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Comprehensive genomic analysis in patients with disorders of sex development.

Research Project

Project/Area Number 17J40246
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section国内
Research Field Human genetics
Research InstitutionNational Center for Child Health and Development

Principal Investigator

五十嵐 麻希  国立研究開発法人国立成育医療研究センター, 分子内分泌研究部, 特別研究員(RPD)

Project Period (FY) 2017-04-26 – 2020-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2019)
Budget Amount *help
¥4,030,000 (Direct Cost: ¥3,100,000、Indirect Cost: ¥930,000)
Fiscal Year 2019: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2018: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2017: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Keywords46,XY性分化疾患 / MAP3K1遺伝子 / NR5A1遺伝子 / 尿道下裂 / 性分化疾患 / MAP3K1 / NR5A1 / AR / 遺伝子変異 / GATA4
Outline of Annual Research Achievements

46,XY性分化疾患を呈する兄弟のゲノムDNAを用い、エクソーム解析にて変異解析を行った。その結果、両者においてMAP3K1遺伝子エクソン13にヘテロ接合性1塩基置換(GCAA>GTAA)を検出した。この塩基置換はナンセンス変異であると推測されたが、患者の転写産物にはエクソン13の117塩基が欠失したmRNA(c.2254_2370del)と野生型mRNAがほぼ同程度の比率で含まれることが確認された。患者では、転写産物産生時にエクソン内の未成熟停止コドン(TAA)が選択されず、同部位の潜在性スプライスドナーサイト(GT)が活性化され、本来のエクソン配列の一部がスプライスアウトされたと推測される。同じMAP3K1変異を持つ彼の兄は、正常なゴナドトロピン値と抗ミュラー管ホルモン値に加え、外陰部の男性化不全を示した。エナント酸テストステロンの注射では、両患者のペニスのサイズはほとんど増加しなかった。この研究は、ナンセンス媒介のスプライシングエラーの新しい例を提供し、スプライス部位の認識が必ずしもコンセンサス配列を必要としない可能性があることを示した。さらに、われわれのデータは、MAP3K1異常の表現型スペクトルが現在認識されているよりも広く、アンドロゲン感受性の障害や生殖器形成不全を含むことを示唆した。この成果は、英文科学雑誌への論文投稿準備中である。他に、NR5A1遺伝子変異が同定された46,XX精巣性性分化疾患患者の臨床像についての論文報告にも参加し、掲載に至っている。
尿道下裂(46,XY性分化疾患の軽症型)の環境要因として、母親の飲酒とカフェイン暴露が報告されている。特別研究員は、食を対象としたゲノムワイド関連解析を行った。特記すべき成果として、飲酒頻度・コーヒー摂取量・魚の摂取頻度が同じ遺伝子座に関連する可能性を見出した。これらの成果は、英文科学雑誌に掲載されている。

Research Progress Status

令和元年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和元年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(3 results)
  • 2019 Annual Research Report
  • 2018 Annual Research Report
  • 2017 Annual Research Report
  • Research Products

    (24 results)

All 2019 2018 2017 Other

All Journal Article (10 results) (of which Peer Reviewed: 10 results,  Open Access: 7 results,  Acknowledgement Compliant: 1 results) Presentation (9 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 1 results) Remarks (5 results)

  • [Journal Article] A Follow-Up from Infancy to Puberty in a Japanese Male with<b><i> SRY</i></b>-Negative 46,XX Testicular Disorder of Sex Development Carrying a p.Arg92Trp Mutation in <b><i>NR5A1</i></b>2019

    • Author(s)
      Saito-Hakoda Akiko、Kanno Junko、Suzuki Dai、Kawashima Sayaka、Kamimura Miki、Hirano Koji、Sakai Kiyohide、Igarashi Maki、Fukami Maki、Fujiwara Ikuma
    • Journal Title

      Sexual Development

      Volume: 印刷中 Issue: 2 Pages: 60-66

    • DOI

      10.1159/000496777

    • Related Report
      2019 Annual Research Report 2018 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Identification of the 12q24 locus associated with fish intake frequency by genome-wide meta-analysis in Japanese populations.2019

    • Author(s)
      Igarashi M, Nogawa S, Kawafune K, Hachiya T, Takahashi S, Jia H, Saito K, Kato H.
    • Journal Title

      Gene and Nutrition.

