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Posttranscriptional regulation and mutual regulation of small RNA

Research Project

Project/Area Number 17K08830
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Research Field Bacteriology (including mycology)
Research InstitutionOkayama University

Principal Investigator

Mima Takehiko  岡山大学, 医歯薬学総合研究科, 助教 (80596437)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 後藤 和義  岡山大学, 医歯薬学総合研究科, 助教 (20626593)
Project Period (FY) 2017-04-01 – 2020-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2019)
Budget Amount *help
¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000)
Fiscal Year 2019: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2018: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Fiscal Year 2017: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
Keywords二成分制御系 / small RNA / sRNA / 発現調節 / 環境シグナル / 嫌気条件 / VarA/VarA / ArcB/ArcA / Vibrio / RNA結合タンパク質 / Csr / 転写後調節 / 細菌
Outline of Final Research Achievements

VarS/VarA two-component system controls the expression of target genes thorough regulating the expression of small RNAs (sRNAs). In other bacteria, the expression of sRNAs is considered to be regulated only by VarS/VarA system. Vibrio alginolyticus has four sRNAs. In this study, we found that different proteins bound to the promoter region of each sRNA. We also revealed that ArcA, a response regulator of ArcB/ArcA two-component regulatory system, bound only to the promoter region of sRNA1, but not to those of other sRNAs. Furthermore, we revealed that ArcB/ArcA system regulates the expression of sRNA1 when cells were grown under anaerobic conditions. It seems likely that expression of VarS/VarA-controlled sRNAs were controlled not only by VarS/VarA, but also by multiple regulators. From these results, we propose that sRNAs is the arithmetic system to optimize the expression of many target genes by integrating multiple environmental signals.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

本研究成果は、これまでVarS/VarA制御系のみにより調節されると考えられていたsRNAが、複数の環境シグナルを統合して演算し、多数の標的遺伝子の発現を最適化する演算システムであるというモデルを提唱した学術的意義の大変高いものである。また、VarS/VarA-sRNA制御系は細菌の病原因子の発現を調節することから、VarS/VarA-sRNA制御系の各分子を阻害する薬物は病原性発揮阻害薬の候補となり得る。したがって本研究の成果は、新規感染症治療薬の開発にも繋がり得る社会的意義も高いものである。

Report

(4 results)
  • 2019 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2018 Research-status Report
  • 2017 Research-status Report
  • Research Products

    (37 results)

All 2020 2019 2018 2017 Other

All Journal Article (6 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 6 results,  Open Access: 2 results) Presentation (30 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Acceleration of bone regeneration of horizontal bone defect in rats using collagen‐binding basic fibroblast growth factor combined with collagen scaffolds2019

    • Author(s)
      Nakamura Shin、Ito Takashi、Okamoto Kentaro、Mima Takehiko、Uchida Kentaro、Siddiqui Yasir D.、Ito Masahiro、Tai Masako、Okubo Keisuke、Yamashiro Keisuke、Omori Kazuhiro、Yamamoto Tadashi、Matsushita Osamu、Takashiba Shogo
    • Journal Title

      Journal of Periodontology

      Volume: - Issue: 9 Pages: 1-10

    • DOI

      10.1002/jper.18-0674

    • NAID

      120006860089

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    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Increase in antibiotic resistant Helicobacter pylori in a University Hospital in Japan2019

    • Author(s)
      Kageyama Chihiro、Sato Mayu、Sakae Hiroyuki、Obayashi Yuka、Kawahara Yoshiro、Mima Takehiko、Matsushita Osamu、Yokota Kenji、Mizuno Motowo、Okada Hiroyuki
    • Journal Title

      Infection and Drug Resistance

      Volume: 12 Pages: 597-602

    • DOI

      10.2147/idr.s196452

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    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Molecular determinants of Burkholderia pseudomallei BpeEF-OprC efflux pump expression2018

    • Author(s)
      Rhodes Katherine A.、Somprasong Nawarat、Podnecky Nicole L.、Mima Takehiko、Chirakul Sunisa、Schweizer Herbert P.
    • Journal Title

      Microbiology

      Volume: 164 Issue: 9 Pages: 1156-1167

    • DOI

      10.1099/mic.0.000691

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    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Vibrio alginolyticus VepA Induces Lysosomal Membrane Permeability and Cathepsin-Independent Cell Death2018

    • Author(s)
      Darwinata Agus Eka、Gotoh Kazuyoshi、Mima Takehiko、Yamamoto Yumiko、Yokota Kenji、Matsushita Osamu
    • Journal Title

      Acta Medica Okayama

      Volume: 72 Issue: 3 Pages: 231-239

    • DOI

      10.18926/AMO/56068

    • NAID

      120006482817

    • URL

      https://ousar.lib.okayama-u.ac.jp/56068

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  • [Journal Article] Expression of Collagenase is Regulated by the VarS/VarA Two-Component Regulatory System in Vibrio alginolyticus2017

    • Author(s)
      Mima Takehiko、Gotoh Kazuyoshi、Yamamoto Yumiko、Maeda Keiko、Shirakawa Taku、Matsui Shunsuke、Murata Yumi、Koide Takaki、Tokumitsu Hiroshi、Matsushita Osamu
    • Journal Title

      The Journal of Membrane Biology

      Volume: 251 Issue: 1 Pages: 51-63

    • DOI

      10.1007/s00232-017-9991-9

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  • [Journal Article] Mechanisms of Resistance to Folate Pathway Inhibitors in Burkholderia pseudomallei : Deviation from the Norm2017

