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メタン発生・分解酵素に学ぶ炭素源有用物質変換を目指した新規生体金属触媒の創成

Research Project

Project/Area Number 17J00008
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section国内
Research Field Inorganic chemistry
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

宮崎 雄大  大阪大学, 工学研究科, 特別研究員(DC1)

Project Period (FY) 2017-04-26 – 2020-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2019)
Budget Amount *help
¥3,100,000 (Direct Cost: ¥3,100,000)
Fiscal Year 2019: ¥1,000,000 (Direct Cost: ¥1,000,000)
Fiscal Year 2018: ¥1,000,000 (Direct Cost: ¥1,000,000)
Fiscal Year 2017: ¥1,100,000 (Direct Cost: ¥1,100,000)
Keywordsメタン発生酵素 / MCR / F430 / ニッケル / メタン / 脱ブロモ化反応 / テトラデヒドロコリン / ミオグロビン / メタン生成 / ジデヒドロコリン / シトクロムb562
Outline of Annual Research Achievements

近年、人工生体触媒による環境負荷軽減型の物質変換が注目されており、その実現には天然酵素の反応制御の仕組みの理解と再現が必要である。本研究ではメタン菌中において生物学的メタンの発生と分解に寄与し、補因子にニッケル錯体F430を有するメチル補酵素M還元酵素(MCR)の反応機構の解明を目的とした。これまでに、ヘムタンパク質の天然補因子ヘムの除去と人工補因子の導入を行う「再構成法」を利用することでタンパク質を基盤とした機能モデルを構築・評価してきた。
本年度は、F430モデル錯体のニッケルテトラデヒドロコリンとヘムを除去したアポミオグロビンの複合化により調製した再構成ミオグロビンを用い、モデル基質との反応を詳細に評価した。まずp-トルエンスルホン酸メチルやトリメチルスルホニウムヨージドからのメタン発生を促進することを確認した。また、臭化ベンジルとの反応では還元的脱ブロモ化反応によるトルエンの生成が確認されたが、一方でホモカップリング反応によるジベンジルの生成は確認されなかった。各臭化ベンジル類縁体のベンジル位の反応性は一級>二級>三級の順に低下し、活性種のニッケル一価種とベンジル位の反応に立体障害が影響することを明らかにした。次に、パラ位置換臭化ベンジルを用いた同様の実験からHammett plotを作成したところ、極性効果を考慮した置換基定数を用いた場合に、良好な相関関係で正の反応定数を示した。さらに、重水で調製した緩衝液を用いた場合、重水素化トルエンの生成が観測された。以上の結果は、活性種のニッケル一価種がベンジル位に対して求核的なSN2機構により反応し、過渡的に生成したベンジル-ニッケル(III)種中間体のプロトン化により、還元的脱ブロモ化反応が完了することを示唆するものである。以上、本研究はMCRの反応機構解明とそれを応用した人工生体触媒の開発に寄与するものであり、上記の研究成果は国内外の学会で発表を行った。

Research Progress Status

令和元年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和元年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(3 results)
  • 2019 Annual Research Report
  • 2018 Annual Research Report
  • 2017 Annual Research Report
  • Research Products

    (17 results)

All 2019 2018 2017 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (4 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 3 results) Presentation (11 results) (of which Int'l Joint Research: 4 results,  Invited: 1 results) Remarks (1 results)

  • [Int'l Joint Research] CNRS/Strasbourg University(フランス)

    • Related Report
      2017 Annual Research Report
  • [Journal Article] Construction and Evaluation of a Protein-based Functional Model of Methane-producing Enzyme2019

    • Author(s)
      Yuta Miyazaki
    • Journal Title

      Bulletin of Japan Society of Coordination Chemistry

      Volume: 73 Pages: 48-50

    • Related Report
      2019 Annual Research Report 2018 Annual Research Report
  • [Journal Article] Myoglobin Reconstituted with Ni Tetradehydrocorrin as a Methane‐Generating Model of Methyl‐coenzyme M Reductase2019

    • Author(s)
      Oohora Koji、Miyazaki Yuta、Hayashi Takashi
    • Journal Title

      Angewandte Chemie International Edition

      Volume: 58 Issue: 39 Pages: 13813-13817

    • DOI

      10.1002/anie.201907584

    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Methane generation via intraprotein C-S bond cleavage in cytochrome b562 reconstituted with nickel didehydrocorrin2019

