Search and functional analysis of causal SNPs regulating blood HDL level

• Project/Area Number: 17K13217
• Research Category: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Research Field: Applied health science
• Research Institution: University of Tsukuba
• Principal Investigator: Aita Yuichi 筑波大学, 医学医療系, 助教 (60752152)
• Project Period (FY): 2017-04-01 – 2019-03-31
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2018)
• Budget Amount: ¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000); Fiscal Year 2018: ¥2,080,000 (Direct Cost: ¥1,600,000、Indirect Cost: ¥480,000); Fiscal Year 2017: ¥2,080,000 (Direct Cost: ¥1,600,000、Indirect Cost: ¥480,000)
• Keywords: 生活習慣病

Outline of Final Research Achievements

For the purpose of searching causal SNPs which regulate blood HDL level, the TFEL scan method was used to analyze SNPs in the promoter region of apoAI. First, a reference sequence of the promoter region was inserted into one of two different luciferase reporter vectors and a sequence having only one SNP in the same region was inserted into the other vector. These vectors were co-transfected into human cell lines to evaluate the ratio of luciferase activity. Next, the TFEL scan method was used to identify transcription factors that bind to SNPs selected by screening.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

同定された転写因子をヒト細胞株で過剰発現したところ、内因性のapoAI遺伝子の発現が増加した。apoAIのプロモーター領域にあり、転写活性に影響を与えるSNPと、この部位に結合してapoAI遺伝子の発現を制御する転写因子を同定した。

Research Products

• [Journal Article] Glucocorticoid receptor suppresses gene expression of Rev-erbα (Nr1d1) through interaction with the CLOCK complex (2019)
  • Author(s): Murayama Yuki, Takafumi Miyamoto, et al.
  • Journal Title: FEBS Letters Volume: 593 Issue: 4 Pages: 423-432
  • DOI: 10.1002/1873-3468.13328
  • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
• [Journal Article] Octacosanol and policosanol prevent high-fat diet-induced obesity and metabolic disorders by activating brown adipose tissue and improving liver metabolism (2019)
  • Author(s): Sharma Rahu, Takafumi Miyamoto, et al.
  • Journal Title: Scientific Reports Volume: 9 Issue: 1 Pages: 5169-5169
  • DOI: 10.1038/s41598-019-41631-1
  • NAID: 120007133465
  • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
• [Journal Article] Transgenic Mice Overexpressing SREBP-1a in Male ob/ob Mice Exhibit Lipodystrophy and Exacerbate Insulin Resistance. (2018)
  • Author(s): Ohno H, Matsuzaka T, Tang N, Sharma R, Motomura K, Shimura T, Satoh A, Han SI, Takeuchi Y, Aita Y, Iwasaki H, Yatoh S, Suzuki H, Sekiya M, Nakagawa Y, Sone H, Yahagi N, Yamada N, Higami Y, Shimano H.
  • Journal Title: Endocrinology. Volume: 159(6) Issue: 6 Pages: 2308-2323
  • DOI: 10.1210/en.2017-03179
  • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
• [Journal Article] A candidate functional SNP rs7074440 in TCF7L2 alters gene expression through C-FOS in hepatocytes. (2018)
  • Author(s): Piao X, Yahagi N, Takeuchi Y, Aita Y, Murayama Y, Sawada Y, Shikama A, Masuda Y, Nishi-Tatsumi M, Kubota M, Izumida Y, Sekiya M, Matsuzaka T, Nakagawa Y, Sugano Y, Iwasaki H, Kobayashi K, Yatoh S, Suzuki H, Yagyu H, Kawakami Y, Shimano H.
