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転写と染色体領域の視点から見たゲノムDNA損傷位置情報の解析

Research Project

Project/Area Number 18012023
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Biological Sciences
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

豊國 伸哉  Kyoto University, 医学研究科, 准教授 (90252460)

Project Period (FY) 2006 – 2007
Project Status Completed (Fiscal Year 2007)
Budget Amount *help
¥10,900,000 (Direct Cost: ¥10,900,000)
Fiscal Year 2007: ¥5,500,000 (Direct Cost: ¥5,500,000)
Fiscal Year 2006: ¥5,400,000 (Direct Cost: ¥5,400,000)
Keywords酸化ストレス / 発癌 / 腎臓 / 変異 / マイクロアレイ / 遺伝子増幅 / ptprz1 / 修飾塩基 / 免疫沈降 / 染色体領域 / CGHアレイ
Research Abstract

新たに開発したDNA断片の免疫沈降法により、酸化ストレスによるゲノムDNA傷害部位がランダムではないことを、ラット鉄ニトリロ三酢酸誘発腎癌モデルを使用して初めて明らかにした。その片寄りを決定する要素は、当該ゲノム部位が遺伝子か否か、その発現量、核内位置(染色体領域)、反応化学種などが想定された。gpt delta transgenic mouseを使用して、酸化ストレス発がんにおける変異スペクトラムを評価した。点突然変異はG:Cを標的とするもの(特にG:C to C:G)が多いことが判明し、1kb以上の欠損を比較的高頻度に認めた。この傾向は放射線や紫外線と異なり、正常の大腸粘膜に類似していた。鉄ニトリロ三酢酸誘発腎癌においてCGH解析を行い、動物モデルとしては初めて、共通した領域で高頻度のアレル損失や、染色体領域の増幅を認めた。ほとんどアレル増減のないEkerラット腎癌や他の発癌モデルと対照を呈した。この結果は染色体レベルの異常が高頻度に見られるヒトの発がんにおいても酸化ストレスが関与していることを示唆する。ヒトの染色体座標ヘデータを変換し種々のヒト癌のデータと比較検討も試みた。更に、アレイCGHと発現マイクロアレイの データから、本発癌モデルにおいて増幅する癌遺伝子を同定した。染色体全領域の中で、ラット染色体4番短腕(ヒト染色体7番)で高頻度の遺伝子増幅を認め、その部位に存在するptprzlに着目し た。これまで、phosphataseは癌抑制遺伝子とみなされる場合が多かったが、今回は転写因子であるβカテニンが分解されないよう核への移行を促進する癌遺伝子としての新たなメカニズムを解明した。

Report

(2 results)
  • 2007 Annual Research Report
  • 2006 Annual Research Report
  • Research Products

    (8 results)

All 2008 2007 2006

All Journal Article (7 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Presentation (1 results)

  • [Journal Article] Overexpressin of a transcription factor LYL-1 induces T-and B-cell lymphoma in mice.2007

    • Author(s)
      Zhong Y, Li J, Hiai H, Toyokuni S* and Yamada Y*
    • Journal Title

      Oncogene 26

      Pages: 6937-6947

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Association of microRNA-34a overexpression with proliferation is cell type-dependent.2007

    • Author(s)
      Dutta KK, Zhong Y, Liu YT, et. al.
    • Journal Title

      Cancer Sci 98

      Pages: 1845-1852

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Chronic oxidative stress causes amplification and overexpresson of ptprzl protein tyrosine phosphatase to2007

    • Author(s)
      Liu YT, Shang DH, Akatsuka S, et. al.
    • Journal Title

      Am J Pathol 171

      Pages: 1978-1988

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Contrasting genome-wide distribution of 8-hydroxyguanine and acrolein-modified adenine during oxidative stess-induced renal carcinogenesis2006

    • Author(s)
      Akatsuka S et al.
    • Journal Title

      The American Journal of Pathology 169/4

      Pages: 1328-1342

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] Deletion and single nucleotide substitution at G : C in the kidney of gpt delta transgenic mice after ferric nitrilotriacetate treatment2006

    • Author(s)
      Jiang L et al.
    • Journal Title

      Cancer Science 97

      Pages: 1159-1167

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] α-Tocopherol induces calnexin in renal tubular cells : Another protective mechanism against free radical-induced cellular damage2006

    • Author(s)
      Lee WH et al.
    • Journal Title

      Archives of Biochemistry and Biophysics 453

      Pages: 168-178

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] A novel screening method for ultraviolet protection : combination of a human skin-equivalent model and 8-hydroxy-2ュ-deoxyguanosine2006

    • Author(s)
      Toyokuni S et al.
    • Journal Title

      Pathology International 56

      Pages: 760-762

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Presentation] Chronic oxidative stress as a cause of genomic amplification.2008

    • Author(s)
      Toyokuni S
    • Organizer
      Keystone Symposia: Cancer Genomics and epigenomics
    • Place of Presentation
      Taos, New Mexico, USA
    • Related Report
      2007 Annual Research Report

URL: 

Published: 2006-04-01   Modified: 2018-03-28  

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