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Bacteroidesの多様な表層抗原性を生み出すゲノムシステムの解明

Research Project

Project/Area Number 18018029
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Biological Sciences
Research InstitutionThe University of Tokushima

Principal Investigator

桑原 知巳  The University of Tokushima, 大学院・ヘルスパイオサイエンス研究部, 准教授 (60263810)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 中山 治之  徳島大学, 大学院・ヘルスバイオサイエンス研究部, 助教 (80294669)
Project Period (FY) 2006 – 2007
Project Status Completed (Fiscal Year 2007)
Budget Amount *help
¥7,700,000 (Direct Cost: ¥7,700,000)
Fiscal Year 2007: ¥3,900,000 (Direct Cost: ¥3,900,000)
Fiscal Year 2006: ¥3,800,000 (Direct Cost: ¥3,800,000)
KeywordsBacteroides / 表層抗原性 / DNA逆位 / Recominase / 莢膜多糖 / 外膜蛋白質 / 腸管 / 定着 / 遺伝子発現調節 / 外膜空胞 / 部位特異的組換え酵素 / ネットワーク
Research Abstract

ヒト大腸常在菌であるBacteroides fragilisのゲノム上に存在するinvertible領域のうち、Class I領域は莢膜多糖、II、III、IVおよびVI領域は外膜蛋白質の発現制御に関わっている。昨年度の研究においてClassIV領域のDNA inversionに関与するtyrosine recombinase遺伝子(BF2766)を同定し、この領域が本菌種におけるouter membrane vesicleの形成に関与することを明らかにした。本年度はClass II領域のDNA inversionを制御するrecombinase遺伝子を同定するため、候補遺伝子の破壊株を作成し、Class II領域のDNA inversionが消失する変異株を検索した。その結果、Class V領域の外膜蛋白質SusC/Dshufflon内部に存在するtyrosine recombinase遺伝子(BF0667)の変異株において、10箇所全てのClassII領域でのDNA inversionの消失もしくは逆位頻度の減少が認められた。この変異株にBF0667をプラスミドで相補するとClass II領域におけるDNA inversionが回復したことから、BF0667はグローバルにClass II領域のDNA inversionを制御するtyrosine recombinaseをコードしていると考えられた。さらにBF0667欠損変異株においては外膜蛋白質SusC/DshufflonであるClass VおよびVI領域においてもDNA inversionが消失していた。この結果、BF0667がClass II領域のみならず、他の2箇所の外膜蛋白質SusC/D sbufflonのDNA inversionをも包括的に制御しており、BF0667は配列認識特異性の低いユニークなsite-specificrecombinaseをコードしていると考えられた。さらに、BF0667の欠損変異株を野生株と1対1の菌数になるように混合後、無菌マウスに経口接種し、糞便内での残存率を比較した。その結果、BF0667欠損変異株の糞便内生菌数は野生株の約1%であり、BF0667によるこれら領域の発現制御が腸管への定着に重要な役割を果たしていると考えられる。

Report

(2 results)
  • 2007 Annual Research Report
  • 2006 Annual Research Report
  • Research Products

    (13 results)

All 2008 2007 2006

All Journal Article (8 results) (of which Peer Reviewed: 6 results) Presentation (5 results)

  • [Journal Article] High-level fluoroquinolone resistance in ophthalmic clinical isolates belonging to the species Corynebacterium macginleyi.2008

    • Author(s)
      Eguchi, H., et. al.
    • Journal Title

      J. Clin. Microbiol. 46

      Pages: 527-532

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Comparative metagenomics revealed commonly enriched gene sets in human gut microbes.2007

    • Author(s)
      Kurokawa, K., et. al.
    • Journal Title

      DNA Res. 14

      Pages: 169-181

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] An improved DNA isolation method for metagenomics analysis of the microbial flora of the human intestine.2007

    • Author(s)
      Morita, H., et. al.
    • Journal Title

      Microbes Environ. 22

      Pages: 214-222

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Modifying effects of fermented brown rice on fecal microbiota in rats.2007

    • Author(s)
      Kataoka, K., et. al.
    • Journal Title

      Anaerobe 13

      Pages: 220-227

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Inhibitory effects of fermented brown rice on induction of acute colitis by dextran sulfate sodium in rats.2007

    • Author(s)
      Kataoka, K., et. al.
    • Journal Title

      Dig. Dis. Sci. in Press

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] ヒト腸内菌叢のゲノムシークエンス.2007

    • Author(s)
      服部正平, 他
    • Journal Title

      腸内細菌学雑誌 21

      Pages: 187-197

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] RNA polymerase β-subunit gene (rpoB) sequence analysis for the identification of Bacteroides spp.2007

    • Author(s)
      Ko, K.S., et al.
    • Journal Title

      Clin. Microbiol. Infect. 13

      Pages: 48-54

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] Suppressive effect of Clostridium perfringens-produced heat-stable substance(s) on proliferation of human colon adenocarcinoma HT29 cells in culture.2006

    • Author(s)
      Arimochi, H., et al.
    • Journal Title

      Cancer Lett. 241

      Pages: 228-234

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Presentation] Bcateroides fragilisにおける包括的作動性部位特異的組換え酵素による菌体表層構造の可変性2007

    • Author(s)
      今大路治之, 他
    • Organizer
      第30回日本分子生物学会年会第80回日本生化学会大会合同大会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      2007-12-12
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      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] 眼結膜由来のコリネバクテリウムにおけるフルオロキノロン耐性2007

    • Author(s)
      桑原知巳, 他
    • Organizer
      第60回日本細菌学会中国・四国支部総会
    • Place of Presentation
      岡山
    • Year and Date
      2007-10-14
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      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] Bacteroides fragilisのsusC/D shufflonを制御するsite-specific recombinaseの同定2007

    • Author(s)
      今大路治之, 他
    • Organizer
      第60回日本細菌学会中国・四国支部総会
    • Place of Presentation
      岡山
    • Year and Date
      2007-10-14
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      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] 発酵玄米の摂取が腸内菌叢及び腸内環境におよぼす影響2007

    • Author(s)
      井形和枝, 他
    • Organizer
      第81回日本細菌学会総会
    • Place of Presentation
      京都
    • Year and Date
      2007-03-26
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] Bcateroides fragilisのsusC/D shufflonにおける多重逆位を制御する部位特異的組換え酵素の同定2007

    • Author(s)
      今大路治之, 他
    • Organizer
      第81回日本細菌学会総会
    • Place of Presentation
      京都
    • Year and Date
      2007-03-25
    • Related Report
      2007 Annual Research Report

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Published: 2006-04-01   Modified: 2018-03-28  

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