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軟X線照射後に生成するDNA鎖切断末端の分子化学構造の定量化

Research Project

Project/Area Number 17710051
Research Category

Grant-in-Aid for Young Scientists (B)

Allocation TypeSingle-year Grants
Research Field Risk sciences of radiation/Chemicals
Research InstitutionJapan Atomic Energy Agency

Principal Investigator

藤井 健太郎  Japan Atomic Energy Agency, 先端基礎研究センター, 研究職 (00360404)

Project Period (FY) 2005 – 2007
Project Status Completed (Fiscal Year 2007)
Budget Amount *help
¥3,600,000 (Direct Cost: ¥3,600,000)
Fiscal Year 2007: ¥700,000 (Direct Cost: ¥700,000)
Fiscal Year 2006: ¥700,000 (Direct Cost: ¥700,000)
Fiscal Year 2005: ¥2,200,000 (Direct Cost: ¥2,200,000)
Keywords放射線生物影響 / 鎖切断 / 塩基損傷 / 軟X線 / 内殻電離 / プラスミドDNA / グリコシレース / イオン脱離 / DNA / 酸化的塩基損傷 / K殻励起 / 末端構造 / 分子化学構造
Research Abstract

軟X線照射によるDNA鎖切断や塩基損傷の生成過程について、その定量的評価が本研究の主な目的である。本年度はSPring-8軟X線ビームラインにおいて、プラスミドDNA(pUC18)薄膜に対して、単色軟X線照射を行い、塩基除去修復酵素(EndoIIIやFpg)処理をおこない、鎖切断および塩基損傷の定量を行った。照射エネルギーとして、270,380,435,560および760eVを選択した。それぞれ、炭素K殻吸収端前、炭素K殻吸収端後、窒素K殻吸収端後、酸素K殻吸収端後およびリンK殻吸収端前のエネルギーの相当する。
照射後試料をTE緩衝液で回収し、主鎖切断によるコンフォメーション変化をアガロース電気泳動法により調べた。また、酸化的塩基損傷の収率はFpg及びEndoIIIの二種類の塩基除去修復酵素(グリコシレース)で処理(37℃、30min)し、酵素の持つAPエンドヌクレース活性により塩基損傷部位を主鎖切断に変換することで定量化した。得られた一本鎖切断(ssb)および塩基損傷の照射エネルギー依存性から、270,380および435eVの主鎖切断およびグリコシレースで認識される塩基損傷の収率はほぼ一定であるのに対し、酸素K殻吸収端より高エネルギー側の560および760eVではその収率の顕著な増加が見られた。また、グリコシレースで認識される塩基損傷の収率では窒素K殻吸収端前(380eV)で収率が極少値を示し、窒素およびK殻吸収端後(435および560eV)では塩基損傷収率の増加が見られた。我々の軟X線を用いた分光学的研究において、酸素K殻光吸収によるグアニン塩基の酸素K殻励起領域での特徴的なラジカル生成や、糖(デオキシリボース)分子の分解が確認されており、今回確認された560eVでの顕著な鎖切断や塩基損傷の収率の増加の原因のひとつとして、DNA分子中の酸素K殻光吸収による上記のようなラジカル過程及び化学結合の解離と引き続き起こるイオンの脱離が考えられる。これらの結果を7月にボストンで開催された6th Auger Symposium: An International Symposium on Physica1, Molecular, Cellular, and Medical Aspects of Auger Processesおよびサンフランシスコで開催された13th International Congress of Radiation Researchにおいて口頭発表するとともに、発表内容を学術論文にまとめ、現在Int. J. Radiat. Bio1.に投稿査読中である。また、10月に宇治市で開催された第50回放射線化学討論会および11月に東海村で開催されたThe 7th International Symposium on Advanced Science Research; Charged Particle and Photon Interaction with Matterにおいて発表を行った。

Report

(3 results)
  • 2007 Annual Research Report
  • 2006 Annual Research Report
  • 2005 Annual Research Report
  • Research Products

    (18 results)

All 2008 2007 2006 2005

All Journal Article (10 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Presentation (8 results)

  • [Journal Article] LET dependence of the yield of single^-, double-strand breaks and base lesions in fully hydrated plasmid DNA films by ^4He^<2+>ion irradiation2008

    • Author(s)
      Ayumi Urushibara
    • Journal Title

      International Journal of Radiation Biology 84

      Pages: 23-33

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] DNA Damage induced by direct effect of radiation2008

    • Author(s)
      Akinari Yokoya
    • Journal Title

      Radiation Physics and Chemistry (in press)

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] X^-ray Absorption Spectra for Nucleotides in Water solutions near the nitrogen K-edge2008

