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真正粘菌のネットワーク幾何と生物としての機能発現

Research Project

Project/Area Number 18047022
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Science and Engineering
Research InstitutionWaseda University

Principal Investigator

高松 敦子  Waseda University, 理工学術院, 准教授 (20322670)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 加川 友己  早稲田大学, 理工学術院, 助教 (90409649)
Project Period (FY) 2006 – 2007
Project Status Completed (Fiscal Year 2007)
Budget Amount *help
¥8,300,000 (Direct Cost: ¥8,300,000)
Fiscal Year 2007: ¥3,300,000 (Direct Cost: ¥3,300,000)
Fiscal Year 2006: ¥5,000,000 (Direct Cost: ¥5,000,000)
Keywords真正粘菌 / 複雑ネットワーク / パターン形成 / 適応 / 移動知 / パターン形歳
Research Abstract

振動しながら環境中をはい回るアメーバ様の単細胞生物、真正粘菌(Physarun polycephalum)変形体は、環境に応じてその形態を動的に変化させる。変形体の部分間は管状構造で結ばれており、その内部には原形質の流れが観察され細胞内物質や栄養分を運んでいるる。変形体の振動している各部分を振動子(あるいはノード)、ノード間を結ぶ管状構造をリンクと定義して、変形体全体をネットワークとして捉えることができる。興味深いことに、この細胞は環境の状況に応じてその形態(管状構造ネットワークの形態)と振動周期が著しく変化する。この環境依存の形態変化は一種の適応行動と見て取ることができる。
本研究では、形態の動的な変化はこの細胞にどのように利益をもたらすのかを探るために、各環境における形態の特徴の解析と振動の時空間パターンを解析した。次に、変形体の管状構造ネットワークの形態に着目し、実験結果からネットワーク・トポロジーの特徴抽出を行った。実験結果解析で明らかにされたネットワーク・トポロジーに基づき結合セルモデルによるネットワーク形態依存の同期現象について解析し、最後に、ネットワーク形成モデルの提案を行い、非常に簡単な局所ルールだけで複雑なネットワークが生成できることが示した。これらの実験・モデル解析による構成論的手法により生物のネットワーク幾何と生物機能の関係について考察を行った。今後は、これらの実験事実に基づき、要素集合系の環境依存形態変化による適応行動のアルゴリズムの抽出を目指す。

Report

(2 results)
  • 2007 Annual Research Report
  • 2006 Annual Research Report
  • Research Products

    (10 results)

All 2008 2007

All Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (5 results)

  • [Journal Article] 真正粘菌変形体における環境依存の輸送管ネットワークトポロジー解析2008

    • Author(s)
      伊藤 昌明, 高松 敦子
    • Journal Title

      第20回自律分散システム・シンポジウム資料

      Pages: 337-342

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Journal Article] 重み付き2次元ネットワーク上の結合力学系における協同現象 〜真正粘菌変形体の適応行動発現の解明にむけて〜2008

    • Author(s)
      加川 友己, 伊藤 昌明, 高松 敦子
    • Journal Title

      第20回自律分散システム・シンポジウム資料

      Pages: 353-358

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Journal Article] 生物の形と機能-真正粘菌変形体ネットワークの時空間構造から学ぶ2007

    • Author(s)
      高松敦子
    • Journal Title

      表面科学, 日本表面科学会誌 28

      Pages: 653-658

    • NAID

      10019784455

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Mobiligence in an amoeboid cell, plasmodium of Physarum polycephalum2007

    • Author(s)
      Takamatsu, A.
    • Journal Title

      Proceedings in 2nd International Symposium on Mobiligence in Awaji

      Pages: 48-51

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Journal Article] Network geometry analysis in plasmodial slime mold2007

    • Author(s)
      Takamatsu, A., lto, M and Kagawa, Y.
    • Journal Title

      Proceedings in 2nd lnternational Symposium on Mobiligence in Awaji

      Pages: 275-278

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 重みつき2次元ネットワーク上の結合振動子系のダイナミクス2008

    • Author(s)
      加川友己, 伊藤昌明, 高松敦子
    • Organizer
      日本物理学会第63回年次大会
    • Place of Presentation
      近畿大学
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] 2/3-allimetric scaling law in a tw-dimmensional organism2007

    • Author(s)
      Takamatsu, A. and Gomi, T.
    • Organizer
      European Conference on Complex Systems '07, Dresden
    • Place of Presentation
      Dresden, Germany
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] Synchronization in two-dimentional organism modeled with coupled maps on weighted trees2007

    • Author(s)
      Yuki Kagawa, Masateru Ito and Atsuko Takamatsu
    • Organizer
      European Conference on Complex Systems '07, Dresden
    • Place of Presentation
      Dresden, Germany
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] 真正粘菌変形体の成長に伴って形成する輸送管ネットワークの解析2007

    • Author(s)
      伊藤昌明, 高松敦子
    • Organizer
      日本物理学会第62回年次大会
    • Place of Presentation
      北海道大学
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] 重み付き2次元ネットワーク上の結合写像系における同期2007

    • Author(s)
      加川 友己, 伊藤 昌明, 高松 敦子
    • Organizer
      日本物理学会第62回年次大会
    • Place of Presentation
      北海道大学
    • Related Report
      2007 Annual Research Report

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Published: 2006-04-01   Modified: 2018-03-28  

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