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放射線誘発造血腫瘍におけるメチル化異常のゲノムスキャン法に関する研究

Research Project

Project/Area Number 17710053
Research Category

Grant-in-Aid for Young Scientists (B)

Allocation TypeSingle-year Grants
Research Field Risk sciences of radiation/Chemicals
Research InstitutionTohoku University

Principal Investigator

桑原 義和  東北大学, 加齢医学研究所, 助手 (00392225)

Project Period (FY) 2005 – 2006
Project Status Completed (Fiscal Year 2006)
Budget Amount *help
¥2,900,000 (Direct Cost: ¥2,900,000)
Fiscal Year 2006: ¥1,200,000 (Direct Cost: ¥1,200,000)
Fiscal Year 2005: ¥1,700,000 (Direct Cost: ¥1,700,000)
Keywordsメチル化シトシン / 免疫沈降 / CpGアイランド / メチル化 / ゲノム沈降
Research Abstract

近年、エピジェネティックス機構の異常はがん抑制遺伝子の不活化機構の一因と考えられており、がんの発生及び進展に重要な役割を果たしていることが知られている。特に、がん抑制遺伝子のプロモーター領域におけるCpGアイランドのシトシン(C)におけるメチル化がその遺伝子の発現抑制に重要な役割を果たしている。本研究は、ゲノム全体から高頻度にメチル化されているCpGアイランドを探し出すために、抗メチル化シトシン抗体を用いたゲノム沈降法の開発を目的として行った。
本年度に取り組んだ内容は以下の通りである。
(1)ゲノムの抽出からクローニングまでの一連の系を確立した。
(2)ゲノムの免疫沈降により得られたクローンの塩基配列を解析した。その結果、全てのクローンにおいて高頻度にCpG配列のあることが分かった。しかし、データーべ一スに登録されているような、がん化に関連するCpGアイランドは検出されなかった。
本研究では、ゲノムの免疫沈降法により得られるDNA断片には確かにCpG配列が含まれていることが分かったが、CpGアイランドの単離は難しいことが分かった。近年、ゲノム配列中の大部分のCがメチル化されていることが知られている。ゲノムの免疫沈降法では、そのような領域を含んだゲノム領域がメチル化されたCpGアイランドと共にノイズとして取れて来てしまうため、CpGアイランドのみを単離することは難しいと考えられる。この様な点を克服するためには、クローニングという手法を取らず、最近開発されたゲノムのCpGアイランドのみを基板上に固定したマイクロアレイを用いるのが良いのではないかと考えている。今後、この手法により網羅的にメチル化されているCpGアイランドのみを検出していく予定である。

Report

(2 results)
  • 2006 Annual Research Report
  • 2005 Annual Research Report
  • Research Products

    (8 results)

All 2007 2006 2005 Other

All Journal Article (7 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Oxidative stress induced Lipocalin 2 gene expression : addressing its expression under the harmful conditions.2007

    • Author(s)
      Roudkenar M.H., Kuwahara Y., Baba T., Roushandeh A.M., Ebshima S., Abe S., Ohkubo Y., Fukumoto M.
    • Journal Title

      Journal of radiation research. 48

      Pages: 39-44

    • NAID

      110006570515

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] Recombinant hybrid protein, Shiga-Toxin-GM-CSF, effectively induce apoptosis of colon cancer cells.2006

    • Author(s)
      Roudkenar M.H., Bouzari S., Kuwahara Y., Roushandeh A.M., Oloomi N., Fukumoto M.
    • Journal Title

      World journal of gastroenterology. 12

      Pages: 2341-2344

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] Analysis of carcinogenic mechanisms of liver cancers induced by chronic exposure to alpha-particles from internally deposited Thorotrast.2006

    • Author(s)
      Fukumoto M, Kuwahara Y, Ohkubo Y, Wang L
    • Journal Title

      Radiation measurements. 41

      Pages: 1186-1190

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] 総説 放射線耐性を理解する上での問題点2006

    • Author(s)
      桑原義和, 馬場 泰輔, 王 ル, 村田 和浩, 栗原 愛, 海老島 茂子, 山本 陽一郎, 福本 学
    • Journal Title

      放射線生物研究 12

      Pages: 380-386

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] Analysis of Common Deletion (CD) and a novel deletion of mitochondrial DNA induced by ionizing radiation.

    • Author(s)
      Wang L., Kuwahara Y., Li L., Bsba T., Shin R.W., Ohkubo Y., Ono K., Fukumoto M.
    • Journal Title

      International journal of radiation biology. (in press)(印刷中)

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] Analysis of Carcinogenic Mechanisms of Liver Cancers Induced by Chronic Exposure to Alpha-particles from Internally Deposited Thorotrast.

    • Author(s)
      Fukumoto M., Shimizu T., Kuwahara Y., Wang L., Wada I.
    • Journal Title

      Radiat Measurements. (in press)(印刷中)

    • Related Report
      2005 Annual Research Report
  • [Journal Article] Recombinant hybrid protein, Shiga-Toxin-GM-CSF, effectively induce apoptosis of colon cancer cells.

    • Author(s)
      Habibi Roudkenar M., Bouzari S., Kuwahara Y., Mohammadi Roushandeh A., Oloomi N., Fukumoto M.
    • Journal Title

      World journal of gastroenterology. (in press)(印刷中)

    • Related Report
      2005 Annual Research Report
  • [Book] Mechanisms of Liver Carcinogenesis in Patients Injected with Thorotrast. Health Effects of Incorporated Radionuclides2005

    • Author(s)
      Fukumoto M., Kuwahara Y., Wang L., Liu D., Shimizu T., Wada I., Ishikawa Y., Mori T.
    • Publisher
      GSF (Germany)
    • Related Report
      2005 Annual Research Report

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Published: 2005-04-01   Modified: 2016-04-21  

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