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情報伝達分子システムの再構成系における1分子反応解析

Research Project

Project/Area Number 18016016
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Biological Sciences
Research InstitutionThe Institute of Physical and Chemical Research

Principal Investigator

佐甲 靖志  The Institute of Physical and Chemical Research, 佐甲細胞情報研究室, 主任研究員 (20215700)

Project Period (FY) 2006 – 2007
Project Status Completed (Fiscal Year 2007)
Budget Amount *help
¥8,200,000 (Direct Cost: ¥8,200,000)
Fiscal Year 2007: ¥4,100,000 (Direct Cost: ¥4,100,000)
Fiscal Year 2006: ¥4,100,000 (Direct Cost: ¥4,100,000)
Keywords上皮成長因子 / Ras / MAPK / 1分子計測 / セミインタクト細胞 / 過剰応答性 / 反応ゆらぎ
Research Abstract

細胞増殖に関与する細胞内反応経路EGF-Ras-MAPKシステムの再構成系等を用いて、1分子計測と数理モデル解析により、その作動原理を解明することを目標として以下の研究を行った。
EGF-Ras-MAPKシステムの応答解析:再構成系でEGFR/Grb2およびRas/RalGDS間の情報伝達反応ゆらぎを計測し、後者の時定数がより大きいことを明らかにした。この結果はシステムの過剰応答性に、MAPKカスケードとEGF-Rasシステム両者が寄与することを示唆する。生細胞における最大反応時間の細胞間ゆらぎ計測から、0.3-3nMに大きな傾きを持つ過剰応答性の存在が示唆された。反応経路の上流(Shc)・中流(Raf)と下流(ERK)は異なる閾値を持っており、過剰ノイズを下流に伝えにくくなっていると考えられる。また、反応持続時間の細胞間ゆらぎは中流が下流に比べて大きく、不活性化反応ゆらぎも下流に伝わりにくくなっていることが示唆された。
構成要素の改変によるシステムの応答特性変化の解析:EGFRのチロシン1068をフェニルアラニン置換し、再構成系でGrb2との認識反応解析をおこなった結果、野生型では見られる結合反応の多状態性は、局所的な結合部位の差異ではなく、全体的な分子構造に基づいていること、解離反応の多状態性は、EGFRとGrb2の衝突頻度に依存していることなどが明らかになった。また、Raf1の分子内相互作用(S621A)および14-3-3との相互作用部位(C168S)の変異体を作製し、1分子計測によって変異体分子の構造が実際に野生型と異なることを示した。MAPKシステムの大腸菌内再構成のため、恒常的活性化型MEK、MKP3およびERKを発現制御可能なプロモータ下流ヘクローニングした。また、反応を解析するためのシミュレータを構築した。

Report

(2 results)
  • 2007 Annual Research Report
  • 2006 Annual Research Report
  • Research Products

    (10 results)

All 2007 2006

All Journal Article (9 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Multiple-state reactions between the epidermal growth factor receptor and Grb2 as observed using single-molecule analysis.2007

    • Author(s)
      M. Morimatsu, H. Takagi, et. al.
    • Journal Title

      Proc. Natl. Acad. Sci. USA 104

      Pages: 18013-18018

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Rho small GTPase regulates the stability of individual focal adhesions: a FRET-based visualization of GDP/GTP exchange on small GTPases.2007

    • Author(s)
      T. Miyauchi, et. al.
    • Journal Title

      Biophysics 3

      Pages: 63-73

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 細胞内情報伝達分子間相互作用の1分子可視化解析2007

    • Author(s)
      佐甲靖志
    • Journal Title

      顕微鏡 42

      Pages: 166-169

    • NAID

      10020010120

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Single-molecule analysis of epidermal growth factor binding on the surface of living cells.2006

    • Author(s)
      Teramura, Y., Ichinose, J., Takagi, H., Nishida K., Yanagida, T., Sako, Y.
    • Journal Title

      EMBO J. 25

      Pages: 4215-4222

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] Synthesis of long-template DNA using enzymatic reaction for regular alignment of Au-nanoparticles.2006

    • Author(s)
      Tanaka S, Fritzsche, W., Sako, Y., Yanagida, T.
    • Journal Title

      Chem. Lett. 35

      Pages: 1290-1291

    • NAID

      10018405213

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] Imaging single molecules for systems biology.2006

    • Author(s)
      Sako, Y.
    • Journal Title

      Mol. Syst. Biol. doi:10.1038/msb4100100

      Pages: 1-6

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] 情報伝達蛋白質Ras, Raf1相互作用のダイナミクスとキネティクス2006

    • Author(s)
      日比野佳代, 佐甲靖志
    • Journal Title

      物性研究 86

      Pages: 46-51

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] 細胞内蛍光1分子可視化法(基礎編)2006

    • Author(s)
      佐甲靖志
    • Journal Title

      バイオニクス 3-6

      Pages: 72-76

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] 細胞内蛍光1分子可視化法(応用編)2006

    • Author(s)
      佐甲靖志, 日比野佳代
    • Journal Title

      バイオニクス 3-7

      Pages: 72-76

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Book] 全反射顕微鏡と1分子計測「生細胞蛍光イメージング」原口徳子、木村宏、平岡泰編2007

    • Author(s)
      佐甲靖志
    • Total Pages
      15
    • Publisher
      共立出版(分担執筆)
    • Related Report
      2007 Annual Research Report

URL: 

Published: 2006-04-01   Modified: 2018-03-28  

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