Research Report
  • [Journal Article] D-Amino-Acid Oxidase Is Involved in D-Serine-Induced Nephrotoxicity2005

    • Author(s)
      Masao Maekawa
    • Journal Title

      Chemical Research in Toxicology Vol.11

      Pages: 1678-1682

    • Related Report
      2005 Annual Research Report
  • [Journal Article] Imaging analysis reveals mechanistic differences between first and second phase insulin exocytosis.

    • Author(s)
      Mica Ohara-Imaizumi
    • Journal Title

      Journal of Biological Chemistry (In press)

    • Related Report
      2006 Annual Research Report

URL: 

Published: 2005-04-01   Modified: 2016-04-21  

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