| Project/Area Number |
17K12772
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Research Field |
Life / Health / Medical informatics
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| Research Institution | Tohoku University |
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Principal Investigator |
Nagaie Satoshi 東北大学, 東北メディカル・メガバンク機構, 助教 (00726466)
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| Project Period (FY) |
2017-04-01 – 2020-03-31
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2019)
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| Budget Amount *help |
¥4,030,000 (Direct Cost: ¥3,100,000、Indirect Cost: ¥930,000)
Fiscal Year 2019: ¥910,000 (Direct Cost: ¥700,000、Indirect Cost: ¥210,000)
Fiscal Year 2018: ¥910,000 (Direct Cost: ¥700,000、Indirect Cost: ¥210,000)
Fiscal Year 2017: ¥2,210,000 (Direct Cost: ¥1,700,000、Indirect Cost: ¥510,000)
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| Keywords | フェノタイピング / 遺伝子環境相互作用 / 医療情報 / 生命情報 / コホート / バイオインフォマティクス |
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| Outline of Final Research Achievements |
A complex interaction between disease-related genetic factors and disease-related environmental factors in type 2 diabetes, the Gene-Environment-Wide-Association Study (GE-WAS), was performed with the Cochran-Mantel-Haenszel chi-square test to draw a GxE landscape plot with the obtained P values and visually capture the relationship between the three factors.
A rule-based algorithm was created and phenotyped using laboratory test values (e.g., glucose, HbA1c), medication information (PMDA-approved prescription drugs), and disease names (ICD10 code: E10-E14) for type 2 diabetes mellitus.
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| Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements |
2型糖尿病は、遺伝因子と環境因子の複雑な相互作用により発症する疾患である。その関連性を把握することはとても重要であり、今回作成したGxEランドスケーププロットを用いることで、遺伝因子、環境因子、2型糖尿病の関係性を簡便に把握することができるものである。
また、今回2型糖尿病の有無について、治療のために用いられる診断病名ではなく、検体検査値や投薬情報等を用いた客観的な病型分類を行うことで、より精度の高いGxEランドスケーププロットを作成した。
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