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膵島特異的遺伝子の発現調節軸に焦点を絞った糖尿病遺伝子の探索

Research Project

Project/Area Number 18018018
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Biological Sciences
Research InstitutionGifu University

Principal Investigator

武田 純  Gifu University, 大学院・医学系研究科, 教授 (40270855)

Project Period (FY) 2006 – 2007
Project Status Completed (Fiscal Year 2007)
Budget Amount *help
¥11,100,000 (Direct Cost: ¥11,100,000)
Fiscal Year 2007: ¥5,700,000 (Direct Cost: ¥5,700,000)
Fiscal Year 2006: ¥5,400,000 (Direct Cost: ¥5,400,000)
Keywords糖尿病 / インスリン分泌 / 食欲 / トランスクリプトーム / 遺伝子多型 / 関連解析 / 膵島 / グルココルチコイド / 生活習慣病 / 組織特異性
Research Abstract

大規模in situ hybridizationによる候補の獲得
膵島特異的機能に関連する遺伝子を網羅的に集積するためにEST in situ hybridizationを確立し,今年度までに特異性の高い発現遺伝子134個(既知43個,未知91個)を同定している。第一段階の遺伝子のうち,機能が明らかな20遺伝子(194/233エクソン)について変異スクリーニングを実施した。その結果,MODYの成因となる遺伝子変異の同定には至っていないが,181SNPを同定することができた。現在,これらのSNPと2型糖尿病の発症との関連を解析している。
インスリン分泌と食欲調節との関連についての解析
ゲノム配列を用いて特異性の高い遺伝子について,10Kb以内の予測プロモーター配列におけるGREの有無をin siloco解析した。ESTとアレイ解析で2,498個もホルモン合成分泌関連の遺伝子を選別し,さらにgene ontology解析により587個のグルココルチコイド応答遺伝子を得た。
rVISTA2.0によるGRE解析により,86個の遺伝子を獲得した。しかし,sgkのみがグルココルチコイド応答性を示した。
グルココルチコイド応答遺伝子の解析
グルココルチコイド負荷条件により検出した15遺伝子に着目し,3種類がGREを有する候補として選別された(sgk,bc16,pdk4)。プロモーター領域のGC応答配列の転写制御活性はsgkのみに認められたことから,プロモーターを介した直接制御以外のグルココルチコイド調節も生理機能において重要であることが示唆された。さらに,以前に実施されたゲノム全域にわたる感受性遺伝子座のスクリーニングにおいて,気分障害の感受性遺伝子座のマップ領域にsgkが存在したことから,同遺伝子は重要候補と考えられた。現在,SNPハプロタイプを用いた関連解析を進めている。

Report

(2 results)
  • 2007 Annual Research Report
  • 2006 Annual Research Report
  • Research Products

    (7 results)

All 2008 2007 2006

All Journal Article (7 results) (of which Peer Reviewed: 3 results)

  • [Journal Article] The ratio of leptin to adiponectin can be used as an index of insulin resistance2008

    • Author(s)
      N.Oda, et. al.
    • Journal Title

      Metabolism 57

      Pages: 268-273

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Association of TCF7L2 polymorphisms with susceptibility to type 2 diabetes in 4,087 Japanese subjects.2008

    • Author(s)
      K.Miyake, et. al.
    • Journal Title

      J Hum Genet 53

      Pages: 174-180

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Nonalcoholic fatty liver disease is a novel predictor of cardiovascular disease2007

    • Author(s)
      M.Hmaguchi, et. al.
    • Journal Title

      World J Gastroenterol. 13

      Pages: 1579-1584

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Association studies of variants in the genes involved in pancreatic β-cell function in type 2 diabetes in Japanese2006

    • Author(s)
      N.Yokoi, et al.
    • Journal Title

      Diabetes 55

      Pages: 2379-2386

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] Mutant HNF-1α and mutant HNF-1β identified in MODY3 and MODY5 downregulate DPP-IV gene expression in Caco-2 cells.2006

    • Author(s)
      N.Gu, et al.
    • Journal Title

      Biochem Biophys Res Commun 346

      Pages: 1016-1023

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] Sucrase-isomaltase gene expression is inhibited by mutant hepatocyte nuclear factor (HNF)-1α and mutant HNF-1β in Caco-2 cells.2006

    • Author(s)
      N.Gu, et al.
    • Journal Title

      J Nutr Sci Vitaminol 52

      Pages: 105-112

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] Physiologic roles of 11β-hydroxysteroid dehydrogenase type 2 in kidney.2006

    • Author(s)
      Y.Isomura, et al.
    • Journal Title

      Metabolism 55

      Pages: 1352-1357

    • Related Report
      2006 Annual Research Report

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Published: 2006-04-01   Modified: 2018-03-28  

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