      Volume: 5 Issue: 1 Pages: 21-21

    • DOI

      10.1186/s12263-019-0646-6

    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] GWAS of habitual coffee consumption reveals a sex difference in the genetic effect of the 12q24 locus in the Japanese population.2019

    • Author(s)
      Jia H, Nogawa S, Kawafune K, Hachiya T, Takahashi S, Igarashi M, Saito K, Kato H.
    • Journal Title

      BMC Genet.

      Volume: 20 Issue: 1 Pages: 20-20

    • DOI

      10.1186/s12863-019-0763-7

    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] DNA aneuploidy and centrosome amplification in canine tumor cell lines2019

    • Author(s)
      Endo Yoshifumi、Watanabe Manabu、Miyajima-Magara Nozomi、Igarashi Maki、Mochizuki Manabu、Nishimura Ryohei、Sugano Sumio、Sasaki Nobuo、Nakagawa Takayuki
    • Journal Title

      Tissue and Cell

      Volume: 61 Pages: 67-71

    • DOI

      10.1016/j.tice.2019.09.003

    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Dihydrotestosterone induces minor transcriptional alterations in genital skin fibroblasts of children with and without androgen insensitivity2019

    • Author(s)
      Tanase-Nakao Kanako、Mizuno Kentaro、Hayashi Yutaro、Kojima Yoshiyuki、Hara Mariko、Matsumoto Kenji、Matsubara Yoichi、Igarashi Maki、Miyado Mami、Fukami Maki
    • Journal Title

      Endocrine Journal

      Volume: 66 Issue: 4 Pages: 387-393

    • DOI

      10.1507/endocrj.EJ18-0494

    • NAID

      130007636463

    • ISSN
      0918-8959, 1348-4540
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] GATA4 mutations are uncommon in patients with 46,XY disorders of sex development without heart anomaly.2018

    • Author(s)
      Igarashi M, Mizuno K, Kon M, Narumi S, Kojima Y, Hayashi Y, Ogata T, Fukami M
    • Journal Title

      Asian journal of andrology

      Volume: 印刷中 Issue: 6 Pages: 0-0

    • DOI

      10.4103/aja.aja_20_18

    • Related Report
      2018 Annual Research Report 2017 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] MIRAGE syndrome is a rare cause of 46,XY DSD born SGA without adrenal insufficiency.2018

    • Author(s)
      Shima H, Hayashi M, Tachibana T, Oshiro M, Amano N, Ishii T, Haruna H, Igarashi M, Kon M, Fukuzawa R, Tanaka Y, Fukami M, Hasegawa T, Narumi S.
    • Journal Title

      PLoS One.

      Volume: 13 Issue: 11 Pages: e0206184-e0206184

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0206184

    • Related Report
      2018 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Phenotypic Variation in 46,XX Disorders of Sex Development due to the NR5A1 p.R92W Variant: A Sibling Case Report and Literature Review.2018

    • Author(s)
      Takasawa K, Igarashi M, Ono M, Takemoto A, Takada S, Yamataka A, Ogata T, Morio T, Fukami M, Kashimada K.
    • Journal Title

      Sexual Development

      Volume: 24 Issue: 5-6 Pages: 5-6

    • DOI

      10.1159/000485868

    • Related Report
      2017 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Gain-of-function mutations in G-protein coupled receptor genes associated with human endocrine disorders.2018

    • Author(s)
      Fukami M, Suzuki E, Igarashi M, Miyado M and Ogata T.
    • Journal Title

      Clin Endocrinol (Oxf).