  • Journal Title: FEBS Lett. Volume: 592(3) Issue: 3 Pages: 422-433
  • DOI: 10.1002/1873-3468.12975
  • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
• [Journal Article] A key role of nuclear factor Y in the refeeding response of fatty acid synthase in adipocytes. (2017)
  • Author(s): Nishi-Tatsumi M, Yahagi N, Takeuchi Y, Toya N, Takarada A, Murayama Y, Aita Y, Sawada Y, Piao X, Oya Y, Shikama A, Masuda Y, Kubota M, Izumida Y, Matsuzaka T, Nakagawa Y, Sekiya M, Iizuka Y, Kawakami Y, Kadowaki T, Yamada N, Shimano H.
  • Journal Title: FEBS Lett Volume: 591 Issue: 7 Pages: 965-978
  • DOI: 10.1002/1873-3468.12620
  • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
• [Journal Article] Elovl6 Deficiency Improves Glycemic Control in Diabetic db / db Mice by Expanding β-Cell Mass and Increasing Insulin Secretory Capacity (2017)
  • Author(s): Zhao Hui、Matsuzaka Takashi、Nakano Yuta、Motomura Kaori、Tang Nie、Yokoo Tomotaka、Okajima Yuka、Han Song-iee、Takeuchi Yoshinori、Aita Yuichi、Iwasaki Hitoshi、Yatoh Shigeru、Suzuki Hiroaki、Sekiya Motohiro、Yahagi Naoya、Nakagawa Yoshimi、Sone Hirohito、Yamada Nobuhiro、Shimano Hitoshi
  • Journal Title: Diabetes Volume: 66 Issue: 7 Pages: 1833-1846
  • DOI: 10.2337/db16-1277
  • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
• [Journal Article] Effect of sodium-glucose cotransporter 2 (SGLT2) inhibition on weight loss is partly mediated by liver-brain-adipose neurocircuitry (2017)
  • Author(s): Sawada Yoshikazu、Izumida Yoshihiko、Takeuchi Yoshinori、Aita Yuichi、Wada Nobuhiro、Li EnXu、Murayama Yuki、Piao Xianying、Shikama Akito、Masuda Yukari、Nishi-Tatsumi Makiko、Kubota Midori、Sekiya Motohiro、Matsuzaka Takashi、Nakagawa Yoshimi、Shimano Hitoshi、Yahagi Naoya
  • Journal Title: Biochem Biophys Res Commun. Volume: 493 Issue: 1 Pages: 40-45
  • DOI: 10.1016/j.bbrc.2017.09.081
  • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
• [Journal Article] Synchronous bilateral pheochromocytomas and paraganglioma with novel germline mutation in MAX: a case report (2017)
  • Author(s): Shibata M, Inaishi T, Miyajima N, Adachi Y, Takano Y, Nakanishi K, Takeuchi D, Noda S, Aita Y, Takekoshi K, Kodera Y, Kikumori T
