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Characterization of DBC1 nuclear bodies built around RNAs

Research Project

Project/Area Number 17K15112
Research Category

Grant-in-Aid for Young Scientists (B)

Allocation TypeMulti-year Fund
Research Field Cell biology
Research InstitutionRitsumeikan University

Principal Investigator

Mannen Taro  立命館大学, 生命科学部, 助教 (50535763)

Project Period (FY) 2017-04-01 – 2020-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2019)
Budget Amount *help
¥4,550,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥1,050,000)
Fiscal Year 2019: ¥650,000 (Direct Cost: ¥500,000、Indirect Cost: ¥150,000)
Fiscal Year 2018: ¥2,340,000 (Direct Cost: ¥1,800,000、Indirect Cost: ¥540,000)
Fiscal Year 2017: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Keywords核内構造体 / ノンコーディングRNA / RNA結合タンパク質 / プロテオミクス / 核内RNA顆粒 / 相分離 / がん / ncRNA / DBC1 / 細胞 / RNAポリメラーゼ / タンパク質修飾 / RNA顆粒
Outline of Final Research Achievements

The roles of the component proteins that DBC1 nuclear bodies built around RNA were intensively studied. First, novel component proteins of DBC1 body were identified by affinity purification mass spectrometry. Second, RNA binding proteins that are essential for nuclear body formation were identified by siRNA treatment. Moreover, RNA binding domain and proline-rich domain, predicts the disordered region, were shown to be required for nuclear body formation. It was detected that the disordered region can cooperate to modulate liquid-liquid phase separation, suggesting this feature underlies the mechanism of the structural roles of the nuclear body built around RNAs.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

がん細胞においてRNAを骨格にDBC1ボディが形成されることから、腫瘍形成の制御因子として知られているDBC1をRNAによる機能制御という観点から解析することができる。また、DBC1ボディの新規構成因子を同定することにより、がん細胞で形成される意義や生理機能を解明することができる。さらにRNAによる構造体形成を介して制御される核内現象などの基礎的解析にとどまらず、腫瘍形成の新しい制御経路が明らかになる可能性が期待される。

Report

(4 results)
  • 2019 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2018 Research-status Report
  • 2017 Research-status Report
  • Research Products

    (23 results)

All 2019 2018 2017 Other

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (19 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Invited: 1 results) Remarks (3 results)

  • [Journal Article] RNase Sensitivity Screening for Nuclear Bodies with RNA Scaffolds in Mammalian Cells2017

    • Author(s)
      Mannen, T. and Hirose, T.
    • Journal Title

      Bio-protocol

      Volume: 7 Issue: 8

    • DOI

      10.21769/bioprotoc.2232

    • Related Report
      2017 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] がん細胞で形成される核内構造体の機能解析2019

    • Author(s)
      萬年太郎
    • Organizer
      第7回生命医科学科コロキウム
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] がん細胞で形成されるDBC1核内RNA顆粒のタンパク質相互作用解析2019

    • Author(s)
      萬年 太郎、山下 暁朗、廣瀬 哲郎、早野 俊哉
    • Organizer
      第21回日本RNA学会
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
  • [Presentation] がん細胞で形成されるDBC1核内RNA顆粒の機能解析2019

    • Author(s)
      萬年 太郎、早野 俊哉
    • Organizer
      稀少疾患カンファランス、国際稀少疾患シンホジウム2019
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
  • [Presentation] がん細胞で形成されるSam68核内構造体とDBC1核内構造体の生理機能の解析2019

    • Author(s)
      後藤雅人、岸田真実、西浦未来、早田美帆、萬年太郎、早野俊哉
    • Organizer
      稀少疾患カンファランス、国際稀少疾患シンホジウム2019
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
  • [Presentation] Analysis of protein-protein interactions within the Sam68 and DBC1 nuclear bodies built around RNAs in cancer cell line2019

    • Author(s)
      Taro Mannen, Akio Yamashita, Tetsuro Hirose
    • Organizer
      EMBO workshop~RNP network dynamics indevelopment and disease
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Analysis of protein-protein interactions within the DBC1 nuclear bodies built around RNAs in cancer cell line2019

    • Author(s)
      萬年 太郎、山下 暁朗、廣瀬 哲郎、早野 俊哉
    • Organizer
      第42回日本分子生物学会年会
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
  • [Presentation] がん細胞で形成されるSam68核内構造体とDBC1核内構造体の機能解析2019

    • Author(s)
      後藤雅人、岸田真実、西浦未来、早田美帆、萬年太郎、山下 暁朗、廣瀬 哲郎、早野俊哉
    • Organizer
      第42回日本分子生物学会年会
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
  • [Presentation] LLPS様の相互作用を介して形成される核内RNA顆粒の機能解析2019

