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Characterization of the biological functions of the neuronal transcription factor MIBP1 using genome editing

Research Project

Project/Area Number 17K07245
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Research Field Genome biology
Research InstitutionKinjo Gakuin University

Principal Investigator

Tomoko Tahira  金城学院大学, 薬学部, 准教授 (50155230)

Project Period (FY) 2017-04-01 – 2023-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2022)
Budget Amount *help
¥4,940,000 (Direct Cost: ¥3,800,000、Indirect Cost: ¥1,140,000)
Fiscal Year 2019: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2018: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
Fiscal Year 2017: ¥1,820,000 (Direct Cost: ¥1,400,000、Indirect Cost: ¥420,000)
Keywords転写因子 / ゲノム編集 / 遺伝子発現調節
Outline of Final Research Achievements

The MIBP1 (HIVEP2) gene encodes a 270 kDa protein that acts as a transcription factor, by binding to specific DNA sequences. Loss of function mutations in the MIBP1 gene have been associated with intellectual disabilities, suggesting that MIBP1 is crucial for proper brain development and function.
To identify target genes for transcriptional regulation by MIBP1 protein, we tried to insert FLAG-tag sequence to endogenous MIBP1 gene by genome editing of various cell lines. One of established cell lines, M15, which is derived from HCT116 colon cancer cells have both wild type and edited allele. MIBP1 expression was induced immediately after TNF-alpha treatment from the edited allele as well as the wild type allele. Increased mRNA expression was accompanied by enhanced expression of FLAG-tagged MIBP1 protein. As a result of genome editing, changes in mRNA stability were observed.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

本研究では、転写因子をコードする内在性MIBP1遺伝子に対してゲノム編集によりエピトープタグ配列を導入することで、タグ配列に対する抗体を用いて高感度にタンパク質の解析を行うことが可能となった。これは抗体の品質によってはタンパク質解析の結果の再現性が得られない問題を解決するものである。本研究により、MIBP1タンパク質の発現が炎症性サイトカインであるTNF-αにより上昇することが明らかになった。一方、ゲノム編集で本来なかった配列を挿入したことによりmRNAの安定性が変化するという副次的な影響もあることがわかった。

Report

(7 results)
  • 2022 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2021 Research-status Report
  • 2020 Research-status Report
  • 2019 Research-status Report
  • 2018 Research-status Report
  • 2017 Research-status Report
  • Research Products

    (9 results)

All 2023 2022 2021 2020 2019

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 2 results) Presentation (7 results)

  • [Journal Article] Docosahexaenoic Acid Increases Vesicular Glutamate Transporter 2 Protein Levels in Differentiated NG108-15 Cells2022

    • Author(s)
      Daisuke Miyazawa, Yeonjoo Lee, Mao Tsuchiya, Tomoko Tahira, Hideki Mizutani, Naoki Ohara
    • Journal Title

      Biological and Pharmaceutical Bulletin

      Volume: 45 Issue: 9 Pages: 1385-1388

    • DOI

      10.1248/bpb.b22-00132

    • ISSN
      0918-6158, 1347-5215
    • Year and Date
      2022-09-01
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Idarubicin, an Anthracycline, Induces Oxidative DNA Damage in the Presence of Copper (II).2020

    • Author(s)
      Mizutani H, Shiga C, Imai M, Ikemura K, Kitamura Y, Ohta K, Miyazawa D, Sakanashi M, Tahira T, Maeda T, Hiraku Y, Kawanishi S.
    • Journal Title

      Anticancer Research

      Volume: 40 Issue: 10 Pages: 5399-5404

    • DOI

      10.21873/anticanres.14548

    • Related Report
      2020 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] 脳神経機能に関与するHIVEP2遺伝子の転写および転写後調節の解析2023

    • Author(s)
      山本 蒼, 中川 朱里, 米田 幸香, 川原 侑奈, 須田 櫻, 髙田 真衣, 夏目 佳乃, 水谷 百合江, 山本 真菜, 宮澤 大介, 田平 知子
    • Organizer
      日本薬学会第143年会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] ドコサヘキサエン酸が分化誘導下NG108-15細胞の小胞グルタミン酸トランスポータータンパク質発現に及ぼす影響2022

    • Author(s)
      宮澤 大介, 李 妍周, 土屋 茉央, 田平 知子, 水谷 秀樹, 大原 直樹
    • Organizer
      第95回 日本生化学会大会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] ゲノム編集によりFLAGタグを付加したHIVEP2タンパク質の発現解析2021

    • Author(s)
      田平知子、関川万里子、曽根実里、北村真央、丹羽夏希、宮澤大介、林健志
    • Organizer
      日本病院薬剤師会東海ブ ロック・日本薬学会東海 支部合同学術大会2021
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] ドコサヘキサエンがNG108-15細胞のシナプス小胞関連タンパク質に及ぼす影響2020

    • Author(s)
      宮澤大介、李妍周、土屋茉央、北森一哉、水谷秀樹、田平知子、大原直樹
    • Organizer
      日本病院薬剤師会東海ブロック・日本薬学会東海支部合同学術大会2020
    • Related Report
      2020 Research-status Report
  • [Presentation] ゲノム編集技術を利用した転写因子MIBP1の機能解析2020

    • Author(s)
      横井直芽、小野友理香、小西紗矢、紅露友梨樺、宮澤大介、林 健志、田平知子
    • Organizer
      日本薬学会第140年会
    • Related Report
      2019 Research-status Report
  • [Presentation] ゲノム編集技術を利用した転写因子MIBP1の機能解析2019

    • Author(s)
      小野友理香、横井直芽、小西紗矢、紅露友梨樺、宮澤大介、林 健志、田平知子
    • Organizer
      第31回日本分子生物学会年会
    • Related Report
      2019 Research-status Report
  • [Presentation] ゲノム編集技術を利用した転写因子MIBP1の機能解析2019

    • Author(s)
      原田有希、中野貴恵、明村あられ、杉沢奏音、小栗帆乃香、宮澤大介、林 健志、田平知子
    • Organizer
      日本薬学会
    • Related Report
      2018 Research-status Report

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Published: 2017-04-28   Modified: 2024-01-30  

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