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球状ウイルスにおける粒子の多様性発現機構と粒子形成の階層性の解明

Research Project

Project/Area Number 18054016
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Biological Sciences
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

福山 恵一  Osaka University, 大学院・理学研究科, 教授 (80032283)

Project Period (FY) 2006 – 2007
Project Status Completed (Fiscal Year 2007)
Budget Amount *help
¥5,900,000 (Direct Cost: ¥5,900,000)
Fiscal Year 2007: ¥2,900,000 (Direct Cost: ¥2,900,000)
Fiscal Year 2006: ¥3,000,000 (Direct Cost: ¥3,000,000)
Keywords球状ウイルス / 粒子形成 / X線結晶構造解析 / γ-グルタミルトランスペプチダーゼ / アシビシン / 酵素阻害 / アザセリン / タバコネクロシスウイルス / γ-グルタミルトランスペプチターゼ / γ-グルタミル酵素中間体 / プロセッシング
Research Abstract

富栄養域の海水中には高密度でウイルス粒子が浮遊している。その一部は、赤潮原因プランクトンに対して感染性を持ち、赤潮の動態・終息に重要な影響をおよぼしていることが知られている。ここで、ウイルスは感染を成立させる方向に、宿主はウイルス感染から逃れる方向にそれぞれ変異を繰り返す。本研究では、赤潮原因藻ヘテロカプサ・サーキュラリスカーマを宿主とする球状RNAウイルス(HcRNAV)の構造生物学的解析から、この粒子表面の構造と性状を明らかにする。この第一歩として、HcRNAVの幾つかの株のRNAからcDNAを調製した。
Y-グルタミルトランスペプチターゼ(GGT)はバクテリアから哺乳類まで幅広い生物が持つ酵素であり、グルタチオン(GSH)などのY-グルタミル基を他のアミノ酸やペプチドに転移する反応とy-グルタミル基の加水分解反応を触媒する。これまでに大腸菌由来GGTについて、この酵素の立体構造だけでなく、基質認識や触媒機構、プロセッシングによる成熟化機構を明らかにした。本年度は、2種類の阻害剤(アシビシンとアザセリン)の各々によるGGTの阻害機構を解析した。これら2種類の複合体の1.65Å分解能結晶構造から、両阻害剤ともGGTの活性残基Thr391と共有結合し、注目すべきことに四面体中間体で酵素に捉えられていることを明らかにした。さらにアシビシンでは、単にこれが酵素に結合したのではなく、アシビシン内で結合の再配置が起っていた。

Report

(2 results)
  • 2007 Annual Research Report
  • 2006 Annual Research Report
  • Research Products

    (6 results)

All 2007 2006

All Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (1 results)

  • [Journal Article] Alternative cyanide-binding modes to the haem iron in haem oxygenase2007

    • Author(s)
      M., Sugishima
    • Journal Title

      Acta Crystallographica F63

      Pages: 471-474

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Characterization and Crystallization of an IscU-type Scaffold Protein with Bound [2Fe-2S] Cluster from the Hyperthermophile,Aquifex aeolicus2007

    • Author(s)
      Y., Shimomura
    • Journal Title

      Journal of Biochemistry 142

      Pages: 577-586

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Crystal Structure of the γ-Glutamyltranspeptidase Precursor Protein from Escherichia coli2007

    • Author(s)
      T.Okada, H.Suzuki, K.Wada, H.Kumagai, K.Fukuyama
    • Journal Title

      Journal of Biological Chemistry 282・4

      Pages: 2433-2439

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] X-ray Crystallographic and Biochemical Characterization of the Inhibitory Action of an Imidazole-Dioxolane Compound on Heme Oxygenase2007

    • Author(s)
      M.Sugishima, Y.Higashimoto, T.Oishi, H.Takahashi, H.Sakamoto, M.Noguchi, K.Fukuyama
    • Journal Title

      Biochemistry 46・7

      Pages: 1860-1867

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] Crystal structures of γ-glutamyltranspeptidase from E. coli, a key enzyme in glutathione metabolism, and its reaction intermediate2006

    • Author(s)
      T.Okada, H.Suzuki, K.Wada, H.Kumagai, K.Fukuyama
    • Journal Title

      Proceedings of the National Academy of Sciences of USA 103・17

      Pages: 6471-6476

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Presentation] Crystal Structures of γ-glutamyltranspeptidase in complexes with inhibitors and an analog mimicking the transition state2007

    • Author(s)
      K., Wada
    • Organizer
      The 2nd International Symposium on Diffraction Structure Biology 2007
    • Place of Presentation
      Tower Hall Funabori, Tokyo
    • Year and Date
      2007-09-11
    • Related Report
      2007 Annual Research Report

URL: 

Published: 2006-04-01   Modified: 2018-03-28  

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