    • Author(s)
      萬年 太郎、山下 暁朗、廣瀬 哲郎、早野 俊哉
    • Organizer
      第4回LLPS研究会・ASUKA若手交流会2019
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
  • [Presentation] Characterization of Sam68 and DBC1 nuclear bodies built around RNAs in cancer cell line2019

    • Author(s)
      Taro Mannen, Ayaka Wada, Yunshi Ning, Miku Nishiura, Miho Hayata, Akio Yamashita, Tetsuro Hirose, Toshiya Hayano
    • Organizer
      The 20th Takeda Science Foundation Symposium
    • Related Report
      2018 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 特定のがん細胞で形成される核内RNA顆粒のタンパク質相互作用解析2018

    • Author(s)
      萬年 太郎、和田 彩花、寧 韻詩、西浦 未来、早田 美帆、山下 暁朗、廣瀬 哲郎、早野 俊哉
    • Organizer
      第20回 日本RNA学会
    • Related Report
      2018 Research-status Report
  • [Presentation] 核内RNA顆粒であるSam68構造体とDBC1構造体の構成因子の探索2018

    • Author(s)
      西浦未来、早田美帆、和田彩花、寧 韻詩、萬年太郎、早野俊哉
    • Organizer
      第4回 稀少疾患セミナー
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      2018 Research-status Report
  • [Presentation] Analysis of protein-protein interactions within the nuclear bodies built around RNAs in cancer cell line2018

    • Author(s)
      Taro Mannen, Ayaka Wada, Yunshi Ning, Miku Nishiura, Miho Hayata, Akio Yamashita, Tetsuro Hirose, Toshiya Hayano
    • Organizer
      The 2nd JAJ (Joint Australia-Japan/Japan-Australia Joint) RNA Meeting
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      2018 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 特定のがん細胞で形成される新規核内RNA顆粒の構成因子の探索2018

    • Author(s)
      萬年 太郎、西浦 未来、早田 美帆、山下 暁朗、廣瀬 哲郎、早野 俊哉
    • Organizer
      第41回 日本分子生物学会年会
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      2018 Research-status Report
  • [Presentation] 核内RNA顆粒であるSam68構造体とDBC1構造体の機能解析2018

    • Author(s)
      西浦未来、早田美帆、萬年太郎、山下 暁朗、廣瀬 哲郎、早野俊哉
    • Organizer
      第41回 日本分子生物学会年会
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      2018 Research-status Report
  • [Presentation] 癌細胞種により、異なるRNAポリメラーゼ転写産物が競合的にDBC1核内構造体の足場となる2017

    • Author(s)
      萬年 太郎、山下征輔, 富田耕造, 五島直樹, 廣瀬哲郎
    • Organizer
      RNAフロンティアミーティング2017
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      2017 Research-status Report
  • [Presentation] がん細胞でRNA顆粒が融合して核内構造体を形成するメカニズムの解明2017

    • Author(s)
      萬年 太郎
    • Organizer
      技術シーズ交流発表会
    • Related Report
      2017 Research-status Report
  • [Presentation] The Sam68 nuclear body is composed of two RNase-sensitive substructures joined by the adaptor HNRNPL2017

    • Author(s)
      Taro Mannen, Seisuke Yamashita, Kozo Tomita, Naoki Goshima, Tetsuro Hirose
    • Organizer
      第3回 稀少疾患セミナー
    • Related Report
      2017 Research-status Report
  • [Presentation] Distinct RNA polymerase transcripts competitively function as scaffold of the DBC1 nuclear bodies in specific cancer cell lines2017

    • Author(s)
      Taro Mannen, Seisuke Yamashita, Kozo Tomita, Naoki Goshima, Tetsuro Hirose
    • Organizer
      第19回日本RNA学会
    • Related Report
      2017 Research-status Report
  • [Presentation] 特定のがん細胞でRNA顆粒が融合して核内構造体を形成するメカニズム2017

    • Author(s)
      萬年 太郎
    • Organizer
      第5回 生命医科学科コロキウム
    • Related Report
      2017 Research-status Report
  • [Remarks] 立命館大学生命科学部生命医科学科プロテオミクス研究室ホームページ

    • URL

      http://www.ritsumei.ac.jp/lifescience/bm/hayano/

    • Related Report
      2019 Annual Research Report
  • [Remarks] 立命館大学研究者ホームページ

    • URL

      http://research-db.ritsumei.ac.jp/Profiles/134/0013382/profile.html

    • Related Report
      2019 Annual Research Report
  • [Remarks] 立命館大学 生命科学部 生命医科学科 プロテオミクス 研究室 ホームページ

    • URL

      http://www.ritsumei.ac.jp/lifescience/bm/hayano/

    • Related Report
      2018 Research-status Report

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Published: 2017-04-28   Modified: 2021-02-19  

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