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タンパク質のバルクリン酸化とその水和効果から理解する分裂期染色体構築機構

Research Project

Project/Area Number 17J09002
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section国内
Research Field Functional biochemistry
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

山崎 啓也  京都大学, 生命科学研究科, 特別研究員(DC1)

Project Period (FY) 2017-04-26 – 2020-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2019)
Budget Amount *help
¥2,500,000 (Direct Cost: ¥2,500,000)
Fiscal Year 2019: ¥800,000 (Direct Cost: ¥800,000)
Fiscal Year 2018: ¥800,000 (Direct Cost: ¥800,000)
Fiscal Year 2017: ¥900,000 (Direct Cost: ¥900,000)
Keywordsリン酸化 / 分裂期リン酸化 / 定量質量分析 / 染色体凝縮 / 相分離 / 質量分析
Outline of Annual Research Achievements

本研究は、分裂期移行に伴う染色体関連タンパク質のバルクリン酸化の役割を、DNAとタンパク質が高濃度で存在する環境における、リン酸基周辺の水和効果から解明することにある。採用第3年目の本年は、研究項目3「in vitroクロマチン再構成におけるリン酸化タンパク質のバルク効果の検証」を行った。
Ki-67の分裂期における機能へのバルクリン酸化の影響の検証
Ki-67は、rRNAや核小体タンパク質で構成される分裂期染色体周縁部の構築に必須のタンパク質である。分裂期染色体周縁部は、染色体一つ一つの独立性を保つことに寄与していることが報告されている。さらには、染色体周縁部は液相ではないかと示唆されてきた。前年までの結果より、Ki-67が分裂期バルクリン酸化タンパク質であり、その分裂期バルクリン酸化がKi-67のin vitroにおける液相の形成に重要であることがわかった。
本年度はまずKi-67のバルクリン酸化の効果をin vivoで検証した。Ki-67の変異体を用いた解析により、Ki-67が分裂期リン酸化を受けることで染色体周縁部を構築し、それによって染色体の異常な凝集を防いでいることがわかった。
最後に、液相形成による染色体周縁部in vitro再構成を試みた。この解析から、Ki-67の分裂期バルクリン酸化が液相形成を促進する役割を持つとともに、Ki-67のDNA結合能によって液相形成可能な程度まで分子の局所濃度が上昇するメカニズムが示唆された。
これらの結果から、分裂期移行に伴う染色体関連タンパク質のバルクリン酸化が、液-液相分離の原理を通じて分裂期染色体構築に寄与していることが明らかになった。

Research Progress Status

令和元年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和元年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(3 results)
  • 2019 Annual Research Report
  • 2018 Annual Research Report
  • 2017 Annual Research Report
  • Research Products

    (5 results)

All 2020 2019 2018 2017

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 1 results) Presentation (3 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results)

  • [Journal Article] Quantitative proteomics indicate a strong correlation of mitotic phospho-/dephosphorylation with non-structured regions of substrates.2019

    • Author(s)
      H. Yamazaki, H. Kosako and S.H. Yoshimura
    • Journal Title

      Biochim. Biophys. Acta. Proteins Proteom.

      Volume: 1968 Issue: 1 Pages: 140295-140295

    • DOI

      10.1016/j.bbapap.2019.140295

    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] N-terminal dual lipidation-coupled targeting into the primary cilium2018

    • Author(s)
      M. Kumeta, Y. Panina, H. Yamazaki, K. Takeyasu and S.H. Yoshimura
    • Journal Title

      Genes to Cells

      Volume: 印刷中 Issue: 8 Pages: 715-723

    • DOI

      10.1111/gtc.12603

    • Related Report
      2018 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] Quantitative proteomics indicate a strong correlation between mitotic phosphorylation/dephosphorylation and structural properties of substrate domains2020

    • Author(s)
      Yamazaki Hiroya、Kosako Hidetaka、Yoshimura Shige H.
    • Organizer
      64th Annual Meeting of Biophysical Society
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Analysis of water dynamics and hydration layer around phosphorylated protein2018

    • Author(s)
      Yamazaki H, Yoshimura SH
    • Organizer
      The 16th International Student Seminar
    • Related Report
      2017 Annual Research Report
  • [Presentation] リン酸化タンパク質におけるリン酸基周辺の水和水動態解析 Analysis of water dynamics around phosphorylated protein2017

    • Author(s)
      Yamazaki H, Yoshimura SH
    • Organizer
      第55回日本生物物理学会年会
    • Related Report
      2017 Annual Research Report

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Published: 2017-05-25   Modified: 2024-03-26  

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