• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to previous page

ナノ開口基板を用いたシャペロニンGroELの1分子機能解析

Research Project

Project/Area Number 18031008
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Science and Engineering
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

上野 太郎  The University of Tokyo, 大学院・薬学系研究科, 助教 (80376590)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 谷井 孝至  早稲田大学, 理工学術院, 准教授 (20339708)
島本 直伸  早稲田大学, 理工学術院, 准教授 (50386629)
Project Period (FY) 2006 – 2007
Project Status Completed (Fiscal Year 2007)
Budget Amount *help
¥5,300,000 (Direct Cost: ¥5,300,000)
Fiscal Year 2007: ¥2,700,000 (Direct Cost: ¥2,700,000)
Fiscal Year 2006: ¥2,600,000 (Direct Cost: ¥2,600,000)
Keywordsシャペロニン / ナノ開口基板 / 1分子蛍光イメージング / 協同性
Research Abstract

本研究では、シャペロニンGroELの両側に2個のGroESが同時に結合したFootball型複合体(FB)の有無を明らかにし、1分子解析を通じてそのタイミングを明らかにしようとしている。今年度、蛍光共鳴エネルギー移動(FRET)を指標にすることで、蛍光分光器を用いてGroELとGroESの結合率の測定に成功し、1)FBは、反応サイクルの約40%で形成されている2)GroELへ2個目のGroESが結合できるのは、GroESが約300nM以上になったときである2)FBの形成率は、ADPにより著しく阻害される3)ATP加水分解が非常に遅い変異GroEL(D398A)はFBを形成する ことを明らかにし、従来の反応サイクルのモデルを大きく訂正する必要性を示した(Sameshima et.al.,投稿中)。さらにFBの形成過程を詳細に理解するため、昨年度開発したナノ開口基板を用いて、500nM蛍光標識GroESと4.5uM無標識GroES存在下でGroELとの結合解離反応を1分子解析した。蛍光分光器の実験結果から、大腸菌内の発現濃度と同じ約5μMのGroES存在下ではFBが形成されることが分かっている。事前の予想とは異なり、GroELとGroESの結合時間は、FBが形成されない20nM GroES存在下での1分子解析の結果と同じであった。そこで、FBが形成される様子を直接可視化するため、500nM Cy3-GroESと500nM Cy5-GroES存在下で、ナノ開口基板上に固定されたGroELへの相互作用を観察した。ほとんどの場合、両側のリングにGroESが交互に結合解離を繰り返していたが、同時にCy3-GroESとCy5-GroESが結合している状態も観察された。現在、その詳細を解析している。

Report

(2 results)
  • 2007 Annual Research Report
  • 2006 Annual Research Report
  • Research Products

    (10 results)

All 2008 2007

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (8 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Rapid Multi-reagents Exchange TIRFM Microfluidic system for a Single Biomolecular Imaging2007

    • Author(s)
      Takahiro Arakawa
    • Journal Title

      Sensor and Actuator B 128

      Pages: 218-225

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 人工ホットスポットを用いたSAM膜のラマン検出2008

    • Author(s)
      柳沢雅広
    • Organizer
      第55回応用物理学会
    • Place of Presentation
      日本大学船橋キャンパス
    • Year and Date
      2008-03-29
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] ナノ開口基板を用いたシャペロニンの1分子機能解析2007

    • Author(s)
      上野太郎
    • Organizer
      第45回日本生物物理学会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜
    • Year and Date
      2007-12-23
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] 古細菌型シャペロニンの1分子構造変化計測2007

    • Author(s)
      飯塚怜
    • Organizer
      第45回日本生物物理学会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜
    • Year and Date
      2007-12-22
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] GroELのC末端欠損変異はATP加水分解反応を遅くする2007

    • Author(s)
      鈴木深保子
    • Organizer
      第45回日本生物物理学会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜
    • Year and Date
      2007-12-21
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] ADPが対称型1:2GroEL-GroES複合体の形成を阻害する2007

    • Author(s)
      鮫島知哉
    • Organizer
      第45回日本生物物理学会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜
    • Year and Date
      2007-12-21
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] 古細菌型シャペロニンの1分子構造変化計測2007

    • Author(s)
      飯塚怜
    • Organizer
      第80回日本生化学会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜
    • Year and Date
      2007-12-13
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] ADPがGroELのtransリングへのATPの結合を阻害することにより2個目のGroESが結合できなくなる2007

    • Author(s)
      鮫島知哉
    • Organizer
      第80回日本生化学会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜
    • Year and Date
      2007-12-13
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] GroELのC末端欠損変異はATP加水分解反応を遅くする2007

    • Author(s)
      鈴木深保子
    • Organizer
      第80回日本生化学会
    • Place of Presentation
      パジフィコ横浜
    • Year and Date
      2007-12-13
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Book] ナノバイオ計測の実際(第12章担当)2007

    • Author(s)
      上野太郎
    • Total Pages
      13
    • Publisher
      講談社サイエンティフィク
    • Related Report
      2007 Annual Research Report

URL: 

Published: 2006-04-01   Modified: 2018-03-28  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi