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全身性エリテマトーデスの遺伝素因における荘型インターフェロン制御系分子群の役割

Research Project

Project/Area Number 18018005
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Biological Sciences
Research InstitutionUniversity of Tsukuba

Principal Investigator

土屋 尚之  University of Tsukuba, 大学院・人間総合科学研究科, 教授 (60231437)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 本田 善一郎  東京大学, 大学院・医学系研究科, 講師 (70238814)
古川 宏  東北大学, 大学院・医学系研究科, 助教 (00372293)
伊藤 健治 (伊藤 健司)  国立国際医療センター(研究所), 地域保健研究部, 研究員 (40272554)
Project Period (FY) 2006 – 2007
Project Status Completed (Fiscal Year 2007)
Budget Amount *help
¥7,400,000 (Direct Cost: ¥7,400,000)
Fiscal Year 2007: ¥3,600,000 (Direct Cost: ¥3,600,000)
Fiscal Year 2006: ¥3,800,000 (Direct Cost: ¥3,800,000)
Keywords全身性エリテマトーデス / I型インターフェロン / STAT4 / IRF5 / HapMap / 発現解析 / インターフェロン / interferon regulatory factor 5 (IRF5) / 多型 / ハプロタイプ / 疾患感受性
Research Abstract

1.Type I interferon(IFN)pathway関連55遺伝子より選択した384tagSNPを搭載したマイクロアレイを作成し、全身性エリテマトーデス(SLE)105例、健常対照群102例の遺伝子型を決定し、関連解析を施行した。ヨーロッパ系集団において関連が報告されたSTAT4においてもっとも顕著な関連が検出され、STAT4が集団を超えたSLE関連遺伝子であることが強く示唆された。また、それ以外にも、過去に報告のない25遺伝子において、関連の可能性が示唆されるSNPが見出された。これらを有力な候補遺伝子として、今後、検体数を増やして関連を確認するとともに、高密度マッピングにより、機能的多聖部位を見出す計画である。
2.ヨーロッパ系集団においてSLEとの関連が確立しているIRF5こ関して、日本人集団における関連解析を施行し、IRF5が集団を超えたSLE感受性遺伝子であることを見出した。しかしながら、そのハプロタイプ構造は、ヨーロッパ系集団と顕著に異なり、ヨーロッパ系集団においてリスクハプロタイプを構成するexon6の10アミノ酸挿入、polyAsignal部位多型は日本人では関連が見られず、逆に、ヨーロッパ系集団には見られないintron 1のSNPに有意な関連が検出された。
3.HapMapドナーより樹立されたB細胞株のトランスクリプトームのデータベース(GENEVAR)を利用して、SNPとトランスクリプトームとの関連を解析する方法を確立した。この方法により、日本人集団においてSLEと関連するintron 1多型が、IRF5自体およびIRF5によって誘導される遺伝子群のmRNA量と有意に関連することから、機能的多型と考えられることを示した。

Report

(2 results)
  • 2007 Annual Research Report
  • 2006 Annual Research Report
  • Research Products

    (18 results)

All 2008 2007 2006 Other

All Journal Article (11 results) (of which Peer Reviewed: 6 results) Presentation (5 results) Book (1 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Association of interferon regulatory factor 5 (IRF5) polymorphisms with systemic lupus erythematosus in Japanese: Support for a crucial role of intron 1 polymorphisms.2008

    • Author(s)
      Kawasaki A, et. al.
    • Journal Title

      Arthritis Rheum 58

      Pages: 826-834

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Association of LILRA2 (ILT1, LIR7) splice site polymorphism with systemic lupus erythematosus and microscopic polyangiitis.2008

    • Author(s)
      Mamegano K, et. al.
    • Journal Title

      Genes Immun 9(印刷中)

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Role of APRIL (TNFSF13) polymorphisms in the susceptibility to systemic lupus erythematosus in Japanese.2007

