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Establishment of new identification method of the endoplasmic reticulum membrane scramblases based on the amino acid primary sequence

Research Project

Project/Area Number 17H06704
Research Category

Grant-in-Aid for Research Activity Start-up

Allocation TypeSingle-year Grants
Research Field Biophysics
Research InstitutionUniversity of Toyama

Principal Investigator

Nakao Hiroyuki  富山大学, 大学院医学薬学研究部(薬学), 助教 (00805020)

Project Period (FY) 2017-08-25 – 2019-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2018)
Budget Amount *help
¥2,730,000 (Direct Cost: ¥2,100,000、Indirect Cost: ¥630,000)
Fiscal Year 2018: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2017: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Keywordsフリップフロップ / スクランブラーゼ / リン脂質 / 小胞体 / 蛍光
Outline of Final Research Achievements

Phospholipid transbilayer movement (flip-flop) occurs constantly and very frequently in the endoplasmic reticulum (ER) membrane. However, ER scramblases, which are responsible for the rapid flip-flop, have not been identified yet. In this study, we have assessed the scramblase activities of various kinds of synthetic peptides, and demonstrated that the same side positioning of strongly hydrophilic residues enhanced the scramblase activities of transmembrane peptides.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

本研究で明らかにした高いスクランブラーゼ活性を生み出す特徴はアミノ酸一次配列から判断できるものであり、今後小胞体膜スクランブラーゼを探索する際に非常に有用な情報となりうる。また、親水性度の高いアミノ酸残基は、すでに同定されている細胞膜スクランブラ―ゼの膜貫通領域にも多くみられることから、本研究の知見はその脂質スクランブリングメカニズムの解明にも役立つ情報であると考えられる。

Report

(3 results)
  • 2018 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2017 Annual Research Report
  • Research Products

    (25 results)

All 2019 2018 2017

All Journal Article (3 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 3 results) Presentation (22 results) (of which Int'l Joint Research: 4 results)

  • [Journal Article] Biophysical Parameters of the Sec14 Phospholipid Exchange Cycle2019

    • Author(s)
      Sugiura Taichi、Takahashi Chisato、Chuma Yusuke、Fukuda Masakazu、Yamada Makiko、Yoshida Ukyo、Nakao Hiroyuki、Ikeda Keisuke、Khan Danish、Nile Aaron H.、Bankaitis Vytas A.、Nakano Minoru
    • Journal Title

      Biophysical Journal

      Volume: 116 Issue: 1 Pages: 92-103

    • DOI

      10.1016/j.bpj.2018.11.3131

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      2018 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Effect of Hydrophilic Residues and Hydrophobic Length on Flip-Flop Promotion by Transmembrane Peptides2018

    • Author(s)
      Hiroyuki Nakao, Chihiro Hayashi, Keisuke Ikeda, Hiroaki Saito, Hidemi Nagao, Minoru Nakano
    • Journal Title

      Journal of Physical Chemistry B

      Volume: 122 Issue: 15 Pages: 318-4324

    • DOI

      10.1021/acs.jpcb.8b00298

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      2018 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Formation of asymmetric vesicles via phospholipase D-mediated transphosphatidylation2018

    • Author(s)
      Takaoka Rina、Kurosaki Haruko、Nakao Hiroyuki、Ikeda Keisuke、Nakano Minoru
    • Journal Title

      Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Biomembranes

      Volume: 1860 Issue: 2 Pages: 245-249

    • DOI

      10.1016/j.bbamem.2017.10.011

    • Related Report
      2017 Annual Research Report
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  • [Presentation] リン脂質フリップフロップを促進する小胞体膜タンパク質膜貫通配列の探索2019

    • Author(s)
      中尾裕之、池田恵介、中野実
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      中尾裕之、杉本佑太、池田恵介、中野実
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      吉田右京、杉浦太一、中尾裕之、池田恵介、中野実
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      日本膜学会第40年会
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      中尾裕之、中尾千尋、池田恵介、斎藤大明、長尾秀実、中野実
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      生体コモンスペース研究会
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      第3回富山・アジア・アフリカ創薬研究シンポジウム
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      吉田右京、杉浦太一、中尾裕之、池田恵介、中野実
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      第3回富山・アジア・アフリカ創薬研究シンポジウム
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  • [Presentation] Regulation of Sec14-mediated lipid transfer by lipid-membrane environment2018

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      杉浦太一、吉田右京、中尾裕之、池田恵介、中野実
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      中野実、杉浦太一、中尾裕之、池田恵介
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      福田拓己、中尾裕之、池田恵介、中野実
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      第69回コロイドおよび界面化学討論会
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      吉野実紗、中尾裕之、池田恵介、中野実
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      第69回コロイドおよび界面化学討論会
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  • [Presentation] 中性子小角散乱法によるリン脂質輸送タンパク質Sec14の脂質輸送機能の解析2018

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      杉浦太一、吉田右京、中尾裕之、池田恵介、中野実
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      第40回生体膜と薬物の相互作用シンポジウム
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  • [Presentation] 脂質膜パッキングによるリン脂質輸送タンパク質Sec14の活性制御2018

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      杉浦太一、中尾裕之、池田恵介、中野実
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      膜シンポジウム2018
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  • [Presentation] 示差走査熱量測定を用いたセラミドIIIと生体脂質との相互作用の評価2018

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      岩下侑矢、中尾裕之、池田恵介、中野実
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      膜シンポジウム2018
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  • [Presentation] 示差走査熱量測定を用いたセラミドIIIの結晶性の低下をもたらす物質の探索2018

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      岩下侑矢、中尾裕之、池田恵介、中野実
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      日本薬学会北陸支部第130回例会
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  • [Presentation] Amyloid-βと脂質膜の相互作用における膜曲率および酸性リン脂質の影響2018

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      佐々木哲哉、中尾裕之、池田恵介、中野実
    • Organizer
      日本薬学会北陸支部第130回例会
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      2018 Annual Research Report
  • [Presentation] Quantitative analysis of Sec14-mediated lipid transfer by using small-angle neutron scattering2018

    • Author(s)
      杉浦太一、吉田右京、中尾裕之、池田恵介、中野実
    • Organizer
      Asian Biophysics Association Symposium and Annual Meeting of the Australian Society for Biophysics
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    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Phospholipase D による脂質非対称性リポソームの作成2018

    • Author(s)
      黒崎晴子、中尾裕之、池田恵介、中野実
    • Organizer
      日本薬学会第139年会
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  • [Presentation] リン脂質-ペプチドナノファイバー形成過程の可視化2018

    • Author(s)
      清水千夏、中尾裕之、池田恵介、中野実
    • Organizer
      日本薬学会第139年会
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  • [Presentation] ベシクル可溶化による脂質二重層中でのリン脂質-リン脂質分子間相互作用に伴う熱力学量の測定2018

    • Author(s)
      藤原裕平、中尾裕之、池田恵介、中野実
    • Organizer
      日本薬学会第139年会
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  • [Presentation] 親水性アミノ酸残基の位置・膜深さが膜貫通ペプチドのスクランブラーゼ活性に与える影響2018

    • Author(s)
      中尾裕之、杉本佑太、池田恵介、斎藤大明、中野実
    • Organizer
      日本薬学会第139年会
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      2018 Annual Research Report
  • [Presentation] Scramblase activities of transmembrane peptides depend on relative position of hydrophilic amino acid residues and their depth in the membrane2018

    • Author(s)
      中尾 裕之
    • Organizer
      62nd Annual Meeting of Biophysical Society
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      2017 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 親水性アミノ酸残基の位置に依存した膜貫通ペプチドのリン脂質flip-flop促進能の評価2017

    • Author(s)
      杉本 佑太
    • Organizer
      第55回日本生物物理学会年会
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      2017 Annual Research Report

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Published: 2017-08-25   Modified: 2020-03-30  

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