RNA Sequenceを用いた粘液性肺腺癌の解析

• Project/Area Number: 17K08715
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Section: 一般
• Research Field: Human pathology
• Research Institution: University of Tsukuba
• Principal Investigator: 坂下 信悟 筑波大学, 医学医療系, 准教授 (40620638)
• Project Period (FY): 2017-04-01 – 2019-03-31
• Project Status: Discontinued (Fiscal Year 2018)
• Budget Amount: ¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000); Fiscal Year 2019: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000); Fiscal Year 2018: ¥1,950,000 (Direct Cost: ¥1,500,000、Indirect Cost: ¥450,000); Fiscal Year 2017: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000)
• Keywords: 肺腺癌 / 粘液型肺腺癌 / RNA sequence

Outline of Annual Research Achievements

浸潤性粘液性肺腺癌は、WHO第4版で新たに定義された腺癌の1亜型である。この腺癌は、臨床的にも分子生物学的にも通常型肺癌と異なる性質を持つことが知られている。例えば、通常型に比べて肺内転移を来しやすいなどの特徴がある。浸潤性粘液性肺腺癌については、取り切れれば非常に予後が良いものから、肺内転移を高度にきたし、死に至らしめるものまで様々な悪性度の腫瘍が包括されるが、それらの悪性化メカニズムに関しては、あまり知られていない。今回申請者は、早期の浸潤性粘液性肺腺癌および進行期の浸潤性粘液性肺腺癌の新鮮凍結材料からmicrodissection法を用いてRNAを抽出し、RNA sequence法を用いて解析し、比較検討を行った。まず、Edge R法を用いて発現解析を行った。p<0.05、Fold change>50をカットオフとして解析を行ったところ、進行している浸潤性粘液性肺腺癌において発現が亢進している遺伝子が66種類同定された。DAVIDを用いた検索においては、chromatin organizationに関する遺伝子群に最も差があるという結果であった。申請者は、その遺伝子リストにおいても含まれているHMGA2という遺伝子に注目した。また、IPAを用いたTop Analysis-Ready Molecules においても、発現解析のp-valueにおいてもfold changeにおいても候補として挙がったMUC16という遺伝子にも注目した。次に、1999年～2015年までの肺腺癌手術材料の浸潤性粘液性腺癌35例についてHMGA2およびMUC16に対する免疫組織化学を用いて検索を行った。浸潤性粘液性腺癌の死亡例は3例であったが、いずれもHMGA2、MUC16が高発現していた。以上の結果から、HMGA2とMUC16の高発現が浸潤性粘液性肺腺癌の悪性化に関与している可能性が示された。

Research Products

• [Journal Article] Case report of three EGFR TKI naive lung adenocarcinoma containing double EGFR mutations (L858R/T790M or Exon 19 Deletion/T790M); Comparing genetic information and histology (2018)
  • Author(s): Sakashita Shingo、Shiba-Ishii Aya、Murata Yoshihiko、Sekimoto Ryutaro、Minami Yuko、Sato Yukio、Noguchi Masayuki
  • Journal Title: Pathology - Research and Practice Volume: 214 Issue: 8 Pages: 1224-1230
  • DOI: 10.1016/j.prp.2018.05.016
• [Journal Article] Heterotopic production of ceruloplasmin by lung adenocarcinoma is significantly correlated with prognosis (2018)
  • Author(s): Matsuoka Ryota、Shiba-Ishii Aya、Nakano Noriyuki、Togayachi Akira、Sakashita Shingo、Sato Yukio、Minami Yuko、Noguchi Masayuki
  • Journal Title: Lung Cancer Volume: 118 Pages: 97-104
  • DOI: 10.1016/j.lungcan.2018.01.012
• [Journal Article] High expression of ovarian cancer immunoreactive antigen domain containing 2 (OCIAD2) is associated with poor prognosis in lung adenocarcinoma (2018)
  • Author(s): Sakashita Mai、Sakashita Shingo、Murata Yoshihiko、Shiba-Ishii Aya、Kim Yunjung、Matsuoka Ryota、Nakano Noriyuki、Sato Yukio、Noguchi Masayuki
  • Journal Title: Pathology International Volume: 68 Issue: 11 Pages: 596-604
  • DOI: 10.1111/pin.12724
• [Journal Article] A case of microscopic, multiple sclerosing pneumocytoma (2018)
  • Author(s): Kawai Hitomi、Takayashiki Norio、Otani Haruo、Sakashita Shingo、Noguchi Masayuki
  • Journal Title: Pathology International Volume: 68 Issue: 3 Pages: 196-201
  • DOI: 10.1111/pin.12648
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] The prognostic significance of N-myc downregulated gene 1 in lung adenocarcinoma (2018)
  • Author(s): Dai Tomoko、Dai Yuichi、Murata Yoshihiko、Husni Ryan Edbert、Nakano Noriyuki、Sakashita Shingo、Noguchi Masayuki
  • Journal Title: Pathology International Volume: 68 Issue: 4 Pages: 224-231
  • DOI: 10.1111/pin.12644
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Cyclophilin A expression and its prognostic significance in lung adenocarcinoma (2017)
  • Author(s): Noriyuki Nakano, Shingo Sakashita, Ryota Matsuoka, Yoshihiko Murata, Aya Shiba-Ishii, Naohiro Kobayashi, Yukio Sato, Masayuki Noguchi
  • Journal Title: Pathology International Volume: 67（11） Issue: 11 Pages: 555-563
  • DOI: 10.1111/pin.12593
  • Peer Reviewed