• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to previous page

モルテン・グロビュール構造安定化に寄与する疎水相互作用の特異性

Research Project

Project/Area Number 18031036
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Science and Engineering
Research InstitutionSoka University

Principal Investigator

池口 雅道  Soka University, 工学部, 教授 (00192477)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 藤原 和夫  創価大学, 工学部, 講師 (90409780)
Project Period (FY) 2006 – 2007
Project Status Completed (Fiscal Year 2007)
Budget Amount *help
¥4,700,000 (Direct Cost: ¥4,700,000)
Fiscal Year 2007: ¥2,200,000 (Direct Cost: ¥2,200,000)
Fiscal Year 2006: ¥2,500,000 (Direct Cost: ¥2,500,000)
Keywordsβラクトグロブリン / ペプチド / ヘリックス / フォールディング / 部特異的変異 / 円二色性スペクトル / タンパク質 / ジスルフィド結合 / モルテン・グロビュール / 二次構造 / 疎水相互作用
Research Abstract

蛋白質のフォールディング初期に蓄積するモルテン・グロビュール(MG)構造の安定化には疎水相互作用が重要であることが知られている。その相互作用の範囲や特異性を明らかにするため、ウマβラクトグロブリン(ELG)を用いて研究を行なった。
1.MGの立体構造において埋没した芳香族側鎖の同定
MG状態において近紫外部の円二色性(CD)スペクトルを示す残基は異方的な環境にあり、疎水性のコアに埋没していると考えられる。このような残基を同定するため5個あるTyr残基を一つずつPheに置換した変異体を作製し、そのCDスペクトルを測定した。その結果、Tyr102が埋没していることが明らかとなった。
2.MGコア構造安定化に寄与する相互作用
MGコア構造の安定化にCys106-Cys119のS-S結合がいかに寄与しているかを明らかにするため、S-S結合の還元に伴うヘリックス含量の変化を調べた。S-S結合の還元に伴いヘリックス含量は著しく減少し、S-S結合がヘリックスの安定化に重要であることが示された。また、コア部分の一部に相当するペプチドを合成し、ペプチドをS-S結合で連結した場合にヘリックスが誘起されるか確認した結果、ヘリックスは誘起されなかった。これらの結果を総合して考えると、1)コア領域に存在するヘリックス問には疎水相互作用が働き、ヘリックスを安定化する、2)S-S結合相互の実効濃度を高めるため、結果的にヘリックスを安定化すると結論された。

Report

(2 results)
  • 2007 Annual Research Report
  • 2006 Annual Research Report
  • Research Products

    (21 results)

All 2008 2007 2006 Other

All Journal Article (9 results) (of which Peer Reviewed: 4 results) Presentation (10 results) Remarks (2 results)

  • [Journal Article] Helix-rich transient and equilibrium intermediates of equine β-lactoglobulin in alkaline buffer2008

    • Author(s)
      Yoshitaka Matsumura
    • Journal Title

      Biophys. Chem. 134

      Pages: 84-92

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] An alpha-helical burst in the src SH3 folding pathway2007

    • Author(s)
      Jinsong Li
    • Journal Title

      Biochemistry 46

      Pages: 5072-5082

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Chloride-ion concentration dependence of molecular dimension in the acid-denatured state of equine β-1actoglobulin2007

    • Author(s)
      Yoshiteru Yamada
    • Journal Title

      J. Appl. Crystallogr. 40

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Degradation of DNA into 5' -monodeoxyribonucleotides in the presence of Mn^<2+> ions2007

    • Author(s)
      Hidekatsu Maeda
    • Journal Title

      Biosci. Biotech. Biochem. 71

      Pages: 2670-2679

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Interactions responsible for secondary structure formation during folding of equine β-lactoglobulin2007

    • Author(s)
      Kanako Nakagawa
    • Journal Title

      J. Mol. Biol. 367

      Pages: 1205-1214

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] A alpha-helical burst in the src SH3 folding pathway2007

    • Author(s)
      Jinsong Li
    • Journal Title

      Biochemistry (印刷中)

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] Chloride-ion concentration dependence of molecular dimension in the acid-denatured state of equine β-lactoglobulin2007

    • Author(s)
      Yoshiteru Yamada
    • Journal Title

      J. Appl. Crystallogr. (印刷中)

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] Does cold water act like alcohol?2006

    • Author(s)
      Yoshiteru Yamada
    • Journal Title

      Photon Factory Activity Report 2005 23

      Pages: 57-58

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] Proline scanning mutagenesis reveals non-native fold in the molten globule state of equine β-lactoglobulin2006

    • Author(s)
      Kanako Nakagawa
    • Journal Title

      Biochemistry 45

      Pages: 15468-15473

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Presentation] Dimer formation of a disulfide-less mutant of equine β-lactoglobulin: origin of slow oxidative refolding2008

    • Author(s)
      Yoshiteru YAMADA
    • Organizer
      The 5th Open Workshop for "Chemistry of Biological Processes Created by Water and Biomolecules"
    • Place of Presentation
      奈良県新公会堂
    • Year and Date
      2008-01-25
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] Peptide models of equine beta-lactoglobulin folding core2008

    • Author(s)
      Mio YAMAMOTO
    • Organizer
      The 5th Open Workshop for "Chemistry of Biological Processes Created by Water and Biomolecules"
    • Place of Presentation
      奈良県新公会堂
    • Year and Date
      2008-01-24
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] ジスルフィド結合欠損ウマβラクトグロブリンの二量体形成2007

    • Author(s)
      山田好輝
    • Organizer
      第45回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜
    • Year and Date
      2007-12-23
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] beta-1actoglobulinにおける二量体形成の分子基盤2007

    • Author(s)
      大友秀明
    • Organizer
      第45回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜
    • Year and Date
      2007-12-23
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] ウマβラクトグロブリンの近紫外部円二色性スペクトルに対する各チロシン残基の寄与2007

    • Author(s)
      金森敬子
    • Organizer
      第45回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜
    • Year and Date
      2007-12-22
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] ジスルフィド結合により安定化されているウマβラクトグロブリンの中間体におけるヘリックス構造2007

    • Author(s)
      中川香奈子
    • Organizer
      第45回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜
    • Year and Date
      2007-12-22
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] 生物学的分子座標データベース(OLIGAMI)2007

    • Author(s)
      藤原和夫
    • Organizer
      第45回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜
    • Year and Date
      2007-12-21
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] Human Tear Lipocalinの折りたたみ初期構造に及ぼすS-S結合除去の影響2007

    • Author(s)
      塚本精一
    • Organizer
      第7回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      仙台国際センター
    • Year and Date
      2007-05-24
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] ウマβラクトグロブリンの平衡中間体で形成される非天然α-helix構造安定化に対するジスルフィド結合の寄与2007

    • Author(s)
      中川香奈子
    • Organizer
      第7回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      仙台国際センター
    • Year and Date
      2007-05-24
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] 天然条件下におけるウマβラクトグロブリンの水素・重水素交換2007

    • Author(s)
      山田好輝
    • Organizer
      第7回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      仙台国際センター
    • Year and Date
      2007-05-24
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Remarks] 研究室

    • URL

      http://protein.t.soka.ac.jp/labo/

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Remarks] 公開データベース

    • URL

      http://protein.t.soka.ac.jp/oligami/

    • Related Report
      2007 Annual Research Report

URL: 

Published: 2006-04-01   Modified: 2018-03-28  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi