Effects of environmental pollution and stress on gene expression profiles in Baltic salmons

Research Project

Project/Area Number	17F17731
Research Category	Grant-in-Aid for JSPS Fellows
Allocation Type	Single-year Grants
Section	外国
Research Field	Risk sciences of radiation and chemicals
Research Institution	Ehime University
Principal Investigator	岩田久人愛媛大学, 沿岸環境科学研究センター, 教授 (10271652)
Co-Investigator(Kenkyū-buntansha)	KANERVA MIRELLA 愛媛大学, 沿岸環境科学研究センター, 外国人特別研究員
Project Period (FY)	2017-07-26 – 2019-03-31
Project Status	Completed (Fiscal Year 2018)
Budget Amount *help	¥2,300,000 (Direct Cost: ¥2,300,000) Fiscal Year 2018: ¥1,100,000 (Direct Cost: ¥1,100,000) Fiscal Year 2017: ¥1,200,000 (Direct Cost: ¥1,200,000)
Keywords	タイセイヨウサケ / 難分解性有機汚染物質 / トランスクリプトーム / プロテオーム
Outline of Annual Research Achievements	本研究の目的は、バルト海の３海域で採取したタイセイヨウサケ個体群を対象に、環境汚染物質蓄積濃度やその他環境因子（水温・溶存酸素濃度・採取年）・生物学的因子（人工孵化・野生・年齢・体重・系群・栄養段階・餌生物種）がサケのトランスクリプトーム・プロテオームに与える影響を評価することである。具体的には、以下の４点に焦点を絞って解析することを計画した。１）サケ肝臓に蓄積するPCBを含む難分解性有機汚染物質を質量分析計で定性・定量する。２）次世代シーケンサーを使用して、サケ肝臓における各遺伝子のmRNA発現量を網羅的に測定する。３）飛行時間型タンデム質量分析計を用いて、サケ肝臓におけるタンパク質発現量を網羅的に測定する。４）上記１）－３）のデータに加え、研究分担者がこれまで測定してきた環境因子や生物学的因子を併せて主成分分析をおこない、交絡因子の影響を最小限にして各因子の影響を評価する。今年度は、飛行時間型タンデム質量分析計を用いて、サケ肝臓におけるタンパク質発現量（プロテオーム発現プロファイル）を網羅的に測定した。その結果、３海域間でプロテオーム発現プロファイルに違いが認められた。さらに、前年度解析したサケ肝臓のトランスクリプトーム発現プロファイルと併せてcoinertia分析を実施したところ、両データセットの類似性を確認した。さらに、環境因子（環境汚染物質濃度・水温・採取年）や生物学的因子（人工孵化・野生・系群）を併せて主成分分析をおこなった結果、サケ肝臓のスクリプトーム・プロテオーム発現量は主として難分解性有機汚染物質濃度に影響されていることが明らかとなった。
Research Progress Status	平成30年度が最終年度であるため、記入しない。
Strategy for Future Research Activity	平成30年度が最終年度であるため、記入しない。