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Mechanism of gene expression by cytoplasmic polyadenylation

Research Project

Project/Area Number 17H03635
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Allocation TypeSingle-year Grants
Section一般
Research Field Molecular biology
Research InstitutionNagoya City University

Principal Investigator

Hoshino Shinichi  名古屋市立大学, 医薬学総合研究院(薬学), 教授 (40219168)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 細田 直  名古屋市立大学, 医薬学総合研究院(薬学), 准教授 (40438198)
Project Period (FY) 2017-04-01 – 2021-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2020)
Budget Amount *help
¥17,290,000 (Direct Cost: ¥13,300,000、Indirect Cost: ¥3,990,000)
Fiscal Year 2020: ¥4,550,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥1,050,000)
Fiscal Year 2019: ¥4,550,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥1,050,000)
Fiscal Year 2018: ¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2017: ¥4,030,000 (Direct Cost: ¥3,100,000、Indirect Cost: ¥930,000)
KeywordsmRNAポリA鎖伸長 / mRNA ポリA鎖伸長 / mRNA / ポリA鎖伸長 / ポリAポリメラーゼ / RNA結合タンパク質 / 遺伝子発現制御 / 遺伝子発現調節 / mRNA分解 / 遺伝子発現 / 翻訳
Outline of Final Research Achievements

Messenger RNA (mRNA) carrying “genetic information” has 3’ poly(A) tail whose length regulation plays central roles in the post-transcriptional control of gene expression. Thus far, we have elucidated the mechanism of mRNA deadenylation (the initiation of mRNA decay), as well as negative regulation of gene expression targeting the deadenylation step. In this study, we have demonstrated that the positive regulation of gene expression by the post-transcriptional polyadenylation widely exists in somatic cells, and succeeded in verifying its general mechanism.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

生体内における遺伝子の発現調節は、翻訳の鋳型であるmRNAの量を調節することが重要であるが、その方法としてはmRNAの量を増やす転写の調節と、mRNA量を減らすmRNA分解の調節の2つの方法がある。これまで転写調節の研究が進展したが、本研究ではmRNA分解調節に焦点を置いて研究を行い、mRNAポリA鎖分解による負の調節機構に加えて、mRNAポリA鎖伸長による正の調節機構が存在することを新たに見出し、その普遍的分子機構を解明した点において学術的、社会的意義を有する。

Report

(5 results)
  • 2020 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2019 Annual Research Report
  • 2018 Annual Research Report
  • 2017 Annual Research Report
  • Research Products

    (59 results)

All 2021 2020 2019 2018 2017 Other

All Journal Article (12 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 12 results,  Open Access: 6 results) Presentation (46 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] DDX6 is a positive regulator of Ataxin-2/PAPD4 cytoplasmic polyadenylation machinery2021

    • Author(s)
      Hiroto Inagaki, Nao Hosoda, Shin-ichi Hoshino
    • Journal Title

      Biochem. Biophys. Res. Commun.

      Volume: 553 Pages: 9-16

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2021.03.066

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    • Author(s)
      Hiroto Inagaki, Nao Hosoda, Hitomi Tsuiji, Shin-Ichi Hoshino
    • Journal Title

      J. Biol. Chem.

      Volume: 295 Issue: 47 Pages: 15810-15825

    • DOI

      10.1074/jbc.ra120.013835

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      Nogimori, T., Ogami, K., Oishi, Y., Goda, R., Hosoda, N., Kitamura, Y., Kitade, Y., and Hoshino S.
    • Journal Title

      viruses

      Volume: 20 Issue: 2 Pages: 174-174

    • DOI

      10.3390/v12020174

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      Hojo, H., Yashiro1, Y., Noda1, Y., Ogami, K., Yamagishi, R., Okada, S., Hoshino, S. and Suzuki, T.
    • Journal Title

      J Biol Chem

      Volume: 295 Issue: 2 Pages: 390-402

    • DOI

      10.1074/jbc.ra119.011617

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      Heliyon

      Volume: 6 Issue: 3 Pages: e03493-e03493

    • DOI

      10.1016/j.heliyon.2020.e03493

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      Nogimori, Takuto; Nishiura, Kyutatsu; Kawashima, Sho; Nagai, Takahiro; Oishi, Yuka; Hosoda, Nao; Imataka, Hiroaki; Kitamura, Yoshiaki; Kitade, Yukio; Hoshino, Shin-ichi
    • Journal Title

      Nucleic Acids Res.

      Volume: 47 Issue: 1 Pages: 432-449

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      10.1093/nar/gky1087

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      Biochemical and Biophysical Research Communications

      Volume: 511 Issue: 2 Pages: 422-426

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      Volume: 593 Issue: 3 Pages: 277-287

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      Volume: 12 Issue: 5-6 Pages: 273-279

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      Scientific Reports

      Volume: 8 Issue: 1 Pages: 1455-1455

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      10.1038/s41598-018-19659-6

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      Wakiyama Motoaki、Ogami Koichi、Iwaoka Ryo、Aoki Kazuma、Hoshino Shin-ichi
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      Volume: 23 Issue: 5 Pages: 332-344

    • DOI

      10.1111/gtc.12580

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      Okamoto, A., Hosoda, N., Tanaka, A., Newnam, G.P., Chernoff, Y.O., Hoshino S.
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      J Biol Chem

      Volume: 292 Issue: 49 Pages: 20113-20124

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      10.1074/jbc.m117.811323

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      西浦久達、細田直、星野真一
    • Organizer
      第27回日本病院薬剤師会東海ブロック学術大会・平成29年度日本薬学会東海支部例会
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      2017 Annual Research Report
  • [Presentation] USP10による脱ユビキチン化を介したmRNAポリA鎖制御2017

    • Author(s)
      名和優紀子、細田直、星野真一:USP10による脱ユビキチン化を介したmRNAポリA鎖制御
    • Organizer
      第27回日本病院薬剤師会東海ブロック学術大会・平成29年度日本薬学会東海支部例会
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  • [Presentation] 神経変性疾患関連因子TDP-43によるmRNA poly(A)鎖短縮化機構2017

    • Author(s)
      福島真、千布高太郎、張天岳、細田直、星野真一
    • Organizer
      第27回日本病院薬剤師会東海ブロック学術大会・平成29年度日本薬学会東海支部例会
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      2017 Annual Research Report
  • [Presentation] mRNAの安定性に関わる因子の探索2017

    • Author(s)
      小林純果、細田直、星野真一
    • Organizer
      第63回日本薬学会東海支部総会・大会
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      2017 Annual Research Report
  • [Presentation] ストレス顆粒構成因子Caprin1による遺伝子発現調節機構の解明2017

    • Author(s)
      志水良亮、細田直、星野真一
    • Organizer
      第63回日本薬学会東海支部総会・大会
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      2017 Annual Research Report
  • [Presentation] RNA結合タンパク質LARP1は標的mRNAの翻訳を促進する2017

    • Author(s)
      坂元健大郎、奥村眞由、古舘和也、山岸良多、細田直、星野真一
    • Organizer
      第63回日本薬学会東海支部総会・大会
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      2017 Annual Research Report
  • [Remarks] 名古屋市立大学 大学院薬学研究科 遺伝情報学分野

    • URL

      http://www.phar.nagoya-cu.ac.jp/hp/syk/index.html

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      2020 Annual Research Report

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Published: 2017-04-28   Modified: 2022-01-27  

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