    • Author(s)
      Masatoshi Ukai
    • Journal Title

      Radiation Physics and Chemistry (in press)

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] クラスターDNA損傷の生物効果2006

    • Author(s)
      鹿園直哉 他
    • Journal Title

      放射線生物研究 41巻・4号

      Pages: 409-423

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] DNA Damage Induced by The Direct Effect of He Ion Particles2006

    • Author(s)
      A.Urushibara 他
    • Journal Title

      Radiation Protection Dosimetry 122

      Pages: 163-165

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] Yields of Strand Breaks and Base Lesions Induced by Soft X-rays in Plasmid DNA2006

    • Author(s)
      A.Yokoya 他
    • Journal Title

      Radiation Protection Dosimetry 122

      Pages: 86-88

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] 放射線によるクラスターDNA損傷の生成機構2005

    • Author(s)
      横谷明徳
    • Journal Title

      放射線生物研究 40

      Pages: 168-184

    • Related Report
      2005 Annual Research Report
  • [Journal Article] Natural Circular Dichroism of Amino Films Observed in Soft X-ray and VUV Region Using Polarizing Undulator2005

    • Author(s)
      K.Nakagawa
    • Journal Title

      Journal of Electron Spectroscopy and Related Phenomena 144-147

      Pages: 271-273

    • Related Report
      2005 Annual Research Report
  • [Journal Article] Chemical Evolution of Amino Acid Induced by Soft X-ray VUV Irradiation2005

    • Author(s)
      F.Kaneko
    • Journal Title

      Journal of Electron Spectroscopy and Related Phenomena 144-147

      Pages: 291-294

    • Related Report
      2005 Annual Research Report
  • [Journal Article] First observation of natural circular dichroism and linear dichroism spectra in soft X-ray region using the polarizing undulator2005

    • Author(s)
      M.Tanaka
    • Journal Title

      Physica Scripta T115

      Pages: 873-876

    • Related Report
      2005 Annual Research Report
  • [Presentation] Induction of strand breaks, base lesions, and clustered damage in dry plasmid DNA films induced by carbon, nitrogen and oxygen KLL Auger process2007

    • Author(s)
      Kentaro Fujii
    • Organizer
      6th Auger Symposium: An International Symposium on Physical, Molecular, Cellular, and Medical Aspects of Auger Processes
    • Place of Presentation
      Boston, USA
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] Auger and photo-electron effects on strand breaks and base lesions in plasmid DNA irradiates with ultrasoft X-rays2007

    • Author(s)
      Ken Akamatsu
    • Organizer
      6th Auger Symposium: An International Symposium on Physical, Molecular, Cellular, and Medical Aspects of Auger Processes
    • Place of Presentation
      Boston, USA
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] Anovel technique using DNA denaturation to analyze clustered DNA damage sites induced by densely ionizing radiation2007

    • Author(s)
      Akinari Yokoya
    • Organizer
      13th Internatioal Congress of Radiation Research
    • Place of Presentation
      San Francisco, USA
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] Induction of strand breaks and base lesions in dry plasmid DNA films unduced by 270-560eV ultrasoft X-rays2007

    • Author(s)
      Kentaro Fujii
    • Organizer
      13th International Congress of Radiation Research
    • Place of Presentation
      San Francisco, USA
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] DNA damage induced by direct effect of radiation2007

    • Author(s)
      Akinari Yokoya
    • Organizer
      The 7th International Symposium on Advanced Scienoe Research; Charged Particle and Photon Interaction with Matter
    • Place of Presentation
      東海村(日本原子力研究開発機構),茨城県
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] Strand breaks and base lesions in dry plasmid DNA films induced by monochromatic ultrasoft X-rays2007

    • Author(s)
      Kentaro Fujii
    • Organizer
      The 7th International Symposium on Advanoed Science Research; Charged Particle and Photon Interaction with Matter
    • Place of Presentation
      東海村(日本原子力研究開発機構),茨城県
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] 放射線によりプラスミドDNAの両鎖に生じた非DSB性多重SSBのDNAの変性を利用した新しい定量法2007

    • Author(s)
      横谷 明徳
    • Organizer
      日本放射線影響学会第50回大会
    • Place of Presentation
      千葉市(幕張メッセ),千葉県
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] 放射光単色軟X線によりDNA中に生じる主鎖切断収量及び修復酵素をプローブとして用いた塩基損傷の定量2007

    • Author(s)
      藤井 健太郎
    • Organizer
      第50回放射線化学討論会
    • Place of Presentation
      宇治市(京都大学),京都府
    • Related Report
      2007 Annual Research Report

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Published: 2005-04-01   Modified: 2016-04-21  

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