      Volume: 88 Issue: 3 Pages: 351-359

    • DOI

      10.1111/cen.13496

    • Related Report
      2017 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Paradoxical gain-of-function mutant of the G-protein-coupled receptor PROKR2 promotes early puberty.2017

    • Author(s)
      Fukami M, Suzuki E, Izumi Y, Torii T, Narumi S, Igarashi M, Miyado M, Katsumi M, Fujisawa Y, Nakabayashi K, Hata K, Umezawa A, Matsubara Y, Yamauchi J, Ogata T.
    • Journal Title

      Journal of Cellular and Molecular Medicine

      Volume: - Issue: 10 Pages: 2623-2626

    • DOI

      10.1111/jcmm.13146

    • Related Report
      2017 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] GWASによって見出された12q24遺伝子座と紅茶消費量との関連2019

    • Author(s)
      五十嵐 麻希、賈 慧娟、野川 駿、 川舩 かおる、八谷 剛史、高橋 祥子、 斉藤 憲司、加藤 久典
    • Organizer
      第73回日本栄養・食糧学会大会
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
  • [Presentation] 食にまつわるGWAS研究2019

    • Author(s)
      五十嵐 麻希
    • Organizer
      イルミナセミナー「消費者向け遺伝子解析サービスを活用した研究最前線」多検体解析によるビッグデータ活用から見えてくる複雑な疾患克服への展望
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 日本人GWASから見えてきた12q24領域と食の関連2019

    • Author(s)
      五十嵐 麻希、賈 慧娟、野川 駿、 川舩 かおる、八谷 剛史、高橋 祥子、 斉藤 憲司、加藤 久典
    • Organizer
      第4回食欲・食嗜好研究会
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
  • [Presentation] 東アジア系集団に特有の12q24領域は多彩な摂取行動に関連する2019

    • Author(s)
      五十嵐 麻希、賈 慧娟、野川 駿、 川舩 かおる、八谷 剛史、高橋 祥子、 斉藤 憲司、加藤 久典
    • Organizer
      弟42回日本分子生物学会年会
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
  • [Presentation] GWAS reveals the association between black tea consumption and 12q24 locus in Japanese population2019

    • Author(s)
      Maki Igarashi, Huijuan Jia, Shun Nogawa, Kaoru Kawafune, Tsuyoshi Hachiya , Shoko Takahashi, Kenji Saito ,Hisanori Kato
    • Organizer
      Asian congress of Nutrition 2019
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] MAP3K1遺伝子のナンセンス随伴スプライス変更による46,XY性分化疾患の発症2018

    • Author(s)
      五十嵐麻希、金城健一、中尾美奈子、宮戸真美、堀川玲子、 緒方勤、 深見真紀
    • Organizer
      性スペクトラムー連続する表現型としての雌雄 第2 回領域会議
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
  • [Presentation] ナンセンス随伴スプライス変更による46,XY性分化疾患の発症2018

    • Author(s)
      五十嵐麻希
    • Organizer
      性スペクトラムー連続する表現型としての雌雄 第一会班会議
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      2017 Annual Research Report
  • [Presentation] 46,XY性分化疾患兄弟例におけるMAP3K1変異の同定2017

    • Author(s)
      五十嵐麻希、金城健一、堀川玲子、緒方勤、深見真紀
    • Organizer
      日本人類遺伝学会
    • Related Report
      2017 Annual Research Report
  • [Presentation] Nonsense-associated altered splicing leading to a human disorder: Identification of MAP3K1 in two brothers with 46,XY disorders of sex development2017

    • Author(s)
      五十嵐麻希、金城健一、堀川玲子、緒方勤、深見真紀
    • Organizer
      日本分子生物学会
    • Related Report
      2017 Annual Research Report
  • [Remarks] 成育医療研究センター 分子内分泌研究部

    • URL

      http://nrichd.ncchd.go.jp/endocrinology/pages/research.html

    • Related Report
      2019 Annual Research Report
  • [Remarks] 東京大学 健康栄養機能学

    • URL

      http://park.itc.u-tokyo.ac.jp/food/about.html

    • Related Report
      2019 Annual Research Report
  • [Remarks] 国立成育医療研究センター 分子内分泌研究部

    • URL

      http://nrichd.ncchd.go.jp/endocrinology/index.htm

    • Related Report
      2018 Annual Research Report
  • [Remarks] 国立成育医療研究センター 研究所 分子内分泌研究部

    • URL

      http://nrichd.ncchd.go.jp/endocrinology/index.htm

    • Related Report
      2017 Annual Research Report
  • [Remarks] リサーチマップ 五十嵐麻希

    • URL

      https://researchmap.jp/maki_igarashi/

    • Related Report
      2017 Annual Research Report

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Published: 2017-05-25   Modified: 2024-03-26  

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