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DNA複製反応の1分子蛍光観察と形態制御技術の開発

Research Project

Project/Area Number 18048025
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Science and Engineering
Research InstitutionToyohashi University of Technology

Principal Investigator

水野 彰  Toyohashi University of Technology, 工学部, 教授 (20144199)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 桂 進司  群馬大学, 工学部, 教授 (10260598)
高島 和則  豊橋技術科学大学, 工学部, 准教授 (60303707)
Project Period (FY) 2006 – 2007
Project Status Completed (Fiscal Year 2007)
Budget Amount *help
¥11,900,000 (Direct Cost: ¥11,900,000)
Fiscal Year 2007: ¥6,100,000 (Direct Cost: ¥6,100,000)
Fiscal Year 2006: ¥5,800,000 (Direct Cost: ¥5,800,000)
Keywords1分子観寮 / 1分子操作 / DNA代謝酵素 / 蛍光観察 / 1分子観察 / DNA合成 / マイクロマニピュレーション
Research Abstract

本研究は生化学反応が起きているその場で、しかもリアルタイムで観察できる1分子観察・1分子計測技術をDNA複製反応の解析に適用することを目的とした。18年度までにDNA合成反応の可視化で必要となる1本鎖DNAを蛍光顕微鏡視野内で調製することに成功し、DNA消化酵素exonucleaseIIIが1分子のDNAを消化していく様子を直接観察している。ここで興味深いことに、exonucleaseIIIはDNAを伸張させた状態と弛緩させた状態では消化速度が異なることが示された。そこで本年度は1分子計測に基づくDNA-タンパク質間相互作用の解析ではDNA1分子の形態を制御させながら反応を解析できる点に着目し、DNAの形態とDNA消化反応の関係について実験的に明らかにすることを試みた。その結果、DNAを伸張させた場合には弛緩させた場合と比較してDNA消化速度が2倍以上速くなることが示された。DNAの形態と酵素反応の関係は非常に興味深く、1分子観察技術の利点を生かした研究であるといえる。加えてDNA-タンパク質間相互作用におけるタンパク質の詳細な挙動解析を目的としたタンパク質の蛍光標識法について検討し、DNA-タンパク質間相互作用を阻害しない蛍光標識方法を示した。その例としてDNA複製時に1本鎖DNA (ssDNA)と結合するReplication Protein A (RPA)の蛍光標識を行い、さらにssDNA-RPA複合体の1分子蛍光観察に成功した。以上の結果は、DNA複製反応をはじめとする各種DNA-タンパク質間相互作用への適用が期待され、詳細な挙動の解明に貢献できると考えられる。

Report

(2 results)
  • 2007 Annual Research Report
  • 2006 Annual Research Report
  • Research Products

    (15 results)

All 2008 2007 2006

All Journal Article (9 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Presentation (4 results) Book (2 results)

  • [Journal Article] Real-time Direct Observation of Single-molecule DNA Hydrolysis by Exonuclease III2008

    • Author(s)
      Hirofumi Kurita, Ken-ichi Inaishi, Ken Torii, Madoka Urisu, Michihiko Nakano, Shinji Katsura and Akira Mizuno
    • Journal Title

      Journal of Biomolecular Structure and Dynamics 25

      Pages: 473-480

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Inhibition of endonuclease cleavage and DNA replication of E. coliplasmid by the antitumor rhodium (II) complex2007

    • Author(s)
      Md Masudur Rahman, Hachiro Yasuda, Shinji Katsura and Mizuno, Akira
    • Journal Title

      Archives of Biochemistry and Biophysics 464

      Pages: 28-35

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Covalent binding and conformational change of pUC19 DNA by rhodium (II) metal complex2007

    • Author(s)
      Md Masudur Rahman, Hachiro Yasuda, Shinji Katsura and Mizuno, Akira
    • Journal Title

      Journal of Biomolecular Structure and Dynamics 24

      Pages: 553-560

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Development of Opto-electrostatic Micro-Pump using a Focused Laser in a High-Frequency Electric Field2007

