成人性T細胞白血病の遺伝因子の解明:DNA修復遺伝子の多型の遺伝解析

• Project/Area Number: 18014014
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• Allocation Type: Single-year Grants
• Review Section: Biological Sciences
• Research Institution: Kyoto University
• Principal Investigator: 松田 文彦 Kyoto University, 医学研究科, 教授 (50212220)
• Project Period (FY): 2006 – 2007
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2007)
• Budget Amount: ¥8,900,000 (Direct Cost: ¥8,900,000); Fiscal Year 2007: ¥4,500,000 (Direct Cost: ¥4,500,000); Fiscal Year 2006: ¥4,400,000 (Direct Cost: ¥4,400,000)
• Keywords: 成人性T細胞白血病 / HTLV-1 / ジェノタイピング / 一塩基多型 / 疾患感受性遺伝子 / 宿主ゲノム / HTLV-1感染 / HTLV関連脊髄症 / 相関解析

Research Abstract

HTLV-Iウイルス感染者は日本全体で100万人存在し、毎年約1,000人が成人性T細胞白血病(ATL)を発症している。一旦ATLを発症した場合その予後は1年に満たず極めて不良で、ATLに対する治療法開発はHTLV-Iが蔓延している唯一の先進国である日本の責務である。ATLは病気の発症、進行や、予後に宿主の複数の遺伝子の多型の関与が推測されてきたが、その遺伝因子は未だ不明である。そこで、詳細な臨床情報を伴うATLの患者、ウイルスキャリア非発症者のDNA検体を用いて、候補遺伝子アプローチによる疾患感受性遺伝子の同定を試み、以下に述べる結果を得た。
当研究室で同定した免疫関連遺伝子約200個に存在するSNPにHapMap計画で得られた情報を加え、1536個のタグSNPを抽出し、Goldengate法によりマーカーパネルを作成した。相関解析は段階的におこなうこととし、まず患者96人、非発症者96人でタイピングを行った。
タイピング結果をもとに個別SNPのアレル頻度で統計解析を行い、p値<0.001のマーカー5個(1.1x10-6から9.8x10-4)に加え、0.01を下回るマーカー47個に対応する遺伝子領域から網羅的に384個のマーカーを選択し、患者208検体、非発症者276検体を用いて2次スクリーニングを実施した。その結果p<0.01(p=0.003〜0.006)を示すSNPが存在する遺伝子が3個同定された。現在、有意差を示す多型を含むハプロタイプ解析を行っており、また細胞株を用いた実験を開始し、これら3個の遺伝子のATL発症における役割を解析中である。

Research Products

• [Presentation] Genomic study of HTLV-I infection in Japanese population (2007)
  • Author(s): Vasilescu, A., Saito, M., Yasunaga, J., Matsuoka, M., Yamada, R. and Matsuda, F.
  • Organizer: 日本人類遺伝学会
  • Place of Presentation: 東京都(京王プラザホテル)
  • Year and Date: 2007-09-13