    • Author(s)
      Miyazaki Yuta、Oohora Koji、Hayashi Takashi
    • Journal Title

      Journal of Organometallic Chemistry

      Volume: 901 Pages: 120945-120945

    • DOI

      10.1016/j.jorganchem.2019.120945

    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] CuAAC in a Distal Pocket: Metal Active-Template Synthesis of Strapped-Porphyrin [2]Rotaxanes2017

    • Author(s)
      Miyazaki Yuta、Kahlfuss Christophe、Ogawa Ayumu、Matsumoto Takashi、Wytko Jennifer A.、Oohora Koji、Hayashi Takashi、Weiss Jean
    • Journal Title

      Chemistry - A European Journal

      Volume: 23 Issue: 55 Pages: 13579-13582

    • DOI

      10.1002/chem.201702553

    • Related Report
      2017 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Presentation] Construction and Evaluation of a Protein-based Functional Model to Replicate a Methane-producing Enzyme2019

    • Author(s)
      Yuta Miyazaki, Koji Oohora, Takashi Hayashi
    • Organizer
      The 29th Symposium on Role of Metals in Biological Reactions, Biology and Medicine (SRM2019)
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Construction and Evaluation of a Hemoprotein-based Functional Model of Methane-producing Enzyme2019

    • Author(s)
      Yuta Miyazaki, Koji Oohora, Takashi Hayashi
    • Organizer
      15th International Symposium on Applied Bioinorganic Chemistry (ISABC15)
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Construction and Evaluation of Functional Models of Methane-producing Enzyme by Combining a Ni Corrinoid Complex with a Protein Matrix as a Reaction Scaffold2019

    • Author(s)
      Yuta Miyazaki, Koji Oohora, Takashi Hayashi
    • Organizer
      日本化学会第99春季年会
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
  • [Presentation] Construction and Evaluation of a Protein-based Functional Model of Methane-producing Enzyme2018

    • Author(s)
      Yuta Miyazaki, Koji Oohora, Takashi Hayashi
    • Organizer
      The 98th Conference of japan Society of Coordination Chemistry
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
  • [Presentation] Methanogenesis from a Hemoprotein-based Functional Model of Methane-producing Enzyme2018

    • Author(s)
      Yuta Miyazaki, Koji Oohora, Takashi Hayashi
    • Organizer
      JSPS Japanese-German Graduate Externship International Symposium Biological and Chemical Methods for Selective Catalysis
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] タンパク質を基盤としたメタン発生酵素の機能モデル構築:シンプルな再構成ヘムタンパク質による反応性の再現2018

    • Author(s)
      宮崎雄大
    • Organizer
      第31回生物無機化学夏季セミナー
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      2018 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] ヘムタンパク質を基盤としたメタン発生酵素の機能モデルの構築と評価2018

    • Author(s)
      宮崎雄大、大洞光司、林高史
    • Organizer
      日本化学会第98春季年会
    • Related Report
      2017 Annual Research Report
  • [Presentation] タンパク質反応場を有するメタン発生酵素モデルの構築と評価2017

    • Author(s)
      宮崎雄大、大洞光司、林高史
    • Organizer
      第56回 錯体化学若手の会近畿支部勉強会
    • Related Report
      2017 Annual Research Report
  • [Presentation] メタン発生酵素のタンパク質反応場を模倣した再構成ヘムタンパク質を基盤とするモデル構築2017

    • Author(s)
      宮崎雄大、大洞光司、林高史
    • Organizer
      第5回 バイオ関連化学シンポジウム若手フォーラム
    • Related Report
      2017 Annual Research Report
  • [Presentation] タンパク質反応場を有するメタン発生酵素モデルを指向した再構成ヘムタンパク質の創製とメタン発生能の評価2017

    • Author(s)
      宮崎雄大、大洞光司、林高史
    • Organizer
      第11回バイオ関連化学シンポジウム
    • Related Report
      2017 Annual Research Report
  • [Presentation] A Protein-based Functional Model of Methane-generating Enzyme: A Hemoprotein Reconstituted with a Porphyrinoid Nickel Complex2017

    • Author(s)
      Yuta Miyazaki, Koji Oohora, Takashi Hayashi
    • Organizer
      Joint Symposium Aachen-Osaka Selectivity in Chemo- and Biocatalysis
    • Related Report
      2017 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Remarks] 大阪大学大学院工学研究科林研究室HP

    • URL

      http://www.chem.eng.osaka-u.ac.jp/~hayashiken/

    • Related Report
      2019 Annual Research Report 2018 Annual Research Report 2017 Annual Research Report

URL: 

Published: 2017-05-25   Modified: 2024-03-26  

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