  • Journal Title: Surg Case Rep Volume: 3 Issue: 1 Pages: 131-131
  • DOI: 10.1186/s40792-017-0408-x
  • NAID: 120007134592
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Presentation] SGLT2阻害薬による肝臓-脳-脂肪神経回路を介した体重低下作用のメカニズムの解明 (2018)
  • Author(s): 沢田義一, 泉田欣彦, 武内謙憲, 會田雄一, 升田紫, 村山友樹, 関谷元博, 松坂賢, 中川嘉, 島野仁, 矢作直也
  • Organizer: 第55回日本臨床分子医学会学術集会
• [Presentation] A candidate functional SNP rs7074440 in TCF7L2 alters gene expression through C-FOS in hepatocytes (2018)
  • Author(s): 朴賢英, 矢作直也, 武内謙憲, 會田雄一, 村山友樹, 沢田義一, 関谷元博, 松坂賢, 中川嘉, 川上康, 島野仁
  • Organizer: 第55回日本臨床分子医学会学術集会
• [Presentation] 糖質・脂肪酸エネルギー基質動員に関する協調制御機構の解明 (2018)
  • Author(s): 泉田欣彦，和田亘弘，矢作直也，武内謙憲，李恩旭，升田紫，沢田義一，戸谷直樹，呼延延人，朴賢英，會田雄一，志鎌明人, 飯塚陽子，島野仁，門脇孝
  • Organizer: 第61回日本糖尿病学会年次学術集会
• [Presentation] 多価不飽和脂肪酸（PUFA）によるSREBP-1特異的な抑制機序の解明 (2018)
  • Author(s): 升田紫, 矢作直也, 武内謙憲, 和田亘弘, 呼延宜人, 李恩旭, 沢田義一, 村山友樹, 朴賢英, 會田雄一, 志鎌明人, 西真貴子, 泉田欣彦, 飯塚陽子, 位高啓史, 片岡一則, 島野仁, 門脇孝
  • Organizer: 第61回日本糖尿病学会年次学術集会
• [Presentation] TFEL scan法を用いたapoAI遺伝子プロモーターのSNP解析 (2018)
  • Author(s): 會田雄一, 矢作直也, 武内謙憲, 朴賢英, 呼延宜人, 和田亘弘, 李恩旭, 村山友樹, 沢田義一, 志鎌明人, 升田紫, 泉田欣彦, 関谷元博, 中川嘉, 松坂賢, 川上康, 島野仁
  • Organizer: 第61回日本糖尿病学会年次学術集会
• [Presentation] シンポジウム・脂肪酸を識る 多価不飽和脂肪酸(PUFA)によるSREBP-1特異的な抑制機序の解明 (2018)
  • Author(s): 升田紫, 矢作直也, 武内謙憲, 和田亘弘, 呼延宜人, 李恩旭, 沢田義一, 村山友樹, 會田雄一, 西真貴子, 泉田欣彦, 位高啓史, 片岡一則, 島野仁, 門脇孝
  • Organizer: 第50回日本動脈硬化学会総会・学術集会
• [Presentation] 肝臓-脳-脂肪神経回路を介したSGLT2阻害薬による体重低下作用のメカニズムの解明 (2018)
  • Author(s): 沢田義一, 泉田欣彦, 武内謙憲, 會田雄一, 升田紫, 村山友樹, 朴賢英, 志鎌明人, 和田亘弘, 関谷元博, 松坂賢, 中川嘉, 島野仁, 矢作直也
  • Organizer: 第50回日本動脈硬化学会総会・学術集会
• [Presentation] Hepatic KLF15 modulates lipogenesis via inhibition of LXR activity by recruiting corepressor RIP140 on SREBP-1c promoter during fasting (2018)
  • Author(s): 武内謙憲, 矢作直也, 會田雄一, 升田紫, 泉田欣彦, 島野仁
  • Organizer: The 6th International Conference on Biology and Pathobiology of KLF/Sp Transcription Factors (KLF-2018)
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] ワンドロップで測定可能な血球分離機能を付属した血液分析カートリッジとポータブル分析デバイスの試作検討 (2018)
  • Author(s): 會田雄一, 久慈知明, 久慈隆介, 永松祐弥, 塩田佳代子, 宇野佳孝, 竹越一博
  • Organizer: 第65回日本臨床検査医学会学術集会
