| Project/Area Number |
17K19248
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Research Field |
Agricultural chemistry and related fields
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| Research Institution | National Institute of Genetics |
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Principal Investigator |
有田 正規 国立遺伝学研究所, 情報研究系, 教授 (10356389)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
川島 武士 国立遺伝学研究所, 情報研究系, 助教 (10378531)
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| Project Period (FY) |
2017-06-30 – 2021-03-31
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| Project Status |
Granted (Fiscal Year 2019)
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| Budget Amount *help |
¥6,370,000 (Direct Cost: ¥4,900,000、Indirect Cost: ¥1,470,000)
Fiscal Year 2019: ¥2,340,000 (Direct Cost: ¥1,800,000、Indirect Cost: ¥540,000)
Fiscal Year 2018: ¥1,820,000 (Direct Cost: ¥1,400,000、Indirect Cost: ¥420,000)
Fiscal Year 2017: ¥2,210,000 (Direct Cost: ¥1,700,000、Indirect Cost: ¥510,000)
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| Keywords | 糖質加水分解酵素 / 糖転移酵素 / 食生活 / ビフィズス菌 / 乳酸菌 / 全ゲノム解析 / ゲノム / データベース / オープンデータ |
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| Outline of Annual Research Achievements |
多様な哺乳類と共生するビフィズス菌ゲノムの幅広さを解析するために、食生活が大きく異なる動物から新規のビフィズス菌同定を、ボローニャ大学のマタレッリ (P. Mattarelli, M. Modesto) グループと共同でおこなった。果実食のエジプトルーセットオオコウモリ (Rousettus aegyptiacus) 、草食のゲラダヒヒ (Theropithecus gelada) 、雑食のマーモセット (Callithrix jacchus) などから新規株の検出をおこない、それぞれ Bifidobacterium rousetti と B. vespertilionis, Alloscardovia theropitheci, B. jacchi と名付けた新種を報告した。（コウモリからは2種を新規同定した。）
これらのビフィズス菌類が様々な生物特異的に共生できるメカニズムを調べるため、多様な生物と共生できる株と比較しつつ糖代謝遺伝子の全ゲノム解析を実施した。とりわけ植物由来の多糖類や母乳中のオリゴ糖との関係を調査し，５単糖やシアル酸代謝との関連を見出した。結果として、ビフィズス菌類は動物の系統分類よりも食事の分類により近い糖質加水分解酵素、糖転移酵素の遺伝子集合を有することを見出した。またこうした糖関連酵素群のなかで基準ゲノムとしてすべてに保持されるものが非常に少ないことも明らかにした。また乳酸菌属における遺伝子水平伝搬（HGT)の概要を調査し、HGT候補となる遺伝子の探索パイプラインを構築している。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
1: Research has progressed more than it was originally planned.
Reason
多くの新規ビフィズス菌類を同定することができた。また食事と腸内細菌の関係を明らかにするのに十分なデータを取得できた。
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| Strategy for Future Research Activity |
食事と腸内細菌の関係について論文化する。ボローニャ大学とは学生および教員の交流を実施する予定であったが、コロナウィルス対応のために中止せざるを得ない。ビデオ会議は可能だが、次世代の研究者養成という視点ではマイナスのため、代替案を考える必要がある。
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Report
(3 results)
Research Products
(14 results)
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[Journal Article] Bifidobacterium jacchi sp. nov., isolated from the faeces of a baby common marmoset (Callithrix jacchus)2019
Author(s)
Modesto M, Watanabe K, Arita M, Satti M, Oki K, Sciavilla P, Patavino C, Camma C, Michelini S, Sgorbati B, Mattarelli P
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Journal Title
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology
Volume: 69
Pages: 2477-2485
DOI
Related Report
Peer Reviewed / Int'l Joint Research
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[Journal Article] Alloscardovia theropitheci sp. nov., isolated from the faeces of gelada baboon, the 'bleeding heart' monkey (Theropithecus gelada)2019
Author(s)
Modesto M, Satti M, Watanabe K, Sciavilla P, Felis GE, Sandri C, Spiezio C, Arita M, Mattarelli P
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Journal Title
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology
Volume: 69
Pages: 3041-3048
DOI
Related Report
Peer Reviewed / Int'l Joint Research
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[Journal Article] Characterization of Bifidobacterium species in feaces of the Egyptian fruit bat: Description of B. vespertilionis sp. nov. and B. rousetti sp. nov.2019
Author(s)
Modesto M, Satti M, Watanabe K, Puglisi E, Morelli L, Huang CH, Liou JS, Miyashita M, Tamura T, Saito S, Mori K, Huang L, Sciavilla P, Sandri C, Spiezio C, Vitali F, Cavalieri D, Perpetuini G, Tofalo R, Bonetti A, Arita M, Mattarelli P
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Journal Title
Systematic and Applied Microbiology
Volume: 42
Pages: 126017-126017
DOI
Related Report
Peer Reviewed / Int'l Joint Research
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[Journal Article] Lactobacillus paragasseri sp. nov., a sister taxon of Lactobacillus gasseri, based on whole-genome sequence analyses2018
Author(s)
Tanizawa Y, Tada I, Kobayashi H, Endo A, Maeno S, Toyoda A, Arita M, Nakamura Y, Sakamoto M, Ohkuma M, Tohno M
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Journal Title
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology
Volume: 68
Pages: 3512-3517
DOI
Related Report
Peer Reviewed
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