    • Author(s)
      Podnecky Nicole L.、Rhodes Katherine A.、Mima Takehiko、Drew Heather R.、Chirakul Sunisa、Wuthiekanun Vanaporn、Schupp James M.、Sarovich Derek S.、Currie Bart J.、Keim Paul、Schweizer Herbert P.
    • Journal Title

      mBio

      Volume: 8 Issue: 5

    • DOI

      10.1128/mbio.01357-17

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  • [Presentation] Vibrio alginolyticusのArcAによるsRNA1発現調節機構の解明2020

    • Author(s)
      美間健彦、Agus Eka Darwinata、後藤和義、山本由弥子、松下 治
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      松下 治、美間健彦、後藤和義、山本由弥子、Perry Caviness、Joshua Sakon、内田健太郎、中村 心、岡本健太郎、高柴正悟
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      横田憲治、小畑智実、市原愛夏、美間健彦、山本由弥子、後藤和義、松下 治
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  • [Presentation] Regulation of small RNA expression in Vibrio alginolyticus2019

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      美間健彦、Agus Eka Darwinata、後藤和義、山本由弥子、松下 治
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  • [Presentation] 細菌性コラゲナーゼのコラーゲン・アンカーと歯周組織再生への応用2019

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      松下 治、美間健彦、後藤和義、山本由弥子、Perry Caviness、Joshua Sakon、小出隆規、内田健太郎、中村 心、高柴正悟
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      第92回日本細菌学会総会
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  • [Presentation] ボツリヌス神経毒素の三叉神経節での作用機序の解明2019

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      山本由弥子、丸濱功太郎、松香芳三、美間健彦、後藤和義、Arief Waskitho、横田健二、阪口義彦、松下 治、小熊惠二
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      横田憲治、山本由弥子、美間健彦、後藤和義、松下 治
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      松下 治、後藤和義、美間健彦、山本由弥子、横田憲治
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      Perry Caviness, Takehiko Mima, Osamu Matsushita, Joshua Sakon
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      Experimental Biology 2019
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  • [Presentation] Collagen-binding basic fibroblast growth factor accelerates horizontal bone regeneration2019

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      Shin Nakamura, Takashi Ito, Kentaro Okamoto, Takehiko Mima, Kentaro Uchida, Yasir Dilshad Siddiqui, Masahiro Ito, Masako Tai, Keisuke Okubo, Keisuke Yamashiro, Kazuhiro Omori, Tadashi Yamamoto, Osamu Matsushita, Shogo Takashiba
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      The 97th General Session of the IADR
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    • Author(s)
      岡本憲太郎、中村 心、伊東 孝、Yasir Dilshad Siddiqui、美間健彦、内田健太郎、大森一弘、山本直史、松下 治、高柴正悟
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      第150回日本歯科保存学会 2019年度春季学術大会
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  • [Presentation] Vibrio alginolyticusのArcAによるsRNA1の発現調節機構の解析2019

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  • [Presentation] Elizabethkingia anophelis OKUH1 resist to phagocytosis of J774 macrophage2019

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      I Putu Bayu Mayura, Hayato Nishimura, Kazuyoshi Gotoh, Takehiko Mima, Yumiko Yamamoto, Kenji Yokota, Osamu Matsushita
    • Organizer
      第72回日本細菌学会中国・四国支部総会
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      Kentaro Okamoto, Shin Nakamura, Takashi Ito, Takehiko Mima, Kentaro Uchida, Yasir Dilshad Siddiqui, Masahiro Ito, Masako Tai, Keisuke Okubo, Keisuke Yamashiro, Kazuhiro Omori, Tadashi Yamamoto, Osamu Matsushita, Shogo Takashiba
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      The 4th International Symposium of Medical and Dental Education in Okayama
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  • [Presentation] Vibrio alginolyticusのsRNAの発現調節機構の解析2018

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      美間健彦、Agus Eka Darwinata、後藤和義、山本由弥子、横田憲治、松下 治
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      中村 心、伊東 孝、岡本憲太郎、美間健彦、内田健太郎、Yasir Dilshad Siddiqui、伊東昌洋、田井真砂子、大久保圭祐、山城圭介、大森一弘、山本直史、松下 治、高柴正悟
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      松下 治、後藤和義、美間健彦、山本由弥子、横田憲治
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      I Putu Bayu Mayura、ErIna Nakai、Kazuyoshi Gotoh、Takehiko Mima、Yumiko Yamamoto、Kenji Yokota、Osamu Matsushita
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      美間健彦、西川裕太郎、中田悠介、波多野直哉、後藤和義、山本由美子、横田憲治、松下 治
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      松下 治、美間健彦、後藤和義、山本由美子、横田憲治
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      美間健彦、西川裕太郎、中田悠介、波多野直哉、後藤和義、山本由美子、横田憲治、松下 治
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      第70回日本細菌学会中国・四国支部総会
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      Agus Eka Darwinata、後藤和義、美間健彦、山本由美子、横田憲治、松下 治
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      第70回日本細菌学会中国・四国支部総会
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  • [Remarks] 岡山大学 大学院医歯薬学総合研究科 病原細菌学分野ホームページ

    • URL

      http://www.okayama-u.ac.jp/user/saikin/Bacteriology/Welcome.html

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      2019 Annual Research Report 2018 Research-status Report 2017 Research-status Report

URL: 

Published: 2017-04-28   Modified: 2021-02-19  

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