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ゲノムの安定性を維持するDNA修復酵素,FEN1-PCNA複合体の構造研究

Research Project

Project/Area Number 17770092
Research Category

Grant-in-Aid for Young Scientists (B)

Allocation TypeSingle-year Grants
Research Field Structural biochemistry
Research InstitutionNara Institute of Science and Technology

Principal Investigator

北野 健  奈良先端科学技術大学院大学, 情報科学研究科, 助手 (40346309)

Project Period (FY) 2005 – 2006
Project Status Completed (Fiscal Year 2006)
Budget Amount *help
¥3,600,000 (Direct Cost: ¥3,600,000)
Fiscal Year 2006: ¥1,700,000 (Direct Cost: ¥1,700,000)
Fiscal Year 2005: ¥1,900,000 (Direct Cost: ¥1,900,000)
Keywordsタンパク質 / X線結晶構造解析 / FEN1 / PCNA / ウェルナー症候群 / WRN / 早老症 / ラディキシン / flap enconuclease-1 / ペルオキシレドキシン
Research Abstract

FEN1(flap endonuclease-1)は,二本鎖DNAから突出した一本鎖flap DNAを切断する構造特異的エンドヌクレアーゼで,DNA複製の際に残るRNAプライマーや,塩基除去修復で損傷塩基を含む一本鎖DNAを除去する,ゲノムの複製と維持に重要なタンパク質である。本研究ではPCNA(増殖細胞核抗原)と複合体形成したFEN1の反応メカニズムを解明することを目的に,X線結晶構造解析法による研究をおこなった。
ウェルナー症候群は若い年齢で老化が急速に進行する早老症のひとつであり,ウェルナータンパク質(WRN)の機能欠損によって引き起こされる難病である。WRNはゲノムDNAの安定性維持を通して,細胞の抗老化および抗ガン化に重要な役割を果たしている。WRNはC末にHRDC(helicase-and-ribonuclease D-C-terminal)ドメインを有することが知られていたが,その構造と機能は良く分かっていなかった。本研究ではX線結晶解析法により,ヒトWRN HRDCドメインの立体構造をはじめて決定した。WRNは単細胞生物のホモログ(RecQタンパク質)に比して,より大きなドメインに進化したHRDCを有していることが明らかとなり,これを独立したモジュールとして他のタンパク質群との相互作用に利用している可能性が示された。
ERMタンパク質は、細胞膜上の接着分子とアクチンフィラメントを連結する架橋タンパク質で,N末端に約300残基からなるFERMドメインを持つ。今回,ラディキシンFERMドメインの二量体結晶構造を決定した。その結果,一方の分子の接着分子結合部位が他方の分子のC末端領域によってマスキングされた構造が得られた。

Report

(2 results)
  • 2006 Annual Research Report
  • 2005 Annual Research Report
  • Research Products

    (12 results)

All 2007 2006 2005

All Journal Article (12 results)

  • [Journal Article] Crystal structure of the HRDC domain of human Werner syndrome protein, WRN.2007

    • Author(s)
      Kitano, K.
    • Journal Title

      J. Biol. Chem. 282(4)

      Pages: 2717-2728

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] Crystallographic characterization of the radixin FERM domain bound to the cytoplasmic tails of adhesion molecules CD43 and PSGL-1.2007

    • Author(s)
      Takai, Y.
    • Journal Title

      Acta Crystallogr. F F63(1)

      Pages: 49-51

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] Structural basis for type II membrane protein binding by ERM proteins revealed by the radixin-neutral endopeptidase 24.11 (NEP) complex.2007

    • Author(s)
      Terawaki, S.
    • Journal Title

      J. Biol. Chem. (In press)

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] Spatial orientation of mitochondrial processing peptidase and a preprotein revealed by fluorescence resonance energy transfer.2007

    • Author(s)
      Nishino, TG.
    • Journal Title

      J. Biochem. (In press)

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] Structure of dimerized radixin FERM domain suggests a novel masking motif in C-terminal residues 295-304.2006

    • Author(s)
      Kitano, K.
    • Journal Title

      Acta Crystallogr. F 62(4)

      Pages: 340-345

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] ヒトFEN1-PCNA複合体の結晶構造が示すスイング活性化機構2006

    • Author(s)
      北野 健
    • Journal Title

      日本結晶学会誌 48(5)

      Pages: 367-372

    • NAID

      10018331331

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] Crystal structure of human flap endonuclease-1 (FEN1) complexed to PCNA.2006

    • Author(s)
      Kitano, K.
    • Journal Title

      SPring-8 Research Frontiers

      Pages: 18-19

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] Crystal structure of human Rad GTPase of the RGK-family.2006

    • Author(s)
      Yanuar, A
    • Journal Title

      Genes Cells 11(8)

      Pages: 961-968

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] Structural basis for induced-fit binding of Rho-kinase to the inhibitor Y27632.2006

    • Author(s)
      Yamaguchi, H.
    • Journal Title

      J. Biochem. 140(3)

      Pages: 305-311

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] Crystal structure of decameric peroxiredoxin (AhpC) from Amphibacillus xylanus.2005

    • Author(s)
      Kitano, K.
    • Journal Title

      Proteins 59・3

      Pages: 644-647

    • Related Report
      2005 Annual Research Report
  • [Journal Article] Expression, purification, crystallization and preliminary crystallographic analysis of human Rad GTPase.2005

    • Author(s)
      Yanuar, A
    • Journal Title

      Acta Crystallogr.F. 61・11

      Pages: 978-980

    • Related Report
      2005 Annual Research Report
  • [Journal Article] 微少重力下でのタンパク質結晶化と放射光による構造解析2005

    • Author(s)
      北野 健
    • Journal Title

      日本マイクログラビティ応用学会誌 22・2

      Pages: 78-85

    • Related Report
      2005 Annual Research Report

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Published: 2005-04-01   Modified: 2016-04-21  

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