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GMC酸化還元酵素ファミリーに属する糖酸化酵素の機能解析

Research Project

Project/Area Number 17780245
Research Category

Grant-in-Aid for Young Scientists (B)

Allocation TypeSingle-year Grants
Research Field Boundary agriculture
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

五十嵐 圭日子  東京大学, 大学院農学生命科学研究科, 助手 (80345181)

Project Period (FY) 2005 – 2006
Project Status Completed (Fiscal Year 2006)
Budget Amount *help
¥3,600,000 (Direct Cost: ¥3,600,000)
Fiscal Year 2006: ¥1,100,000 (Direct Cost: ¥1,100,000)
Fiscal Year 2005: ¥2,500,000 (Direct Cost: ¥2,500,000)
KeywordsGMC酸化還元酵素 / 木材腐朽菌 / セロビオース脱水素酵素 / グルコース酸化酵素 / ピラノース-2-酸化酵素
Research Abstract

担子菌Phanerochaete chrysosporium由来CDHおよび子嚢菌Humicola insolens由来CDHのアミノ酸配列の相同性比較を行うとともに、P.chrysosporium由来CDHのフラビンドメインの三次元構造(PDBID=1NAA)をもとに、pH依存性に関与すると考えられるアミノ酸を推定した。Q734に部位特異的変異を導入した3種の変異体(Q734S、Q734T、Q734H)をコードするcDNA断片を、オーバーラップ伸長法とアダプタープライマー法を組み合わせた手法によって作成した。得られたcDNA断片をメタノール資化性酵母用のベクターに挿入し、組換え酵素を生産した。菌体外液から精製して得られたそれぞれの変異体酵素によるユビキノン還元活性のpH依存性を比較するとともに、pH4.0および7.0におけるセロビオースに対する反応速度定数(Km、k_<cat>)および基質阻害定数(Ki)を算出した。その結果、大量発現を試みた変異体のうち、Q734SとQ734Tが活性型タンパク質として生産された。精製された野生型および2種の変異体の可視紫外スペクトルを比較したところ、フラビンに特徴的なピークが観察されたことから、変異体は補欠分子族を分子内に含んでいることが確認された。2種の変異体によるユビキノン還元活性を野生型のそれと比較したところ、Q734Sでは酸性側で活性が顕著に減少したのに対し、Q734Tでは最大活性値はほとんど変化せずに至適pHが酸性側にシフトしていることが明らかとなった。さらにpH4.0および7.0におけるKm、k_<cat>、Kiを比較したところ、k_<cat>以外の定数にはほとんど変化がなかった。これらの結果は、Q734が本酵素のpH依存性に深く関与していることを示しており、セロビオースに対する親和性の変化ではなく、フラビンのN(1)またはC(2)の電荷が変わることで酸化還元反応のpH依存性が変化すると考えられた。これらの成果を第56回日本木材学会大会で発表した。
さらにセロビオース脱水素酵素を用いたセルラーゼ活性の測定にも着手し、固液界面における酵素反応を速度論的に解析した。

Report

(2 results)
  • 2006 Annual Research Report
  • 2005 Annual Research Report
  • Research Products

    (7 results)

All 2007 2006 2005

All Journal Article (5 results) Book (1 results) Patent(Industrial Property Rights) (1 results)

  • [Journal Article] Activation of crystalline cellulose to cellulose III_I, results in efficient hydrolysis by cellobiohydrolase2007

    • Author(s)
      Igarashi, K., Wada, M., Samejima, M.
    • Journal Title

      FEBS Journal 274

      Pages: 1785-1792

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] Surface density of cellobiohydrolase on crystalline celluloses : A critical kinetic parameter to evaluate enzymatic kinetics at a solid-liquid interface.2006

    • Author(s)
      Igarashi, K., Wada, M., Hori, R., Samejima, M.
    • Journal Title

      FEBS Journal 273

      Pages: 2869-2878

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] Electron transfer chain reaction of the extracellular flavocytochrome cellobiose dehydrogenase from the basidiomycete Phanerochaete chrysosporium2005

    • Author(s)
      Igarashi, K., Yoshida, M., Matsumura, H., Nakamura, N., Ohno, H., Samejima, M., Nishino, T
    • Journal Title

      FEBS Journal 272

      Pages: 2869-2877

    • Related Report
      2005 Annual Research Report
  • [Journal Article] Characterization of carbohydrate-binding cytochrome b_<562> from the white-rot fungus Phanerochaete chrysosporium2005

    • Author(s)
      Yoshida, M., Igarashi, K., Wada, M., Kaneko, S., Suzuki, N., Matsumura, H., Nakamura, N., Samejima, M
    • Journal Title

      Applied and Environmental Microbiology 71

      Pages: 4548-4555

    • Related Report
      2005 Annual Research Report
  • [Journal Article] セロビオース脱水素酵素を介した糸状菌細胞外電子伝達系2005

    • Author(s)
      五十嵐圭日子, 鮫島正浩
    • Journal Title

      バイオサイエンスとインダストリー 63

      Pages: 777-780

    • NAID

      10017085890

    • Related Report
      2005 Annual Research Report
  • [Book] Cellulose Communications2006

    • Author(s)
      五十嵐圭日子, 和田昌久, 鮫島正浩
    • Total Pages
      5
    • Publisher
      固液界面における酵素反応の速度論的解析 : セロビオヒドロラ-ゼによる結晶性セルロ-スの分解
    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 糖の製造方法、エタノ-ルの製造方法、及び乳酸の製造方法、並びにこれらに用いられる酵素糖化用セルロ-ス及びその製造方法2006

    • Inventor(s)
      和田 昌久, 五土嵐 圭日子, 鮫島 正浩
    • Industrial Property Rights Holder
      東京大学TLO
    • Industrial Property Number
      2006-354706
    • Filing Date
      2006-12-28
    • Related Report
      2006 Annual Research Report

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Published: 2005-04-01   Modified: 2016-04-21  

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