• [Presentation] Hepatic KLF15 modulates lipogenesis via inhibition of LXR activity by recruiting corepressor RIP140 on SREBP-1c promoter during fasting (2018)
  • Author(s): 武内謙憲, 矢作直也, 會田雄一, 村山友樹, Zahra Mehrazad Saber, 和田亘弘, 李恩旭, 呼延宜人, 升田紫, 泉田欣彦, 島野仁
  • Organizer: Asia Pacific Nutrigenomics & Nutrigenetics Organization（APNNO）
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] KLF15は絶食時において脂質代謝と糖代謝を制御する重要な因子である (2017)
  • Author(s): 武内謙憲, 矢作直也, 會田雄一, 村山友樹, 沢田義一, 朴賢英, 志鎌明人, 関谷元博, 松坂賢, 中川嘉, 川上康, 島野仁
  • Organizer: 第54回日本臨床分子医学会学術集会
• [Presentation] KLF15は絶食時において脂質代謝と糖代謝を制御する重要な因子である (2017)
  • Author(s): 武内謙憲, 矢作直也, 會田雄一, 村山友樹, 沢田義一, 朴賢英, 志鎌明人, 升田紫,泉田欣彦, 関谷元博, 松坂賢, 中川嘉, 川上康, 山田信博, 島野仁
  • Organizer: 第60回日本糖尿病学会年次学術集会
• [Presentation] 脂肪酸エネルギー基質動員の優先性を制御する分子基盤の探求 新規エネルギーセンサーの探索 (2017)
  • Author(s): 泉田欣彦, 和田亘弘, 矢作直也, 武内謙憲, 李恩旭, 升田紫, 沢田義一, 戸谷直樹, 朴賢英, 會田雄一, 志鎌明人, 飯塚陽子, 島野仁, 門脇孝
  • Organizer: 第60回日本糖尿病学会年次学術集会
• [Presentation] 多価不飽和脂肪酸（PUFA）によるSREBP-1特異的な抑制機序の解明 (2017)
  • Author(s): 升田紫, 矢作直也, 武内謙憲, 沢田義一, 朴賢英, 會田雄一, 戸谷直樹, 大屋友華里, 志鎌明人, 西真貴子, 泉田欣彦, 飯塚陽子, 位高啓史, 片岡一則, 島野仁, 門脇孝
  • Organizer: 第60回日本糖尿病学会年次学術集会
• [Presentation] 2型糖尿病に関連したTCF7L2遺伝子の一塩基多型の機能分析(Fumctional analysis of TCF7L2 SNPs associated with type 2 diabetes) (2017)
  • Author(s): 朴賢英, 矢作直也, 武内謙憲, 會田雄一, 村山友樹, 沢田義一, 志鎌明人, 升田紫,泉田欣彦, 関谷元博, 松坂賢, 中川嘉, 川上康, 島野仁
  • Organizer: 第60回日本糖尿病学会年次学術集会
• [Presentation] KLF15は絶食時において脂質代謝と糖代謝を抑制する重要な因子である (2017)
  • Author(s): 武内謙憲, 矢作直也, 會田雄一, 村山友樹, 沢田義一, 朴賢英, 志鎌明人, 升田紫, 泉田欣彦, 関谷元博, 松坂賢, 中川嘉, 川上康, 山田信博, 島野仁
  • Organizer: 第49回日本動脈硬化学会総会・学術集会
• [Presentation] KLF15は絶食時に中性脂肪合成から糖新生への速やかな切り替えを可能にする (2017)
  • Author(s): 武内謙憲, 矢作直也, 會田雄一, 村山友樹, 朴賢英, 沢田義一, 志鎌明人, 升田紫,泉田欣彦, 関谷元博, 松坂賢, 中川嘉, 川上康, 島野仁
  • Organizer: 第39回日本臨床栄養学会総会・第38回日本臨床栄養協会総会
• [Presentation] Effect of sodium-glucose cotransporter 2 (SGLT2) inhibition on weight loss is partly mediated by liver-brain-adipose neurocircuitry (2017)
  • Author(s): 沢田義一, 泉田欣彦, 武内謙憲, 會田雄一, 和田亘弘, 李恩旭, 村山友樹, 朴賢英, 志鎌明人, 升田紫, 西真貴子, 久保田みどり, 関谷元博, 松坂賢, 中川嘉, 島野仁, 矢作直也
  • Organizer: 第40回日本分子生物学会年会・第90回日本生化学会大会(ConBio2017)
• [Remarks] 筑波大学医学医療系ニュートリゲノミクスリサーチグループ
  • URL: https://nyahagi.wixsite.com/ngrg
• [Remarks] 筑波大学医学医療系ニュートリゲノミクスリサーチグループ
  • URL: http://nyahagi.wixsite.com/ngrg