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生体系固体酸素17NMR法開発

Research Project

Project/Area Number 17750171
Research Category

Grant-in-Aid for Young Scientists (B)

Allocation TypeSingle-year Grants
Research Field Chemistry related to living body
Research InstitutionThe Institute of Physical and Chemical Research

Principal Investigator

山田 和彦  独立行政法人理化学研究所, NMR解析技術高度化研究チーム, リサーチアソシエイト (80373380)

Project Period (FY) 2005 – 2006
Project Status Completed (Fiscal Year 2006)
Budget Amount *help
¥3,500,000 (Direct Cost: ¥3,500,000)
Fiscal Year 2006: ¥1,600,000 (Direct Cost: ¥1,600,000)
Fiscal Year 2005: ¥1,900,000 (Direct Cost: ¥1,900,000)
Keywords固体酸素17NMR / 生体分子 / タンパク質の構造・機能解析
Research Abstract

本研究の目的は、従来難題とされてきたタンパク質などの生体分子における酸素NMR法を開発し、タンパク質の構造および機能解析に応用することである。本年度の研究において、以下の研究実績を報告する。当グループが開発したアミノ酸への酸素同位体標識技術(国内特許2006-8666、現在国外特許申請中)を用いて、種々の生体分子へ酸素17安定同位体の標識を施し、高磁場固体NMR測定を行った。これら網羅的なNMR測定およびスペクトル解析の結果、タンパク質を構成する20種類のアミノ酸、および生理活性に関わるペプチドの酸素NMRテンソル量を正確に計測することができた。従来の研究では、NMRテンソル量を計測するためには、試料を単結晶にする必要があり、試料調整に問題があった。本研究では、調整が容易な粉末試料を複数の異なる磁場強度のNMR装置で測定を行い、量子化学計算法の結果と併せて、それぞれ得られたNMRスペクトルをプログラム解析をした。大多数の生体分子は容易に単結晶を形成しないことから、この手法は今後の生体分子の研究において重要である。また、今年度の研究成果より、酸素NMRパラメータの一部(遮蔽テンソルの一成分)は、水素結合の強度と相関をもつことが分かり、水素結合強度を計測できる新規パラメータとして、将来のタンパク質の機能解析に応用が期待できる。これら研究成果は投稿論文において発表した(平成18年度研究成果参照)。さらに、未発表のアミノ酸、種々のペプチド、そして、巨大分子であるタンパク質の酸素NMR法の開発および応用の研究成果については、現在、投稿中または投稿準備中である。

Report

(2 results)
  • 2006 Annual Research Report
  • 2005 Annual Research Report
  • Research Products

    (5 results)

All 2007 2006 Other

All Journal Article (5 results)

  • [Journal Article] Solid-state 170 NMR in biological solids : efficient 170 labeling of amino acids and peptides2007

    • Author(s)
      Yamada, Kazuhiko
    • Journal Title

      Chemistry Letters 36・1

      Pages: 192-192

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] Both experimental and theoretical investigations of solid-state 170 NMR for L-valine and L-isoleucine."2006

    • Author(s)
      Yamada, Kazuhiko
    • Journal Title

      Solid State Nuclear Magnetic Resonance 30

      Pages: 182-182

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] Solid-state 170 NMR study of the electric-field-gradient and chemical shielding tensors in polycrystalline γ-glycine."2006

    • Author(s)
      Yamada, Kazuhiko
    • Journal Title

      Solid State Nuclear Magnetic Resonance 30

      Pages: 162-162

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] 半整数四極子核の固体NMR法-有機化合物の^<17>O固体NMR-2006

    • Author(s)
      山田和彦
    • Journal Title

      分光研究 55巻・2号(in press)

    • NAID

      10016749344

    • Related Report
      2005 Annual Research Report
  • [Journal Article] Determination of the carboxylate oxygen electric-field-gradient and chemical shielding tensors in L-alanine and L-phenylalanine

    • Author(s)
      Yamada, Kazuhiko
    • Journal Title

      Journal of Molecular Structure (in press)

    • Related Report
      2006 Annual Research Report

URL: 

Published: 2005-04-01   Modified: 2016-04-21  

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