    • Author(s)
      M.Nakano, K.Takashima, G.Touchard, S.Katsura, A.Mizuno
    • Journal Title

      IEEE Transactions on Industry Applications 43・1

      Pages: 232-237

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] DNAの1分子操作と計測2007

    • Author(s)
      水野彰
    • Journal Title

      ベイオニクス(オーム社) Vol.27, No2

      Pages: 42-47

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] Stretching of long DNA molecules in the mircovortex induced by laser and ac electric field2006

    • Author(s)
      M.Nakano, H.Kurita, J.Komatsu, A.Mizuno, S.Katsura
    • Journal Title

      Applied Physics Letters 89

      Pages: 133901-133901

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] Properties of droplet formation made by cone jet using a novel capillary with an external electrode2006

    • Author(s)
      O.Yogi, T.Kawakami, A.Mizuno
    • Journal Title

      Journal of Electrostatics 64

      Pages: 634-638

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] Real-time direct observation of single-molecule DNA hydrolysis by exonucleaseIII2006

    • Author(s)
      Hirofumi Kurita, Ken-ichi Inaishi, Ken Torii, Madoka Urisu, Michihiko Nakano, Shinji Katsura, Akira Mizuno
    • Journal Title

      2006 International Symposium on Micro-NanoMechatronics and Human Science (MHS2006)

      Pages: 401-406

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      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] 静電気を利用したエマルションの形成とその利用2006

    • Author(s)
      中野道彦, 水野彰
    • Journal Title

      静電気学会誌 Vol.30, No.6

      Pages: 264-269

    • NAID

      10018454848

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Presentation] DNAの形態がエキソヌクレアーゼIIIによるDNA消化反応に影響を及ぼす2007

    • Author(s)
      栗田 弘史、鳥居 健、安田 八郎、高島 和則、桂 進司、水野 彰
    • Organizer
      BMB2007(第30回日本分子生物学会・第80回日本生化学会大会 合同大会)
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜
    • Year and Date
      2007-12-14
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      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] lambda exonucleaseによるDNA消化反応の1分子動態解析2007

    • Author(s)
      鳥居 健, 栗田 弘史, 酒井 克幸, 安田 八郎、高島 和則、桂 進司, 水野 彰
    • Organizer
      BMB2007(第30回日本分子生物学会・第80回日本生化学会大会 合同大会)
    • Place of Presentation
      パシフイコ横浜
    • Year and Date
      2007-12-14
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] Binding effect of the antitumor active dirhodium (II) compounds to plasmid DNA2007

    • Author(s)
      Md. Masudur Rahman, Hachiro Yasuda, Kazunori Takashima and Akira Mizuno
    • Organizer
      The Fifth International Symposium on Nucleic Acids Chemistry
    • Place of Presentation
      東京大学
    • Year and Date
      2007-11-21
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] Single-molecule Observation of DNA Hydrolysis by Exonuclease III; Effect of Physical Form of DNA on Exonuclease Reaction2007

    • Author(s)
      Hirofumi Kurita, Ken Torii, Hachiro Yasuda, Kazunori Takashima, Shinji Katsura and Akira Mizuno
    • Organizer
      2007 International Symposium on Micro-NanoMechatronics and Human Science
    • Place of Presentation
      名古屋大学
    • Year and Date
      2007-11-12
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Book] ナノテクノロジー入門シリーズI,ナノテクのためのバイオ入門(共立出版)2007

    • Author(s)
      水野彰, 桂進司, 小松旬
    • Total Pages
      19
    • Publisher
      DNAの構造と機能
    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Book] 酵素開発・利用の最新技術,バイオテクノロジーシリーズ(シーエムシー出版)2006

    • Author(s)
      中野道彦, 水野彰
    • Total Pages
      9
    • Publisher
      Water-in Oilエマルションを用いた微小反応系の構築
    • Related Report
      2006 Annual Research Report

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Published: 2006-04-01   Modified: 2018-03-28  

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