    • Author(s)
      Kawasaki A, et. al.
    • Journal Title

      Rheumatology 46

      Pages: 776-782

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
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  • [Journal Article] Association of human CD22 gene polymorphism with susceptibility to limited cutaneous systemic sclerosis.2007

    • Author(s)
      Hitomi Y, et. al.
    • Journal Title

      Tissue Antigens 69

      Pages: 242-249

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Diversity of human immune system multigene families and its implication in the genetic background of rheumatic diseases.2007

    • Author(s)
      Tsuchiya N, et. al.
    • Journal Title

      Curr Med Chem 14

      Pages: 421-439

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A compass that points to lupus: Genetic studies on type I interferon pathway.2007

    • Author(s)
      Kyogoku C, et. al.
    • Journal Title

      Genes Immun 8

      Pages: 445-455

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      2007 Annual Research Report
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  • [Journal Article] Diversity of human immune system multigene families and its implication in the genetic background of rheumatic diseases.2007

    • Author(s)
      Tsuchiya N et al.
    • Journal Title

      Curr Med Chem 14

      Pages: 421-439

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  • [Journal Article] Association of human CD22 gene polymorphism with susceptibility to limited cutaneous systemic sclerosis.2007

    • Author(s)
      Hitomi Y et al.
    • Journal Title

      Tissue Antigens 69

      Pages: 242-249

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      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] Role of APRIL (TNFSF13) polymorphisms in the susceptibility to systemic lupus erythematosus in Japanese.2007

    • Author(s)
      Kawasaki A et al.
    • Journal Title

      Rheumatology (in press)

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      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] 全身性エリテマトーデス-疾患感受性遺伝子探索の最近の進歩-。2007

    • Author(s)
      土屋尚之
    • Journal Title

      リウマチ科 (印刷中)

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      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] Role of B cell inhibitory receptor polymorphisms for systemic lupus erythematosus : a negative times a negative makes a positive.2006

    • Author(s)
      Tsuchiya N et al.
    • Journal Title

      J Hum Genet 51

      Pages: 741-750

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  • [Presentation] 全身性エリテマトーデスにおけるinterferon regulatOry factor 5(IRInybl多型の関連2007

    • Author(s)
      土屋尚之ほか
    • Organizer
      2007年日本リウマチ学会総会
    • Place of Presentation
      横浜
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      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] 日本人集団におけるinterferon regUlatOry factor 5(ILIIPbl遺伝子多型と全身性エリテマトーデスの関連2007

    • Author(s)
      川崎綾ほか
    • Organizer
      2007年日本リウマチ学会総会
    • Place of Presentation
      横浜
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      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] 目本人における全身性エリテマトーデスとinterferon regulatory factor 5(IR殉との関連2007

    • Author(s)
      土屋, 尚之, ほか
    • Organizer
      日本人類遺伝学会第52回大会
    • Place of Presentation
      東京
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      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] A SNP in IRF5 intron 1 defines a protective haplotype against SLE in Japanese.2007

    • Author(s)
      Kawasaki, A, et. al.
    • Organizer
      2007 American College of Rheumatology Annual Scientific Meeting
    • Place of Presentation
      Boston
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  • [Presentation] Total number of risk alleles in four susceptibility genes as a marker for genetic risk to SLE.2007

    • Author(s)
      Tsuchiya, N, et. al.
    • Organizer
      2007 American College of Rheumatology Annual Scientific Meeting
    • Place of Presentation
      Boston
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      2007 Annual Research Report
  • [Book] 臨床ゲノム科学入門(全身性エリテマトーデスのゲノム医科学)(永井良三監修, 徳永勝士, 大木秀一, 田中紀子編(共著))2006

    • Author(s)
      土屋尚之
    • Total Pages
      14
    • Publisher
      杏林図書
    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Remarks]

    • URL

      http://www.md.tsukuba.ac.jp/community-med/publicmd/index.html

    • Related Report
      2007 Annual Research Report

URL: 

Published: 2006-04-01   Modified: 2018-03-28  

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