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ROS応答するラベル化分子の設計と条件付きプロテオミクスへの展開

Research Project

Project/Area Number 17F17344
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section外国
Research Field Bio-related chemistry
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

浜地 格  京都大学, 工学研究科, 教授 (90202259)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) ZHU HAO  京都大学, 工学(系)研究科(研究院), 外国人特別研究員
Project Period (FY) 2017-11-10 – 2020-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2019)
Budget Amount *help
¥2,400,000 (Direct Cost: ¥2,400,000)
Fiscal Year 2019: ¥700,000 (Direct Cost: ¥700,000)
Fiscal Year 2018: ¥1,200,000 (Direct Cost: ¥1,200,000)
Fiscal Year 2017: ¥500,000 (Direct Cost: ¥500,000)
Keywordsプロテオミクス / タンパク質ラベリング
Outline of Annual Research Achievements

本研究では、多くの活性酸素(窒素)種の中でも過酸化水素に的を絞り、過酸化水素と選択的に反応し、反応活性が大幅に向上するようなconditional proteomicsのためのラベル化剤の分子設計を行った。過酸化水素応答ユニットに、イメージング/濃縮のための親和性タグ(フルオレセインなどの蛍光団)を繋いだ分子を合成し、これを用いて生細胞での過酸化水素応答挙動を評価した。その結果、細胞外から添加した過酸化水素に応答して細胞内タンパク質のラベル化が大きく加速されるだけでなく、細胞刺激によってROSを内在的に発生させた場合にもはっきりとしたラベル化の亢進が見られることをWestern blottingによって生化学的に確認した。従って、過酸化水素に応答して生細胞系でのプロテオミクスに利用できる初めての化学プローブの合成に成功したと言える。また、ラベル化はイメージングによっても明瞭に確認でき、特に固定化後もその蛍光画像が維持されるという特徴を有していた。さらに、これらの利点にMSMS解析を組み合わせて、内在性過酸化水素発生に伴うconditional proteomicsを実施し、マクロファージ細胞内で、過酸化水素が濃縮される小胞体ベシクルの実体解明に成功した。

Research Progress Status

令和元年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和元年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(3 results)
  • 2019 Annual Research Report
  • 2018 Annual Research Report
  • 2017 Annual Research Report
  • Research Products

    (4 results)

All 2020 2019 2018 Other

All Journal Article (1 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 1 results) Presentation (2 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Chemical proteomics for subcellular proteome analysis2019

    • Author(s)
      Zhu Hao、Tamura Tomonori、Hamachi Itaru
    • Journal Title

      Current Opinion in Chemical Biology

      Volume: 48 Pages: 1-7

    • DOI

      10.1016/j.cbpa.2018.08.001

    • Related Report
      2018 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Presentation] Profiling of proteins under oxidative environments in cells and tissues by H2O2-responsive labeling2020

    • Author(s)
      Hao ZHU
    • Organizer
      The 4th International Symposium of Kyoto Biomolecular Mass Spectrometry Society
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] H2O2-responsive protein labeling for ROS conditional proteomics2018

    • Author(s)
      Hao Zhu, Tomonori Tamura, Itaru Hamachi
    • Organizer
      日本化学会第98春季年会
    • Related Report
      2017 Annual Research Report
  • [Remarks] 京都大学浜地研究室ホームページ

    • URL

      http://www.sbchem.kyoto-u.ac.jp/hamachi-lab/

    • Related Report
      2019 Annual Research Report 2018 Annual Research Report 2017 Annual Research Report

URL: 

Published: 2017-11-13   Modified: 2024-03-26  

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