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Molecular mechanism of the heme relay transport by protein complex

Research Project

Project/Area Number 17K15081
Research Category

Grant-in-Aid for Young Scientists (B)

Allocation TypeMulti-year Fund
Research Field Structural biochemistry
Research InstitutionCenter for Novel Science Initatives, National Institutes of Natural Sciences (2018)
Institute for Molecular Science (2017)

Principal Investigator

Muraki Norifumi  大学共同利用機関法人自然科学研究機構(新分野創成センター、アストロバイオロジーセンター、生命創成探究, 生命創成探究センター, 助教 (20723828)

Research Collaborator Aono Shigetoshi  
Project Period (FY) 2017-04-01 – 2019-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2018)
Budget Amount *help
¥4,420,000 (Direct Cost: ¥3,400,000、Indirect Cost: ¥1,020,000)
Fiscal Year 2018: ¥1,950,000 (Direct Cost: ¥1,500,000、Indirect Cost: ¥450,000)
Fiscal Year 2017: ¥2,470,000 (Direct Cost: ¥1,900,000、Indirect Cost: ¥570,000)
Keywordsヘムタンパク質 / 過渡的複合体 / 結晶構造解析 / 生物無機化学 / 鉄 / グラム陽性菌 / 結晶構造 / ヘム / タンパク質複合体 / 蛋白質 / 微生物
Outline of Final Research Achievements

Most commensal or pathogenic bacteria have heme uptake systems for utilizing host heme as an iron source. In Corynebacteia, the heme uptake systems consist of cell surface localized heme binding proteins HtaA and HtaB, and heme transport proteins HmuT, HmuU and HmuV. Although we determined the crystal structure of HtaA, Tab and HmuT recently, the heme relay transfer mechanism is still unclear. In this study, we analyzed the complex structure of heme binding proteins in this system.
We prepared apo form of the N- and C-terminal domains of HtaA and HtaB by mutation. This variants retained the heme binding affinity. Crystal structure of apo form of the C-terminal domain of HtaA H434A variant formed domain swapped dimer. We assume that this dimer mimic transient complex in heme relay.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

感染症の原因となる細菌はヒトの赤血球からヘム鉄を獲得して、鉄源として利用することができる。本研究は、ジフテリアの起炎菌を含むコリネバクテリアにおいてヘム鉄の獲得に利用されるHta/Hmuシステムに着目して、その詳細なヘム鉄輸送機構の解明を目指している。Hta/Hmuシステムの構造情報はジフテリア起炎菌等への特異的な薬剤開発の基盤となりうる。本研究の最終目標である過渡的複合体を介した輸送機構の解明は、生体における物質輸送という生命の根幹を担うシステムの理解につながると考えており、その学術的意義は大きい。

Report

(3 results)
  • 2018 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2017 Research-status Report
  • Research Products

    (8 results)

All 2019 2018 2017

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (7 results)

  • [Journal Article] ガリウム置換が可能にした光化学系Ⅰ-フェレドキシン電子伝達複合体の結晶構造解析2018

    • Author(s)
      河合(久保田) 寿子、村木 則文、田中 秀明、栗栖 源嗣
    • Journal Title

      放射光

      Volume: 31 Pages: 373-380

    • NAID

      40021766872

    • Related Report
      2018 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Structural insights into the catalytic mechanism of carbon monoxide biosynthesis for the maturation of NiFe-hydrogenases2019

    • Author(s)
      村木則文
    • Organizer
      第99回日本化学会年会
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
  • [Presentation] Hta-Hmuシステムによるヘム鉄輸送機構の構造基盤2018

    • Author(s)
      村木則文
    • Organizer
      第18回日本蛋白質科学会年会
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
  • [Presentation] 光受容体型転写因子CarHの構造と機能の解明2018

    • Author(s)
      村木則文
    • Organizer
      第45回生体分子科学討論会
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
  • [Presentation] コリネバクテリアのヘム取り込み系の構造と機能2017

    • Author(s)
      村木則文、青野重利
    • Organizer
      第17回日本蛋白質科学会年会
    • Related Report
      2017 Research-status Report
  • [Presentation] ヘム取り込み系を担う新規ヘム結合タンパク質HtaA/HtaBの構造と機能2017

    • Author(s)
      村木則文、青野重利
    • Organizer
      第44回生体分子科学討論会
    • Related Report
      2017 Research-status Report
  • [Presentation] コリネバクテリア由来HtaA/HtaBによるヘム認識と輸送の分子基盤2017

    • Author(s)
      村木則文、青野重利
    • Organizer
      第11回バイオ関連シンポジウム
    • Related Report
      2017 Research-status Report
  • [Presentation] コリネバクテリアによるヘムの獲得に関わるHtaファミリータンパク質の結晶構造2017

    • Author(s)
      村木則文、青野重利
    • Organizer
      平成29年度 日本結晶学会年会
    • Related Report
      2017 Research-status Report

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Published: 2017-04-28   Modified: 2020-03-30  

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