| Project/Area Number |
17780141
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
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| Allocation Type | Single-year Grants |
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| Research Field |
林産科学・木質工学
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| Research Institution | Kochi University of Technology |
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Principal Investigator |
堀澤 栄 Kochi University of Technology, 工学部, 准教授 (20368856)
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| Project Period (FY) |
2005 – 2007
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2007)
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| Budget Amount *help |
¥3,100,000 (Direct Cost: ¥3,100,000)
Fiscal Year 2007: ¥400,000 (Direct Cost: ¥400,000)
Fiscal Year 2006: ¥700,000 (Direct Cost: ¥700,000)
Fiscal Year 2005: ¥2,000,000 (Direct Cost: ¥2,000,000)
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| Keywords | 菌類 / 森林工学 / ゲノム |
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| Research Abstract |
前年度までに、木材腐朽菌の中で特に家屋に重大な影響を及ぼすと思われる、Serpula lacrymans, Coniophora puteana, Gloeophyllum sepiarium, G.trabeum,Trametes versicolorの6種について、それぞれの種を検出するためのプライマーを開発した。担子菌において種の同定に頻用されるリボソームのITS領域より、種に特異的な配列をもとに検出対象種でのみPCR増幅される種特異的プライマーを設計した。本年度はこれら種特異的プライマーを用いた定量PCRを行い、量的な検出および生物量評価法の開発を試みた。PCR反応を通して増幅されていくDNA量をモニターすることで鋳型DNA量を評価することができる定量PCR(リアルタイムPCR)において、開発して種特異的プライマーの増幅効率をユニバーサルプライマーによる増幅効率と比較し、定量性を評価した。検出対象種のゲノムに対する種特異的プライマーを用いた増幅効率は、ユニバーサルプライマーの増幅効率と一致したことから、種特異的プライマーを用いた定量的検出が可能であることが示された。また、プラスミドにクローニングしたITS断片をスタンダードの鋳型として用いることで、各腐朽菌の生物量を評価できることが明らかとなった。また、定量PCRを用いてプライマーの増幅効率を評価することができることが明らかとなった。この技術により種特異的プライマー開発において、その増幅効率を数値的に評価できることが示された。
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